gitextract_u1u_requ/

├── .Rbuildignore
├── .gitattributes
├── .github/
│   ├── .gitignore
│   └── workflows/
│       ├── R-CMD-check.yaml
│       └── test-coverage.yaml
├── .gitignore
├── .travis.yml
├── CRAN-SUBMISSION
├── DESCRIPTION
├── NAMESPACE
├── NEWS
├── R/
│   ├── data.tree-package.R
│   ├── data_doc.R
│   ├── node.R
│   ├── node_actives.R
│   ├── node_conversion.R
│   ├── node_conversion_ape.R
│   ├── node_conversion_dataframe.R
│   ├── node_conversion_dendrogram.R
│   ├── node_conversion_igraph.R
│   ├── node_conversion_list.R
│   ├── node_conversion_party.R
│   ├── node_conversion_rpart.R
│   ├── node_methods.R
│   ├── node_methods_sideeffect.R
│   ├── node_methods_traversal.R
│   ├── node_plot.R
│   ├── register-s3.R
│   ├── release.R
│   ├── util.R
│   └── zzz.R
├── README.md
├── appveyor.yml
├── cran-comments.md
├── data/
│   ├── acme.rda
│   └── mushroom.rda
├── data.tree.Rproj
├── data_gen/
│   ├── acme.R
│   └── mushroom.R
├── getting-started-with-development.md
├── inst/
│   └── extdata/
│       ├── flare.json
│       ├── jennylind.yaml
│       ├── portfolio.csv
│       └── useR15.csv
├── man/
│   ├── Aggregate.Rd
│   ├── AreNamesUnique.Rd
│   ├── CheckNameReservedWord.Rd
│   ├── Climb.Rd
│   ├── Clone.Rd
│   ├── CreateRandomTree.Rd
│   ├── CreateRegularTree.Rd
│   ├── Cumulate.Rd
│   ├── DefaultPlotHeight.Rd
│   ├── Distance.Rd
│   ├── Do.Rd
│   ├── FindNode.Rd
│   ├── FormatFixedDecimal.Rd
│   ├── FormatPercent.Rd
│   ├── Get.Rd
│   ├── GetAttribute.Rd
│   ├── GetPhyloNr.Rd
│   ├── NODE_RESERVED_NAMES_CONST.Rd
│   ├── Navigate.Rd
│   ├── Node.Rd
│   ├── Prune.Rd
│   ├── Revert.Rd
│   ├── Set.Rd
│   ├── SetFormat.Rd
│   ├── Sort.Rd
│   ├── ToDiagrammeRGraph.Rd
│   ├── ToNewick.Rd
│   ├── Traverse.Rd
│   ├── acme.Rd
│   ├── as.Node.BinaryTree.Rd
│   ├── as.Node.Rd
│   ├── as.Node.data.frame.Rd
│   ├── as.Node.dendrogram.Rd
│   ├── as.Node.list.Rd
│   ├── as.Node.party.Rd
│   ├── as.Node.phylo.Rd
│   ├── as.Node.rpart.Rd
│   ├── as.data.frame.Node.Rd
│   ├── as.dendrogram.Node.Rd
│   ├── as.igraph.Node.Rd
│   ├── as.list.Node.Rd
│   ├── as.phylo.Node.Rd
│   ├── averageBranchingFactor.Rd
│   ├── data.tree.Rd
│   ├── isLeaf.Rd
│   ├── isNotLeaf.Rd
│   ├── isNotRoot.Rd
│   ├── isRoot.Rd
│   ├── mushroom.Rd
│   ├── print.Node.Rd
│   └── s3_register.Rd
├── publish-cheat-sheet.md
├── tests/
│   ├── testthat/
│   │   ├── test-draw.R
│   │   ├── test-treeConstruction.R
│   │   ├── test-treeConversionApe.R
│   │   ├── test-treeConversionDataFrame.R
│   │   ├── test-treeConversionDendrogram.R
│   │   ├── test-treeConversionList.R
│   │   ├── test-treeConversionParty.R
│   │   ├── test-treeConversionRpart.R
│   │   ├── test-treeConversionigraph.R
│   │   ├── test-treeDocu.R
│   │   ├── test-treeMethods.R
│   │   ├── test-treeMethodsSideEffect.R
│   │   └── test-util.R
│   └── testthat.R
└── vignettes/
    ├── applications.Rmd
    ├── applications.banner.html
    ├── data.tree.Rmd
    └── intro.banner.html