gitextract_td07sgq3/ ├── .gitattributes ├── .gitignore ├── .travis.yml ├── CHANGELOG.rst ├── CITATION.cff ├── CONTRIBUTIONS.rst ├── LICENSE.txt ├── MANIFEST.in ├── README.rst ├── devenv.nix ├── devenv.yaml ├── docs/ │ ├── Makefile │ └── source/ │ ├── _static/ │ │ ├── default.css │ │ └── logo.psd │ ├── _templates/ │ │ └── layout.html │ ├── api/ │ │ ├── climate/ │ │ │ ├── climate_data.rst │ │ │ ├── climate_network.rst │ │ │ ├── coupled_climate_network.rst │ │ │ ├── coupled_tsonis.rst │ │ │ ├── eventseries_climatenetwork.rst │ │ │ ├── havlin.rst │ │ │ ├── hilbert.rst │ │ │ ├── map_plots.rst │ │ │ ├── mutual_info.rst │ │ │ ├── partial_correlation.rst │ │ │ ├── rainfall.rst │ │ │ ├── spearman.rst │ │ │ └── tsonis.rst │ │ ├── core/ │ │ │ ├── data.rst │ │ │ ├── geo_grid.rst │ │ │ ├── geo_network.rst │ │ │ ├── grid.rst │ │ │ ├── interacting_networks.rst │ │ │ ├── netcdf_dictionary.rst │ │ │ ├── network.rst │ │ │ ├── resistive_network.rst │ │ │ └── spatial_network.rst │ │ ├── eventseries/ │ │ │ └── event_series.rst │ │ ├── funcnet/ │ │ │ ├── coupling_analysis.rst │ │ │ └── coupling_analysis_pure_python.rst │ │ ├── timeseries/ │ │ │ ├── cross_recurrence_plot.rst │ │ │ ├── inter_system_recurrence_network.rst │ │ │ ├── joint_recurrence_network.rst │ │ │ ├── joint_recurrence_plot.rst │ │ │ ├── recurrence_network.rst │ │ │ ├── recurrence_plot.rst │ │ │ ├── surrogates.rst │ │ │ └── visibility_graph.rst │ │ └── utils/ │ │ ├── mpi.rst │ │ └── navigator.rst │ ├── api_doc.rst │ ├── changelog.rst │ ├── conf.py │ ├── contact.rst │ ├── development.rst │ ├── download.rst │ ├── examples/ │ │ ├── modules/ │ │ │ ├── mpi/ │ │ │ │ ├── network_large.py │ │ │ │ ├── network_mc.py │ │ │ │ └── network_scan_no_comm.py │ │ │ └── timeseries/ │ │ │ └── recurrence_network.py │ │ └── tutorials/ │ │ ├── ClimateNetworks.ipynb │ │ ├── CoupledClimateNetworks.ipynb │ │ ├── EventSeriesAnalysis.ipynb │ │ ├── RecurrenceNetworks.ipynb │ │ └── VisibilityGraphs.ipynb │ ├── index.rst │ ├── license.rst │ ├── methods.rst │ ├── publications.rst │ ├── sitemap.rst │ └── tutorials.rst ├── pyproject.toml ├── setup.py ├── src/ │ └── pyunicorn/ │ ├── __init__.py │ ├── climate/ │ │ ├── __init__.py │ │ ├── _ext/ │ │ │ ├── __init__.py │ │ │ └── numerics.pyx │ │ ├── climate_data.py │ │ ├── climate_network.py │ │ ├── coupled_climate_network.py │ │ ├── coupled_tsonis.py │ │ ├── eventseries_climatenetwork.py │ │ ├── havlin.py │ │ ├── hilbert.py │ │ ├── map_plot.py │ │ ├── mutual_info.py │ │ ├── partial_correlation.py │ │ ├── rainfall.py │ │ ├── spearman.py │ │ └── tsonis.py │ ├── core/ │ │ ├── __init__.py │ │ ├── _ext/ │ │ │ ├── __init__.py │ │ │ ├── numerics.pyx │ │ │ ├── types.pxd │ │ │ └── types.py │ │ ├── cache.py │ │ ├── data.py │ │ ├── geo_grid.py │ │ ├── geo_network.py │ │ ├── grid.py │ │ ├── interacting_networks.py │ │ ├── netcdf_dictionary.py │ │ ├── network.py │ │ ├── resistive_network.py │ │ └── spatial_network.py │ ├── eventseries/ │ │ ├── __init__.py │ │ └── event_series.py │ ├── funcnet/ │ │ ├── __init__.py │ │ ├── _ext/ │ │ │ ├── __init__.py │ │ │ └── numerics.pyx │ │ ├── coupling_analysis.py │ │ └── coupling_analysis_pure_python.py │ ├── timeseries/ │ │ ├── __init__.py │ │ ├── _ext/ │ │ │ ├── __init__.py │ │ │ └── numerics.pyx │ │ ├── cross_recurrence_plot.py │ │ ├── inter_system_recurrence_network.py │ │ ├── joint_recurrence_network.py │ │ ├── joint_recurrence_plot.py │ │ ├── recurrence_network.py │ │ ├── recurrence_plot.py │ │ ├── surrogates.py │ │ └── visibility_graph.py │ ├── utils/ │ │ ├── __init__.py │ │ └── mpi.py │ └── version.py ├── tests/ │ ├── conftest.py │ ├── test_climate/ │ │ ├── __init__.py │ │ ├── test_climate_data.py │ │ ├── test_climate_network.py │ │ ├── test_coupled_climate_network.py │ │ ├── test_eventseries_climatenetwork.py │ │ ├── test_map_plot.py │ │ └── test_tsonis.py │ ├── test_core/ │ │ ├── ResistiveNetwork_utils.py │ │ ├── TestResistiveNetwork-circuits.py │ │ ├── TestResistiveNetwork-complexInput.py │ │ ├── TestResistiveNetwork-cython.py │ │ ├── TestResistiveNetwork-types.py │ │ ├── __init__.py │ │ ├── test_cache.py │ │ ├── test_data.py │ │ ├── test_geo_grid.py │ │ ├── test_geo_network.py │ │ ├── test_grid.py │ │ ├── test_interacting_networks.py │ │ ├── test_network.py │ │ ├── test_resistive_networks.py │ │ └── test_spatial_network.py │ ├── test_eventseries/ │ │ └── test_event_series.py │ ├── test_funcnet/ │ │ ├── test_coupling_analysis.py │ │ └── test_coupling_analysis_pure_python.py │ ├── test_generic.py │ └── test_timeseries/ │ ├── test_joint_recurrence_plot.py │ ├── test_recurrence_plot.py │ └── test_timeseries.py └── tools/ └── update-copyright