gitextract_ajxyoq0h/ ├── .all-contributorsrc ├── .github/ │ └── workflows/ │ └── deploy_book.yml ├── .gitignore ├── LICENSE ├── Makefile ├── README.md ├── interactiveTreeVisualization/ │ └── epilepsyClassification2017/ │ ├── tree.html │ ├── treeData.js │ ├── treeFunctions.js │ └── treeStyle.css ├── matlabCode/ │ ├── anat/ │ │ ├── createBIDS_T1w_json_full.m │ │ ├── createBIDS_T1w_json_full_schma_based.m │ │ └── createBIDS_T1w_json_short.m │ ├── eeg-meg/ │ │ ├── createBIDS_meg_json_full.m │ │ ├── createBIDS_meg_json_short.m │ │ └── rename_brainvision_files.m │ ├── fmap/ │ │ └── createBIDS_fmap_json.m │ ├── func/ │ │ ├── createBIDS_bold_json_full.m │ │ └── createBIDS_bold_json_short.m │ ├── general/ │ │ ├── README.md │ │ ├── bids_spreadsheet2participants.m │ │ ├── createBIDS_dataset_description_json.m │ │ ├── createBIDS_events_tsv_json_full.m │ │ ├── createBIDS_participants_tsv.m │ │ ├── createBIDS_samples_tsv.m │ │ ├── input/ │ │ │ └── spreadsheet_to_convert.xlsx │ │ └── tests/ │ │ ├── data/ │ │ │ ├── participants.json │ │ │ └── participants.tsv │ │ └── test_bids_spreadsheet2participants.m │ ├── ieeg/ │ │ ├── createBIDS_channels_tsv.m │ │ ├── createBIDS_coordsystem_json.m │ │ ├── createBIDS_data_WriteBrainVisionWithFieldtrip.m │ │ ├── createBIDS_electrodes_tsv.m │ │ └── createBIDS_ieeg_json.m │ ├── micr/ │ │ ├── createBIDS_micr_json_full.m │ │ └── createBIDS_micr_json_short.m │ ├── miss_hit.cfg │ └── pet/ │ ├── createBIDS_blood_auto_tsv_and_json_short.m │ ├── createBIDS_blood_manual_tsv_and_json_full.m │ ├── createBIDS_blood_manual_tsv_and_json_short.m │ ├── createBIDS_pet_json_full.m │ └── createBIDS_pet_json_short.m ├── pythonCode/ │ ├── createBIDS_MP2RAGE_json.py │ └── createBIDS_dataset_description_json.py ├── reports/ │ └── Google-2018-report.md ├── src/ │ ├── CONTRIBUTING.md │ ├── _config.yml │ ├── _toc.yml │ ├── epilepsy_phenotype.rst │ ├── index.md │ ├── references.bib │ └── tree.html └── templates/ ├── participants.json ├── participants.tsv ├── phenotype/ │ ├── EpilepsyClassification.tsv │ └── EpilepsyClassification2017.json ├── samples.json ├── samples.tsv ├── sub-01/ │ └── ses-01/ │ ├── anat/ │ │ ├── sub-01_ses-01_acq-FullExample_run-01_T1w.json │ │ └── sub-01_ses-01_acq-ShortExample_run-01_T1w.json │ ├── eeg/ │ │ ├── sub-01_ses-01_task-FilterExample_eeg.json │ │ ├── sub-01_ses-01_task-FullExample_eeg.json │ │ ├── sub-01_ses-01_task-MinimalExample_eeg.json │ │ └── sub-01_ses-01_task-ReferenceExample_eeg.json │ ├── fmap/ │ │ ├── sub-01_ses-01_acq-Case1_run-01_phasediff.json │ │ ├── sub-01_ses-01_acq-Case2_run-01_phase1.json │ │ ├── sub-01_ses-01_acq-Case2_run-01_phase2.json │ │ ├── sub-01_ses-01_acq-Case3_run-01_fieldmap.json │ │ └── sub-01_ses-01_acq-Case4_dir-LR_run-01_epi.json │ ├── func/ │ │ ├── sub-01_ses-01_task-FullExample_run-01_bold.json │ │ ├── sub-01_ses-01_task-FullExample_run-01_events.json │ │ ├── sub-01_ses-01_task-FullExample_run-01_events.tsv │ │ └── sub-01_ses-01_task-ShortExample_run-01_bold.json │ ├── ieeg/ │ │ ├── sub-01_ses-01_coordsystem.json │ │ ├── sub-01_ses-01_electrodes.tsv │ │ ├── sub-01_ses-01_task-LongExample_run-01_channels.tsv │ │ └── sub-01_ses-01_task-LongExample_run-01_ieeg.json │ ├── meg/ │ │ ├── sub-01_ses-01_task-FullExample_acq-CTF_run-1_proc-sss_meg.json │ │ └── sub-01_ses-01_task-ShortExample_acq-CTF_run-1_proc-sss_meg.json │ ├── micr/ │ │ ├── sub-01_ses-01_sample-01_acq-Full_stain-03_chunk-01_SEM.json │ │ └── sub-01_ses-01_sample-01_acq-Short_stain-03_chunk-01_SEM.json │ └── pet/ │ ├── sub-01_ses-01_recording-AutosamplerShortExample_blood.json │ ├── sub-01_ses-01_recording-AutosamplerShortExample_blood.tsv │ ├── sub-01_ses-01_recording-ManualFullExample_blood.json │ ├── sub-01_ses-01_recording-ManualFullExample_blood.tsv │ ├── sub-01_ses-01_recording-ManualShortExample_blood.json │ ├── sub-01_ses-01_recording-ManualShortExample_blood.tsv │ ├── sub-01_ses-01_task-FullExample_pet.json │ └── sub-01_ses-01_task-ShortExample_pet.json └── sub-epilepsy01/ └── ses-01/ └── ieeg/ ├── sub-epilepsy01_ses-01_electrodes.json └── sub-epilepsy01_ses-01_electrodes.tsv