gitextract_avjheom_/ ├── .github/ │ └── workflows/ │ └── ci.yml ├── .gitignore ├── CHANGELOG.txt ├── CODEOWNERS ├── CONTRIBUTING.md ├── LICENSE ├── README.md ├── docs/ │ ├── .buildinfo │ ├── .nojekyll │ ├── _sources/ │ │ ├── api.rst.txt │ │ ├── contributing.rst.txt │ │ ├── examples.rst.txt │ │ ├── index.rst.txt │ │ ├── installation.rst.txt │ │ └── quick.rst.txt │ ├── _static/ │ │ ├── basic.css │ │ ├── css/ │ │ │ ├── badge_only.css │ │ │ └── theme.css │ │ ├── doctools.js │ │ ├── documentation_options.js │ │ ├── jquery-3.5.1.js │ │ ├── jquery.js │ │ ├── js/ │ │ │ ├── badge_only.js │ │ │ └── theme.js │ │ ├── language_data.js │ │ ├── pygments.css │ │ ├── searchtools.js │ │ ├── underscore-1.13.1.js │ │ └── underscore.js │ ├── api.html │ ├── contributing.html │ ├── examples.html │ ├── genindex.html │ ├── index.html │ ├── installation.html │ ├── objects.inv │ ├── py-modindex.html │ ├── quick.html │ ├── search.html │ └── searchindex.js ├── docsrc/ │ ├── Makefile │ ├── api.rst │ ├── conf.py │ ├── contributing.rst │ ├── examples.rst │ ├── index.rst │ ├── installation.rst │ ├── make.bat │ ├── quick.rst │ └── requirements.txt ├── mab2rec/ │ ├── __init__.py │ ├── _version.py │ ├── pipeline.py │ ├── rec.py │ ├── utils.py │ └── visualization.py ├── requirements.txt ├── scripts/ │ └── data_prep/ │ ├── concat_files.sh │ ├── concat_first_two_columns.sh │ ├── insert_header.sh │ ├── remove_columns.sh │ ├── remove_duplicate_lines.sh │ ├── remove_empty_lines.sh │ ├── remove_header.sh │ ├── rename_header.sh │ └── sort_except_header.sh ├── setup.py └── tests/ ├── __init__.py ├── run_all.py ├── test_base.py ├── test_invalid.py ├── test_pipeline.py ├── test_rec.py └── test_visualization.py