gitextract_vi_txbci/

├── LICENSE
├── README.md
├── data_proc/
│   ├── Create New Species Files.ipynb
│   ├── data_utils.py
│   ├── download_proc_czi_cxg.py
│   ├── gene_embeddings.py
│   ├── generate_reduced_chrom_files.py
│   └── preproc_many_dataset.py
├── eval_data.py
├── eval_single_anndata.py
├── evaluate.py
├── examples/
│   ├── Benchmark Embeddings with scIB.ipynb
│   └── Label Transfer Using Logistic Classifier.ipynb
├── model.py
├── model_files/
│   └── new_species_protein_embeddings.csv
├── requirements.txt
└── utils.py