gitextract_3n5h5hp9/

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├── cnveval/
│   ├── cmd/
│   │   └── cnveval/
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│   └── cnveval.go
├── covstats/
│   ├── README.md
│   └── covstats.go
├── dcnv/
│   ├── dcnv.go
│   ├── debiaser/
│   │   ├── debiaser.go
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│       ├── scalers.go
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│   ├── depth.go
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│       ├── cmp.py
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│       ├── fake.fa.fai
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│       ├── hg19.fa.fai
│       ├── hla.bam
│       ├── hla.bam.bai
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│       ├── t-empty.bam.bai
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│       └── t.bam.bai
├── depthwed/
│   └── depthwed.go
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│   ├── index.html
│   └── indexcov/
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│       └── index.html
├── emdepth/
│   ├── README.md
│   ├── emdepth.go
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│   ├── mops/
│   │   ├── mops.go
│   │   └── mops_test.go
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├── indexcov/
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│   ├── functional-tests.sh
│   ├── indexcov.go
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│   │   ├── cmp.sh
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│   │   ├── plot-simons-sex.py
│   │   └── scripts/
│   │       ├── cmp.py
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│   ├── plot.go
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│   │   ├── sample_issue_27_0001.bam.bai
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├── indexsplit/
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└── samplename/
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