gitextract_36het1nj/

├── .gitignore
├── Dockerfile
├── LICENSE.md
├── MANIFEST.in
├── README.md
├── __init__.py
├── blobtools
├── data/
│   └── __init__.py
├── example/
│   ├── blast.out
│   ├── blobDB.json
│   ├── blobDB.table.txt
│   ├── catcolour.txt
│   ├── colours.txt
│   ├── diamond.out
│   ├── mapping_1.bam
│   ├── mapping_1.sorted.bam
│   ├── mapping_1.sorted.bam.bai
│   ├── mapping_2.bam
│   ├── mapping_2.sorted.bam
│   ├── mapping_2.sorted.bam.bai
│   └── refcov.txt
├── lib/
│   ├── BtCore.py
│   ├── BtIO.py
│   ├── BtLog.py
│   ├── BtPlot.py
│   ├── BtTax.py
│   ├── __init__.py
│   ├── bamfilter.py
│   ├── blobplot.py
│   ├── covplot.py
│   ├── create.py
│   ├── interface.py
│   ├── map2cov.py
│   ├── nodesdb.py
│   ├── seqfilter.py
│   ├── taxify.py
│   └── view.py
├── requirements.txt
├── setup.cfg
├── setup.py
└── test/
    └── meta.json