gitextract_121q3_c8/

├── .Rbuildignore
├── .dev/
│   ├── cnetplot_comparecluster_design.md
│   └── manhattan_plot_plan.md
├── .gitignore
├── CONDUCT.md
├── DESCRIPTION
├── Makefile
├── NAMESPACE
├── NEWS.md
├── R/
│   ├── 00-AllClasses.R
│   ├── AllGenerics.R
│   ├── barplot.R
│   ├── cnetplot.R
│   ├── color_utils.R
│   ├── data_utils.R
│   ├── densityplot.R
│   ├── dotplot.R
│   ├── emapplot.R
│   ├── emapplot_utilities.R
│   ├── enrichplot-package.R
│   ├── ggtable.R
│   ├── goplot.R
│   ├── gseaplot.R
│   ├── heatplot.R
│   ├── manhattanplot.R
│   ├── method-fortify.R
│   ├── method-ggplot-add.R
│   ├── method-print.r
│   ├── pairwise_termsim.R
│   ├── plot_utils.R
│   ├── pmcplot.R
│   ├── reexport.R
│   ├── ridgeplot.R
│   ├── ssplot.R
│   ├── treeplot.R
│   ├── upsetplot.R
│   ├── volplot.R
│   ├── wordcloud.R
│   └── zzz.R
├── README.Rmd
├── README.md
├── TODO.md
├── enrichplot.Rproj
├── man/
│   ├── as.data.frame.compareClusterResult.Rd
│   ├── autofacet.Rd
│   ├── barplot.enrichResult.Rd
│   ├── cnetplot.Rd
│   ├── color_palette.Rd
│   ├── dotplot.Rd
│   ├── dotplot2.Rd
│   ├── emapplot.Rd
│   ├── enrichplot-common-params.Rd
│   ├── enrichplot-package.Rd
│   ├── enrichplot-term-params.Rd
│   ├── enrichplot_point_shape.Rd
│   ├── fortify.Rd
│   ├── geom_gsea_gene.Rd
│   ├── get_enrichplot_color.Rd
│   ├── ggtable.Rd
│   ├── goplot.Rd
│   ├── gsInfo.Rd
│   ├── gseadist.Rd
│   ├── gseaplot.Rd
│   ├── gseaplot2.Rd
│   ├── gsearank.Rd
│   ├── heatplot.Rd
│   ├── hplot.Rd
│   ├── manhattanplot.Rd
│   ├── pairwise_termsim.Rd
│   ├── plotting.clusterProfile.Rd
│   ├── pmcplot.Rd
│   ├── reexports.Rd
│   ├── ridgeplot.Rd
│   ├── set_enrichplot_color.Rd
│   ├── ssplot.Rd
│   ├── treeplot.Rd
│   ├── upsetplot-methods.Rd
│   └── volplot.Rd
└── vignettes/
    └── enrichplot.qmd