gitextract_yk4ax793/

├── .gitignore
├── .travis.yml
├── AUTHORS
├── COPYING
├── ChangeLog
├── INSTALL
├── Makefile.am
├── NEWS
├── README.md
├── TODO
├── adept/
│   ├── Array.cpp
│   ├── Makefile.am
│   ├── Minimizer.cpp
│   ├── Stack.cpp
│   ├── StackStorageOrig.cpp
│   ├── Storage.cpp
│   ├── cppblas.cpp
│   ├── cpplapack.h
│   ├── index.cpp
│   ├── inv.cpp
│   ├── jacobian.cpp
│   ├── line_search.cpp
│   ├── minimize_conjugate_gradient.cpp
│   ├── minimize_levenberg_marquardt.cpp
│   ├── minimize_limited_memory_bfgs.cpp
│   ├── settings.cpp
│   ├── solve.cpp
│   └── vector_utilities.cpp
├── benchmark/
│   ├── Makefile.am
│   ├── advection_schemes.h
│   ├── advection_schemes_AD.h
│   ├── advection_schemes_K.h
│   ├── animate.cpp
│   ├── autodiff_benchmark.cpp
│   ├── differentiator.h
│   ├── math_benchmark.cpp
│   ├── matrix_benchmark.cpp
│   └── nx.h
├── config_platform_independent.h.in
├── configure.ac
├── doc/
│   ├── COPYING
│   ├── Makefile
│   ├── README
│   ├── adept_documentation.tex
│   └── adept_reference.tex
├── include/
│   ├── Makefile.am
│   ├── Timer.h
│   ├── adept/
│   │   ├── Active.h
│   │   ├── ActiveConstReference.h
│   │   ├── ActiveReference.h
│   │   ├── Allocator.h
│   │   ├── Array.h
│   │   ├── ArrayWrapper.h
│   │   ├── BinaryOperation.h
│   │   ├── Expression.h
│   │   ├── ExpressionSize.h
│   │   ├── FixedArray.h
│   │   ├── GradientIndex.h
│   │   ├── IndexedArray.h
│   │   ├── Minimizer.h
│   │   ├── Optimizable.h
│   │   ├── Packet.h
│   │   ├── RangeIndex.h
│   │   ├── ScratchVector.h
│   │   ├── SpecialMatrix.h
│   │   ├── Stack.h
│   │   ├── StackStorage.h
│   │   ├── StackStorageOrig.h
│   │   ├── StackStorageOrigStl.h
│   │   ├── Statement.h
│   │   ├── Storage.h
│   │   ├── UnaryOperation.h
│   │   ├── array_shortcuts.h
│   │   ├── base.h
│   │   ├── contiguous_matrix.h
│   │   ├── cppblas.h
│   │   ├── eval.h
│   │   ├── exception.h
│   │   ├── interp.h
│   │   ├── inv.h
│   │   ├── matmul.h
│   │   ├── noalias.h
│   │   ├── outer_product.h
│   │   ├── quick_e.h
│   │   ├── reduce.h
│   │   ├── scalar_shortcuts.h
│   │   ├── settings.h
│   │   ├── solve.h
│   │   ├── spread.h
│   │   ├── store_transpose.h
│   │   ├── traits.h
│   │   ├── vector_utilities.h
│   │   └── where.h
│   ├── adept.h
│   ├── adept_arrays.h
│   ├── adept_fortran.h
│   ├── adept_optimize.h
│   └── create_adept_source_header
├── m4/
│   ├── adept.m4
│   ├── ax_blas.m4
│   ├── ax_lapack.m4
│   ├── ltsugar.m4
│   └── lt~obsolete.m4
├── makefile_include.in
└── test/
    ├── Makefile
    ├── README
    ├── algorithm.cpp
    ├── algorithm.h
    ├── algorithm_with_and_without_ad.h
    ├── rosenbrock_banana_function.cpp
    ├── run_tests.sh
    ├── simulate_radiances.cpp
    ├── simulate_radiances.h
    ├── state.cpp
    ├── state.h
    ├── test_adept.cpp
    ├── test_adept_with_and_without_ad.cpp
    ├── test_array_derivatives.cpp
    ├── test_array_speed.cpp
    ├── test_arrays.cpp
    ├── test_checkpoint.cpp
    ├── test_constructors.cpp
    ├── test_derivatives.cpp
    ├── test_fastexp.cpp
    ├── test_fixed_arrays.cpp
    ├── test_gsl_interface.cpp
    ├── test_interp.cpp
    ├── test_minimizer.cpp
    ├── test_misc.cpp
    ├── test_no_lib.cpp
    ├── test_packet_operations.cpp
    ├── test_radiances.cpp
    ├── test_radiances_array.cpp
    ├── test_reduce_active.cpp
    ├── test_thread_safe.cpp
    └── test_thread_safe_arrays.cpp