gitextract_cy4q7gy0/

├── .editorconfig
├── .github/
│   └── ISSUE_TEMPLATE.md
├── .gitignore
├── .travis.yml
├── AUTHORS.rst
├── CONTRIBUTING.rst
├── HISTORY.rst
├── LICENSE
├── MANIFEST.in
├── Makefile
├── README.rst
├── add2path.sh
├── build_docs.sh
├── conda-recipe/
│   ├── build.sh
│   └── meta.yaml
├── docs/
│   ├── .gitignore
│   ├── Makefile
│   ├── _templates/
│   │   ├── layout.html
│   │   └── template_module.rst
│   ├── authors.rst
│   ├── conf.py
│   ├── contributing.rst
│   ├── environment.yml
│   ├── examples.rst
│   ├── history.rst
│   ├── index.rst
│   ├── inferno-apidoc/
│   │   ├── inferno.extensions.containers.rst
│   │   ├── inferno.extensions.criteria.rst
│   │   ├── inferno.extensions.initializers.rst
│   │   ├── inferno.extensions.layers.rst
│   │   ├── inferno.extensions.metrics.rst
│   │   ├── inferno.extensions.optimizers.rst
│   │   ├── inferno.extensions.rst
│   │   ├── inferno.io.box.rst
│   │   ├── inferno.io.core.rst
│   │   ├── inferno.io.rst
│   │   ├── inferno.io.transform.rst
│   │   ├── inferno.io.volumetric.rst
│   │   ├── inferno.rst
│   │   ├── inferno.trainers.callbacks.logging.rst
│   │   ├── inferno.trainers.callbacks.rst
│   │   ├── inferno.trainers.rst
│   │   ├── inferno.utils.rst
│   │   └── modules.rst
│   ├── installation.rst
│   ├── make.bat
│   ├── readme.rst
│   ├── refs.bib
│   ├── usage.rst
│   └── zbibliography.rst
├── examples/
│   ├── README.txt
│   ├── plot_cheap_unet.py
│   ├── plot_train_side_loss_unet.py
│   ├── plot_unet_tutorial.py
│   ├── regularized_mnist.py
│   └── trainer.py
├── inferno/
│   ├── __init__.py
│   ├── extensions/
│   │   ├── __init__.py
│   │   ├── containers/
│   │   │   ├── __init__.py
│   │   │   ├── graph.py
│   │   │   └── sequential.py
│   │   ├── criteria/
│   │   │   ├── __init__.py
│   │   │   ├── core.py
│   │   │   ├── elementwise_measures.py
│   │   │   ├── regularized.py
│   │   │   └── set_similarity_measures.py
│   │   ├── initializers/
│   │   │   ├── __init__.py
│   │   │   ├── base.py
│   │   │   └── presets.py
│   │   ├── layers/
│   │   │   ├── __init__.py
│   │   │   ├── activations.py
│   │   │   ├── convolutional.py
│   │   │   ├── convolutional_blocks.py
│   │   │   ├── device.py
│   │   │   ├── identity.py
│   │   │   ├── normalization.py
│   │   │   ├── reshape.py
│   │   │   └── sampling.py
│   │   ├── metrics/
│   │   │   ├── __init__.py
│   │   │   ├── arand.py
│   │   │   ├── base.py
│   │   │   ├── categorical.py
│   │   │   ├── cremi_score.py
│   │   │   └── voi.py
│   │   ├── models/
│   │   │   ├── __init__.py
│   │   │   ├── res_unet.py
│   │   │   └── unet.py
│   │   └── optimizers/
│   │       ├── __init__.py
│   │       ├── adam.py
│   │       ├── annealed_adam.py
│   │       └── ranger.py
│   ├── inferno.py
│   ├── io/
│   │   ├── __init__.py
│   │   ├── box/
│   │   │   ├── __init__.py
│   │   │   ├── binary_blobs.py
│   │   │   ├── camvid.py
│   │   │   ├── cifar.py
│   │   │   └── cityscapes.py
│   │   ├── core/
│   │   │   ├── __init__.py
│   │   │   ├── base.py
│   │   │   ├── concatenate.py
│   │   │   ├── data_utils.py
│   │   │   └── zip.py
│   │   ├── transform/
│   │   │   ├── __init__.py
│   │   │   ├── base.py
│   │   │   ├── generic.py
│   │   │   ├── image.py
│   │   │   └── volume.py
│   │   └── volumetric/
│   │       ├── __init__.py
│   │       ├── lazy_volume_loader.py
│   │       ├── volume.py
│   │       └── volumetric_utils.py
│   ├── trainers/
│   │   ├── __init__.py
│   │   ├── basic.py
│   │   └── callbacks/
│   │       ├── __init__.py
│   │       ├── base.py
│   │       ├── console.py
│   │       ├── essentials.py
│   │       ├── gradients.py
│   │       ├── logging/
│   │       │   ├── __init__.py
│   │       │   ├── base.py
│   │       │   └── tensorboard.py
│   │       ├── scheduling.py
│   │       ├── tqdm.py
│   │       └── tqdmstub.py
│   ├── utils/
│   │   ├── __init__.py
│   │   ├── exceptions.py
│   │   ├── io_utils.py
│   │   ├── math_utils.py
│   │   ├── model_utils.py
│   │   ├── partial_cls.py
│   │   ├── python_utils.py
│   │   ├── test_utils.py
│   │   ├── torch_utils.py
│   │   └── train_utils.py
│   └── version.py
├── readthedocs.yml
├── requirements.txt
├── requirements_dev.txt
├── setup.py
└── tests/
    ├── __init__.py
    ├── test_extensions/
    │   ├── __init__.py
    │   ├── test_containers/
    │   │   └── test_graph.py
    │   ├── test_criteria/
    │   │   ├── test_core.py
    │   │   ├── test_elementwise_measures.py
    │   │   └── test_set_similarity_measures.py
    │   ├── test_layers/
    │   │   ├── deprecated/
    │   │   │   └── building_blocks.py
    │   │   ├── test_activations.py
    │   │   ├── test_convolutional.py
    │   │   ├── test_device.py
    │   │   └── test_reshape.py
    │   ├── test_metrics/
    │   │   └── categorical.py
    │   └── test_models/
    │       ├── __init__.py
    │       ├── test_res_unet.py
    │       └── test_unet.py
    ├── test_inferno.py
    ├── test_io/
    │   ├── __init__.py
    │   ├── test_box/
    │   │   ├── __init__.py
    │   │   ├── test_camvid.py
    │   │   └── test_cityscapes.py
    │   ├── test_core/
    │   │   ├── __init__.py
    │   │   ├── test_concatenate.py
    │   │   └── test_zip.py
    │   └── test_volumetric/
    │       ├── __init__.py
    │       ├── test_lazy_volume_loader.py
    │       └── test_volume_loader.py
    ├── test_training/
    │   ├── __init__.py
    │   ├── test_basic.py
    │   └── test_callbacks/
    │       ├── __init__.py
    │       ├── test_base.py
    │       ├── test_essentials.py
    │       ├── test_logging/
    │       │   ├── __init__.py
    │       │   ├── test_base.py
    │       │   └── test_tensorboard.py
    │       └── test_scheduling.py
    └── test_utils/
        ├── __init__.py
        ├── test_model_utils.py
        ├── test_partial_cls.py
        └── test_train_utils.py