Copy disabled (too large)
Download .txt
Showing preview only (29,390K chars total). Download the full file to get everything.
Repository: uci-cbcl/DanQ
Branch: master
Commit: 98341e0e2eeb
Files: 45
Total size: 28.0 MB
Directory structure:
gitextract_w7jltlhp/
├── DanQ-JASPAR_test.py
├── DanQ-JASPAR_train.py
├── DanQ_test.py
├── DanQ_train.py
├── JASPAR_CORE_2016_vertebrates.npy
├── LICENSE
├── README.md
├── aucs.txt
├── data/
│ ├── README.md
│ └── example.h5
├── motifs/
│ ├── DanQ-JASPAR.meme
│ ├── DanQ-JASPAR_TOMTOM/
│ │ ├── tomtom.html
│ │ ├── tomtom.txt
│ │ └── tomtom.xml
│ ├── DanQ.meme
│ ├── DanQ_TOMTOM/
│ │ ├── tomtom.html
│ │ ├── tomtom.txt
│ │ └── tomtom.xml
│ ├── DeepSEA.meme
│ └── DeepSEA_TOMTOM/
│ ├── tomtom.html
│ ├── tomtom.txt
│ └── tomtom.xml
├── variant_resources/
│ ├── GRASP/
│ │ ├── model.0
│ │ ├── model.1
│ │ ├── model.2
│ │ ├── model.3
│ │ ├── model.4
│ │ ├── model.5
│ │ ├── model.6
│ │ ├── model.7
│ │ ├── model.8
│ │ ├── model.9
│ │ └── scaler.pkl
│ └── GWAS/
│ ├── model.0
│ ├── model.1
│ ├── model.2
│ ├── model.3
│ ├── model.4
│ ├── model.5
│ ├── model.6
│ ├── model.7
│ ├── model.8
│ ├── model.9
│ └── scaler.pkl
└── weights/
└── README.md
================================================
FILE CONTENTS
================================================
================================================
FILE: DanQ-JASPAR_test.py
================================================
import sys
import numpy as np
import h5py
import scipy.io
np.random.seed(1337) # for reproducibility
from keras.preprocessing import sequence
from keras.optimizers import RMSprop
from keras.models import Sequential
from keras.layers.core import Dense, Dropout, Activation, Flatten
from keras.layers.convolutional import Convolution1D, MaxPooling1D
from keras.regularizers import l2, activity_l1
from keras.constraints import maxnorm
from keras.layers.recurrent import LSTM, GRU
from seya.layers.recurrent import Bidirectional
import theano
forward_lstm = LSTM(input_dim=1024, output_dim=512, return_sequences=True)
backward_lstm = LSTM(input_dim=1024, output_dim=512, return_sequences=True)
brnn = Bidirectional(forward=forward_lstm, backward=backward_lstm, return_sequences=True)
print 'building model'
model = Sequential()
model.add(Convolution1D(input_dim=4,
input_length=1000,
nb_filter=1024,
filter_length=30,
border_mode="valid",
activation="relu",
subsample_length=1))
model.add(MaxPooling1D(pool_length=15, stride=15))
model.add(Dropout(0.2))
model.add(brnn)
model.add(Dropout(0.5))
model.add(Flatten())
model.add(Dense(input_dim=64*1024, output_dim=925, activation="relu"))
model.add(Dense(input_dim=925, output_dim=919, activation="sigmoid"))
print 'compiling model'
model.compile(loss='binary_crossentropy', optimizer='rmsprop', class_mode="binary")
model.load_weights('data/DanQ-JASPAR_bestmodel.hdf5')
print 'loading test data'
testmat = h5py.File(sys.argv[1],'r')
x = np.transpose(testmat['testxdata'].value,axes=(0,2,1))
testmat.close()
print 'predicting on test sequences'
y = model.predict(x, verbose=1)
print "saving to " + sys.argv[2]
f = h5py.File(sys.argv[2], "w")
f.create_dataset("pred", data=y)
f.close()
================================================
FILE: DanQ-JASPAR_train.py
================================================
import numpy as np
import h5py
import scipy.io
np.random.seed(1337) # for reproducibility
from keras.preprocessing import sequence
from keras.optimizers import RMSprop
from keras.models import Sequential
from keras.layers.core import Dense, Dropout, Activation, Flatten
from keras.layers.convolutional import Convolution1D, MaxPooling1D
from keras.regularizers import l2, activity_l1
from keras.constraints import maxnorm
from keras.layers.recurrent import LSTM, GRU
from keras.callbacks import ModelCheckpoint, EarlyStopping
from seya.layers.recurrent import Bidirectional
from keras.utils.layer_utils import print_layer_shapes
print 'loading data'
trainmat = h5py.File('data/train.mat')
validmat = scipy.io.loadmat('data/valid.mat')
testmat = scipy.io.loadmat('data/test.mat')
X_train = np.transpose(np.array(trainmat['trainxdata']),axes=(2,0,1))
y_train = np.array(trainmat['traindata']).T
forward_lstm = LSTM(input_dim=1024, output_dim=512, return_sequences=True)
backward_lstm = LSTM(input_dim=1024, output_dim=512, return_sequences=True)
brnn = Bidirectional(forward=forward_lstm, backward=backward_lstm, return_sequences=True)
print 'building model'
model = Sequential()
conv_layer = Convolution1D(input_dim=4,
input_length=1000,
nb_filter=1024,
filter_length=30,
border_mode="valid",
activation="relu",
subsample_length=1)
conv_weights = conv_layer.get_weights()
JASPAR_motifs = list(np.load('JASPAR_CORE_2016_vertebrates.npy'))
reverse_motifs = [JASPAR_motifs[19][::-1,::-1], JASPAR_motifs[97][::-1,::-1], JASPAR_motifs[98][::-1,::-1], JASPAR_motifs[99][::-1,::-1], JASPAR_motifs[100][::-1,::-1], JASPAR_motifs[101][::-1,::-1]]
JASPAR_motifs = JASPAR_motifs + reverse_motifs
for i in xrange(len(JASPAR_motifs)):
m = JASPAR_motifs[i][::-1,:]
w = len(m)
#conv_weights[0][i,:,:,0] = 0
#start = (30-w)/2
start = np.random.randint(low=3, high=30-w+1-3)
conv_weights[0][i,:,start:start+w,0] = m.T - 0.25
#conv_weights[1][i] = -0.5
conv_weights[1][i] = np.random.uniform(low=-1.0,high=0.0)
conv_layer.set_weights(conv_weights)
model.add(conv_layer)
model.add(MaxPooling1D(pool_length=15, stride=15))
model.add(Dropout(0.2))
model.add(brnn)
model.add(Dropout(0.5))
model.add(Flatten())
model.add(Dense(input_dim=64*1024, output_dim=925, activation="relu"))
model.add(Dense(input_dim=925, output_dim=919, activation="sigmoid"))
print 'compiling model'
model.compile(loss='binary_crossentropy', optimizer='rmsprop', class_mode="binary")
print 'running at most 32 epochs'
checkpointer = ModelCheckpoint(filepath="DanQ-JASPAR_bestmodel.hdf5", verbose=1, save_best_only=True)
earlystopper = EarlyStopping(monitor='val_loss', patience=100, verbose=1)
model.fit(X_train, y_train, batch_size=100, nb_epoch=32, shuffle=True, show_accuracy=True, validation_data=(np.transpose(validmat['validxdata'],axes=(0,2,1)), validmat['validdata']), callbacks=[checkpointer,earlystopper])
tresults = model.evaluate(np.transpose(testmat['testxdata'],axes=(0,2,1)), testmat['testdata'],show_accuracy=True)
print tresults
================================================
FILE: DanQ_test.py
================================================
import sys
import numpy as np
import h5py
import scipy.io
np.random.seed(1337) # for reproducibility
from keras.preprocessing import sequence
from keras.optimizers import RMSprop
from keras.models import Sequential
from keras.layers.core import Dense, Dropout, Activation, Flatten
from keras.layers.convolutional import Convolution1D, MaxPooling1D
from keras.regularizers import l2, activity_l1
from keras.constraints import maxnorm
from keras.layers.recurrent import LSTM, GRU
from seya.layers.recurrent import Bidirectional
import theano
forward_lstm = LSTM(input_dim=320, output_dim=320, return_sequences=True)
backward_lstm = LSTM(input_dim=320, output_dim=320, return_sequences=True)
brnn = Bidirectional(forward=forward_lstm, backward=backward_lstm, return_sequences=True)
print 'building model'
model = Sequential()
model.add(Convolution1D(input_dim=4,
input_length=1000,
nb_filter=320,
filter_length=26,
border_mode="valid",
activation="relu",
subsample_length=1))
model.add(MaxPooling1D(pool_length=13, stride=13))
model.add(Dropout(0.2))
model.add(brnn)
model.add(Dropout(0.5))
model.add(Flatten())
model.add(Dense(input_dim=75*640, output_dim=925))
model.add(Activation('relu'))
model.add(Dense(input_dim=925, output_dim=919))
model.add(Activation('sigmoid'))
print 'compiling model'
model.compile(loss='binary_crossentropy', optimizer='rmsprop', class_mode="binary")
model.load_weights('data/DanQ_bestmodel.hdf5')
print 'loading test data'
testmat = h5py.File(sys.argv[1],'r')
x = np.transpose(testmat['testxdata'].value,axes=(0,2,1))
testmat.close()
print 'predicting on test sequences'
y = model.predict(x, verbose=1)
print "saving to " + sys.argv[2]
f = h5py.File(sys.argv[2], "w")
f.create_dataset("pred", data=y)
f.close()
================================================
FILE: DanQ_train.py
================================================
import numpy as np
import h5py
import scipy.io
np.random.seed(1337) # for reproducibility
from keras.preprocessing import sequence
from keras.optimizers import RMSprop
from keras.models import Sequential
from keras.layers.core import Dense, Dropout, Activation, Flatten
from keras.layers.convolutional import Convolution1D, MaxPooling1D
from keras.regularizers import l2, activity_l1
from keras.constraints import maxnorm
from keras.layers.recurrent import LSTM, GRU
from keras.callbacks import ModelCheckpoint, EarlyStopping
from seya.layers.recurrent import Bidirectional
from keras.utils.layer_utils import print_layer_shapes
print 'loading data'
trainmat = h5py.File('data/train.mat')
validmat = scipy.io.loadmat('data/valid.mat')
testmat = scipy.io.loadmat('data/test.mat')
X_train = np.transpose(np.array(trainmat['trainxdata']),axes=(2,0,1))
y_train = np.array(trainmat['traindata']).T
forward_lstm = LSTM(input_dim=320, output_dim=320, return_sequences=True)
backward_lstm = LSTM(input_dim=320, output_dim=320, return_sequences=True)
brnn = Bidirectional(forward=forward_lstm, backward=backward_lstm, return_sequences=True)
print 'building model'
model = Sequential()
model.add(Convolution1D(input_dim=4,
input_length=1000,
nb_filter=320,
filter_length=26,
border_mode="valid",
activation="relu",
subsample_length=1))
model.add(MaxPooling1D(pool_length=13, stride=13))
model.add(Dropout(0.2))
model.add(brnn)
model.add(Dropout(0.5))
model.add(Flatten())
model.add(Dense(input_dim=75*640, output_dim=925))
model.add(Activation('relu'))
model.add(Dense(input_dim=925, output_dim=919))
model.add(Activation('sigmoid'))
print 'compiling model'
model.compile(loss='binary_crossentropy', optimizer='rmsprop', class_mode="binary")
print 'running at most 60 epochs'
checkpointer = ModelCheckpoint(filepath="DanQ_bestmodel.hdf5", verbose=1, save_best_only=True)
earlystopper = EarlyStopping(monitor='val_loss', patience=5, verbose=1)
model.fit(X_train, y_train, batch_size=100, nb_epoch=60, shuffle=True, show_accuracy=True, validation_data=(np.transpose(validmat['validxdata'],axes=(0,2,1)), validmat['validdata']), callbacks=[checkpointer,earlystopper])
tresults = model.evaluate(np.transpose(testmat['testxdata'],axes=(0,2,1)), testmat['testdata'],show_accuracy=True)
print tresults
================================================
FILE: LICENSE
================================================
DanQ is freely available for all non-commercial applications. If you are planning on using DanQ in a commercial application, please contact Daniel Quang (dxquang@uci.edu).
================================================
FILE: README.md
================================================
README for DanQ
===============
DanQ is a hybrid convolutional and recurrent neural network model for predicting the function of DNA *de novo* from sequence.
Citing DanQ
===========
Quang, D. and Xie, X. ``DanQ: a hybrid convolutional and recurrent neural network for predicting the function of DNA sequences'', NAR, 2015.
INSTALL
=======
DanQ uses a lot of bleeding edge software packages, and very often these software packages are not backwards compatible when they are updated. Therefore, I have included the most recent version numbers of the software packages for the configuration that worked for me. For the record, I am using Ubuntu Linux 14.04 LTS with an NVIDIA Titan Z GPU.
Required
--------
* [Python] (https://www.python.org) (2.7.10). The easiest way to install Python and all of the necessary dependencies is to download and install [Anaconda] (https://www.continuum.io) (2.3.0). I listed the versions of Python and Anaconda I used, but the latest versions should be fine. If you're curious as to what packages in Anaconda are used, they are: [numpy] (http://www.numpy.org/) (1.10.1), [scipy] (http://www.scipy.org/) (0.16.0), and [h5py] (http://www.h5py.org) (2.5.0).
* [Theano] (https://github.com/Theano/Theano) (latest). At the time I wrote this, Theano 0.7.0 is already included in Anaconda. However, it is missing some crucial helper functions. You need to git clone the latest bleeding edge version since there isn't a version number for it:
```
$ git clone git://github.com/Theano/Theano.git
$ cd Theano
$ python setup.py develop
```
* [keras] (https://github.com/fchollet/keras/releases/tag/0.2.0) (0.2.0). Deep learning package that uses Theano backend. I'm in the process of upgrading to version 0.3.0 with the Tensorflow backend.
* [seya] (https://github.com/EderSantana/seya) (???). I had to modify the source code of this package a little bit. You can try getting the latest version from Github, but for your convenience I've uploaded my copy of the package. You can install it as follows:
```
$ tar zxvf DanQ_seya.tar.gz
$ cd DanQ_seya
$ python setup.py install
```
I will likely improve DanQ soon and drop the dependency on seya.
Optional
--------
* [CUDA] (https://developer.nvidia.com/cuda-toolkit-65) (6.5). Theano can use either CPU or GPU, but using a GPU is almost entirely necessary for a network and dataset this large.
* [cuDNN] (https://developer.nvidia.com/cudnn) (2). Significantly speeds up convolution operations.
USAGE
=====
You need to first download the training, validation, and testing sets from DeepSEA. You can download the datasets from [here] (http://deepsea.princeton.edu/media/code/deepsea_train_bundle.v0.9.tar.gz). After you have extracted the contents of the tar.gz file, move the 3 .mat files into the data/ folder.
If you have everything installed, you can train a model as follows:
```
$ python DanQ_train.py
```
On my system, each epoch took about 6 hours. Whenever the validation loss is reaches a new minimum at the end of a training epoch, the best weights are stored in [DanQ_bestmodel.hdf5] (https://cbcl.ics.uci.edu/public_data/DanQ/DanQ_bestmodel.hdf5). I've already uploaded the fully trained model in the hyperlink. You can see motif results, including visualizations and TOMTOM comparisons to known motifs, in the motifs/ folder. Likewise, you can also train a much larger model where about half of the motifs are initialized with JASPAR motifs:
```
$ python DanQ-JASPAR_train.py
```
Weights are saved to the fight [DanQ-JASPAR_bestmodel.hdf5] (https://cbcl.ics.uci.edu/public_data/DanQ/DanQ-JASPAR_bestmodel.hdf5) whenever the validation loss is lowered. Motif results for this model are also stored in the motifs/ folder.
For your convenience, I've posted the current ROC AUC and PR AUC statistics comparing DanQ and DanQ-JASPAR with DeepSEA.
If you do not want to train a model from scratch and just want to do predictions, I've included test scripts for both models and the file example.h5 in the data folder. This is the same hdf5 file that is generated using the example from the DeepSEA package. The test scripts here have the same input and output formats as the prediction script from DeepSEA, so you can replace the prediction step of the DeepSEA pipeline (i.e. the 2_DeepSEA.lua script) with the test scripts here:
```
$ python DanQ_test.py data/example.h5 data/example_DanQ_pred.h5
```
To-Do
=====
* Annotate genetic variation (xgboost model files are currently included, but not detailed at the moment)
* Improve DanQ architecture
================================================
FILE: aucs.txt
================================================
Cell Type TF/DNase/HistoneMark Treatment DeepSEA ROC AUC DanQ ROC AUC DanQ-JASPAR ROC AUC DeepSEA PR AUC DanQ PR AUC DanQ-JASPAR PR AUC
8988T DNase None 0.910351436 0.9132489837 0.9149074326 0.4011462495 0.4184384446 0.423433222
AoSMC DNase None 0.924485649 0.9277664657 0.9313556897 0.4396006789 0.4571908589 0.4692227377
Chorion DNase None 0.896293207 0.9002669789 0.9008547544 0.3207430835 0.3384839394 0.3367010903
CLL DNase None 0.928261659 0.9303348552 0.9328266735 0.3591878664 0.3703775688 0.377666063
Fibrobl DNase None 0.837919632 0.8407263803 0.8431350521 0.3407087383 0.3526279102 0.3572207165
FibroP DNase None 0.883256473 0.8872928853 0.8904381711 0.4207757536 0.435208343 0.4432716665
Gliobla DNase None 0.912435909 0.9166245036 0.9191443022 0.4430148522 0.4603111126 0.4673757908
GM12891 DNase None 0.929741168 0.9335075661 0.9360848499 0.4205901591 0.4420742447 0.4496632368
GM12892 DNase None 0.924307003 0.9272498358 0.929858606 0.3934597488 0.4125479171 0.4181989943
GM18507 DNase None 0.927615841 0.9311229067 0.935974931 0.4168048465 0.4391884565 0.4462546367
GM19238 DNase None 0.918760062 0.922044407 0.9266793813 0.4101522523 0.4301530102 0.4382216649
GM19239 DNase None 0.926360134 0.9294662256 0.9331195436 0.4099622592 0.4274209135 0.4351235014
GM19240 DNase None 0.89967126 0.9027631929 0.9063470529 0.3873713707 0.4020892388 0.4093786312
H9ES DNase None 0.939249589 0.9457047554 0.9489597902 0.4914499596 0.5212930441 0.5316261705
HeLa-S3 DNase IFNa4h 0.906091046 0.913567888 0.915116739 0.3954965404 0.4161457523 0.422862266
Hepatocytes DNase None 0.881975064 0.8856014479 0.8869534689 0.285556575 0.3026511231 0.3029602655
HPDE6-E6E7 DNase None 0.928321024 0.9367766145 0.9394902337 0.4249672333 0.4521506013 0.4630783669
HSMM_emb DNase None 0.932890161 0.9370780078 0.9399435792 0.4442754512 0.4616422085 0.4713937018
HTR8svn DNase None 0.924769549 0.929474889 0.9321130699 0.4173693055 0.4366931565 0.444213378
Huh-7.5 DNase None 0.901924575 0.9077060399 0.9125108613 0.3973713965 0.4176665004 0.4255680615
Huh-7 DNase None 0.917159302 0.9225321536 0.9273083034 0.4167407558 0.4414127698 0.4493165729
iPS DNase None 0.944668102 0.9486102376 0.9505350894 0.5074322867 0.5310202761 0.5377191426
Ishikawa DNase Estradiol_100nM_1hr 0.906442429 0.9157243973 0.9210888547 0.4169561361 0.4480376419 0.4561170362
Ishikawa DNase 4OHTAM_20nM_72hr 0.908234784 0.916222401 0.9215287972 0.4229101282 0.4495969719 0.4601356127
LNCaP DNase androgen 0.917926355 0.9272455128 0.9294352403 0.4195467664 0.4511531281 0.4547390149
MCF-7 DNase Hypoxia_LacAcid 0.902486893 0.9121498816 0.9141306724 0.4006126381 0.4281946272 0.4321633308
Medullo DNase None 0.864042242 0.8664238813 0.8692186275 0.3158031211 0.3271526972 0.3335229698
Melano DNase None 0.847363066 0.8506737609 0.8531173679 0.3536066271 0.3662819206 0.3742151035
Myometr DNase None 0.916022356 0.921329115 0.9236917038 0.4186415799 0.4397429048 0.4490826789
Osteobl DNase None 0.849303246 0.8538104396 0.8558780011 0.3503940085 0.363640452 0.367974622
PanIsletD DNase None 0.914119582 0.9188202336 0.922129327 0.4575887112 0.4790670974 0.4876371989
PanIslets DNase None 0.89216587 0.8965995005 0.8972274346 0.3707545946 0.3899416943 0.3931002212
pHTE DNase None 0.89254097 0.9001301656 0.9012358993 0.4235885927 0.4500610376 0.4532105877
ProgFib DNase None 0.91525081 0.9190633289 0.9221193695 0.440569619 0.4625540711 0.4698115384
RWPE1 DNase None 0.927696294 0.9366268878 0.9381576103 0.4744217367 0.5071240841 0.5153730228
Stellate DNase None 0.925775814 0.9311993312 0.9347415486 0.4495610606 0.4722418729 0.4797688522
T-47D DNase None 0.88951898 0.8981698685 0.8994533016 0.3706824833 0.3960861184 0.3984722394
Adult_CD4_Th0 DNase None 0.884814335 0.8886718065 0.8898270926 0.3711642078 0.3824629918 0.3874213075
Urothelia DNase None 0.921872672 0.9283363179 0.9301246297 0.4499384108 0.4732297245 0.4825141958
Urothelia DNase UT189 0.905203186 0.9109602229 0.9120269184 0.421861015 0.4431106386 0.4505962781
AG04449 DNase None 0.930299369 0.9350575847 0.9393851624 0.4583251466 0.4756664838 0.492027007
AG04450 DNase None 0.930558584 0.9343978016 0.9389876455 0.4540676292 0.4672055145 0.4854169388
AG09309 DNase None 0.929469519 0.9339830894 0.9387336198 0.4960453125 0.5116177462 0.5265479393
AG09319 DNase None 0.927775855 0.9315941594 0.9370959924 0.4356784676 0.4507821181 0.4680074365
AG10803 DNase None 0.935139243 0.938648384 0.9428115943 0.4907650482 0.5054729082 0.5216078913
AoAF DNase None 0.928060187 0.9314802829 0.9361771632 0.4824022784 0.4956891792 0.5112193412
BE2_C DNase None 0.913226233 0.9233588542 0.9291232266 0.455811947 0.4876840595 0.5033008295
BJ DNase None 0.926037247 0.929964594 0.9359857811 0.439970125 0.458422685 0.4769759602
Caco-2 DNase None 0.955102255 0.9602247859 0.9614734632 0.4413681283 0.4660432973 0.4649057247
CD20+ DNase None 0.91735557 0.9212656413 0.925173799 0.393695248 0.4086928574 0.4128750032
CD34+_Mobilized DNase None 0.925500268 0.9316137548 0.9342954137 0.4920058292 0.5126274191 0.5220194418
CMK DNase None 0.92867733 0.9327263993 0.9340527474 0.4316323641 0.4519660267 0.4562120553
A549 DNase None 0.889120095 0.8961514737 0.899674066 0.4454897334 0.4648586052 0.4722856292
GM12878 DNase None 0.895268982 0.9000923412 0.9039893704 0.4033559786 0.4227049343 0.4286787119
H1-hESC DNase None 0.922875567 0.9281680371 0.9320845004 0.49779014 0.522322672 0.5337150402
HeLa-S3 DNase None 0.881399822 0.8896062784 0.8926147994 0.4132262523 0.433169412 0.4406241283
HepG2 DNase None 0.919644463 0.9243361892 0.9314232083 0.4674154118 0.4849693976 0.5039334552
HMEC DNase None 0.879333841 0.8866699505 0.8892930027 0.4488188025 0.468345512 0.4755812218
HSMMtube DNase None 0.911713274 0.915105104 0.9214445217 0.5157930332 0.5322298192 0.5474761751
HSMM DNase None 0.907026954 0.9118813054 0.9185637856 0.4915252226 0.5070323764 0.5244834265
HUVEC DNase None 0.905654384 0.9102513401 0.9138200111 0.4433583007 0.4583933504 0.4645925495
K562 DNase None 0.903535042 0.9094502121 0.9121631887 0.431172313 0.4487945406 0.4592981093
LNCaP DNase None 0.875751559 0.8880409689 0.8917063906 0.415626869 0.4473678731 0.4566447054
MCF-7 DNase None 0.887666733 0.9002668401 0.9030551944 0.4126652422 0.4463330385 0.4527049928
NHEK DNase None 0.914142019 0.9228574199 0.9246491934 0.4670529474 0.4959797082 0.5046528292
Th1 DNase None 0.865216236 0.8684588339 0.8701070274 0.3582683957 0.3696926502 0.3746784214
GM06990 DNase None 0.902955171 0.9063258167 0.9130242555 0.3256947324 0.3396407621 0.3519833383
GM12864 DNase None 0.917940255 0.9204243729 0.925095715 0.4163407243 0.4328024277 0.4457865784
GM12865 DNase None 0.926324849 0.9289599657 0.9346960437 0.456179407 0.4756097643 0.4900643586
H7-hESC DNase None 0.915536905 0.9226643211 0.9298228787 0.4913154111 0.5167030823 0.539376137
HAc DNase None 0.928486887 0.9328079654 0.937698484 0.4887791631 0.5049861395 0.520887621
HAEpiC DNase None 0.92657588 0.9297668317 0.9343231185 0.4905119947 0.5048021808 0.5214322986
HA-h DNase None 0.918749237 0.923991881 0.9276141384 0.4878496534 0.5082129798 0.5199890343
HA-sp DNase None 0.867568074 0.8749524879 0.87873071 0.310400002 0.3207391676 0.3324358266
HBMEC DNase None 0.927589775 0.9319868845 0.9361333839 0.5142650844 0.5323390988 0.5480556138
HCFaa DNase None 0.925915241 0.9315122479 0.9350841462 0.4932965929 0.5148917186 0.5295825548
HCF DNase None 0.931345077 0.9349616255 0.9390792427 0.4957761091 0.5092710462 0.5242311127
HCM DNase None 0.932838333 0.9371356069 0.9407061808 0.5206724507 0.5355906307 0.5521894095
HConF DNase None 0.929426226 0.9347068355 0.9386057562 0.4828977852 0.499734756 0.5179472602
HCPEpiC DNase None 0.920136522 0.9258459751 0.9308340563 0.4972246728 0.5178157325 0.5343484289
HCT-116 DNase None 0.925107353 0.9335899209 0.9352705424 0.487741387 0.5088164919 0.5171661911
HEEpiC DNase None 0.934086436 0.9447754627 0.9471256268 0.5501446974 0.5846392344 0.595482106
HFF-Myc DNase None 0.914313099 0.9201956879 0.9257894184 0.4831847449 0.4994266911 0.5130078877
HFF DNase None 0.925130896 0.9301621514 0.9352004256 0.5030328507 0.5197016636 0.5391553887
HGF DNase None 0.927895498 0.9317619876 0.936724628 0.4366165545 0.4492686027 0.4684700227
HIPEpiC DNase None 0.92460714 0.9294246964 0.9336957742 0.5103219527 0.5271666087 0.5424149988
HL-60 DNase None 0.909168997 0.9129485029 0.9149887045 0.4204746647 0.4340526371 0.444017
HMF DNase None 0.936543989 0.9413448289 0.9447513372 0.5293976253 0.5450244821 0.5621798547
HMVEC-dAd DNase None 0.927300707 0.9326737666 0.9364159708 0.4480505862 0.4614154772 0.4754370943
HMVEC-dBl-Ad DNase None 0.933941611 0.9388509626 0.9427583102 0.4885619396 0.5059151728 0.5233092458
HMVEC-dBl-Neo DNase None 0.92490559 0.930562772 0.9342505211 0.4836133664 0.5032293685 0.5173286035
HMVEC-dLy-Ad DNase None 0.927537478 0.9313629013 0.9358374506 0.4488086578 0.4643380577 0.4813700162
HMVEC-dLy-Neo DNase None 0.93083652 0.9355593715 0.9400747401 0.4793732777 0.4969346814 0.5135492384
HMVEC-dNeo DNase None 0.930036611 0.9349825097 0.9390997339 0.4778648021 0.4937562051 0.5091008277
HMVEC-LBl DNase None 0.93031706 0.9356419811 0.9383228914 0.4961519713 0.5136469147 0.5263801319
HMVEC-LLy DNase None 0.923662478 0.9284201666 0.9330602336 0.4641897075 0.4803925778 0.4958082413
HNPCEpiC DNase None 0.929924195 0.9342630449 0.9396141153 0.5292206744 0.5480304384 0.5674828897
HPAEC DNase None 0.924899556 0.9302754947 0.9338997532 0.4289231452 0.4472183442 0.4606646028
HPAF DNase None 0.933486188 0.9384555517 0.9427790433 0.5276439725 0.5444155256 0.5607777614
HPdLF DNase None 0.926365566 0.9305285366 0.9357574552 0.4581185228 0.4725961683 0.4910629306
HPF DNase None 0.930353804 0.9351310773 0.9395551385 0.4796925815 0.4969767055 0.5131667785
HRCEpiC DNase None 0.921345216 0.9258521846 0.9347292298 0.4844251551 0.4974395493 0.5234900933
HRE DNase None 0.923646859 0.9279231557 0.9359002811 0.4947552607 0.510238699 0.5329212091
HRGEC DNase None 0.910142935 0.9163424501 0.9202733858 0.4215882342 0.4378245406 0.4501165236
HRPEpiC DNase None 0.913599259 0.9191300815 0.9259336552 0.4595513309 0.4777519566 0.4975173177
HVMF DNase None 0.911136725 0.9152762634 0.9208684464 0.4235343521 0.4341820379 0.4478887107
Jurkat DNase None 0.921549587 0.9283945269 0.9311599247 0.461961112 0.4887497806 0.4982806544
Monocytes-CD14+_RO01746 DNase None 0.936719544 0.9405712337 0.9425921619 0.4594719928 0.4780806109 0.4841864583
NB4 DNase None 0.931088121 0.9378184205 0.9395500089 0.4631584639 0.4886611319 0.4944234808
NH-A DNase None 0.931549681 0.9348478871 0.9395750535 0.4957210469 0.5082580396 0.5261228274
NHDF-Ad DNase None 0.930726524 0.9333396336 0.9384071134 0.5076571241 0.5215163136 0.5370777152
NHDF-neo DNase None 0.925687729 0.9281434031 0.9344093798 0.457985012 0.4691006908 0.4898151202
NHLF DNase None 0.933492515 0.9373677367 0.9420685281 0.5139133149 0.5301836588 0.5456361721
NT2-D1 DNase None 0.927061464 0.9339567984 0.9397247773 0.5022316402 0.5325424028 0.5533926266
PANC-1 DNase None 0.908114925 0.9153481036 0.9171018891 0.4218148461 0.4434547415 0.4485798872
PrEC DNase None 0.931840242 0.9408544089 0.94374225 0.4914536124 0.5207733928 0.535066249
RPTEC DNase None 0.911536646 0.9164168856 0.927368447 0.4438849592 0.4597563704 0.4854696645
SAEC DNase None 0.934864808 0.9448763647 0.9468589411 0.5429736301 0.5760448487 0.5860964239
SKMC DNase None 0.926250298 0.9315395097 0.9363406935 0.4925326202 0.5092616817 0.5283401824
SK-N-MC DNase None 0.883021602 0.8942838579 0.8990426737 0.3707378565 0.4057456535 0.4140711031
SK-N-SH_RA DNase None 0.939063718 0.9438625773 0.9498986815 0.3975102061 0.4261801756 0.4398179731
Th2 DNase None 0.905005703 0.9103992578 0.9111198867 0.3293858306 0.3493359431 0.3472368336
WERI-Rb-1 DNase None 0.913575694 0.9173347257 0.929592394 0.4278899283 0.4436865497 0.4726208774
WI-38 DNase 4OHTAM_20nM_72hr 0.913134552 0.9156277795 0.9198931321 0.4479663626 0.4589895682 0.4698625771
WI-38 DNase None 0.927649399 0.9326504992 0.9370454314 0.4625436502 0.4808466387 0.4957341832
Dnd41 CTCF None 0.979197733 0.9828194319 0.9834972491 0.6948477135 0.7280444211 0.7339549699
Dnd41 EZH2 None 0.944861415 0.9505153199 0.9464026022 0.0503574567 0.0529569318 0.0513925619
GM12878 CTCF None 0.97843466 0.9819842813 0.9836703868 0.6662684482 0.7017412278 0.7176266638
GM12878 EZH2 None 0.919441436 0.9336589275 0.9369153097 0.0468882058 0.0549747153 0.0515252256
H1-hESC CHD1 None 0.947187055 0.9522565082 0.953835472 0.1904373325 0.1997666885 0.2043302274
H1-hESC CTCF None 0.977368797 0.9819703963 0.984390157 0.6404027745 0.6851148825 0.7013977526
H1-hESC EZH2 None 0.981665445 0.9843253966 0.9844030627 0.3950924116 0.4474857081 0.4580646428
H1-hESC JARID1A None 0.987164153 0.9836496353 0.9846192343 0.1855753223 0.2526011211 0.2236398947
H1-hESC RBBP5 None 0.965011761 0.9689929034 0.9704391507 0.4277618879 0.4430519054 0.4380077694
HeLa-S3 CTCF None 0.964978887 0.9710963274 0.9741564603 0.6521248673 0.6899951195 0.7035668817
HeLa-S3 EZH2 None 0.810107062 0.8440234994 0.8378299628 0.0186784028 0.0293885198 0.0257197131
HeLa-S3 Pol2(b) None 0.890695267 0.9010516315 0.8982336244 0.1087885301 0.1126559393 0.1182552848
HepG2 CTCF None 0.983452523 0.9865309766 0.9882154081 0.6686938211 0.7079747423 0.7233479384
HepG2 EZH2 None 0.951716913 0.9567290054 0.9558964504 0.0610399615 0.0651476924 0.0725180439
HMEC CTCF None 0.984604211 0.9875578452 0.9888527417 0.6616691456 0.6979001129 0.7117904391
HMEC EZH2 None 0.959317412 0.9639922181 0.9647001676 0.2023753289 0.2177503769 0.2311077292
HSMM CTCF None 0.97622668 0.98088099 0.9830018163 0.62784861 0.6644898536 0.6760445272
HSMM EZH2 None 0.961192582 0.9694547711 0.9665768862 0.106623225 0.1144819085 0.1239809255
HSMMtube CTCF None 0.972644397 0.9779363134 0.9807862107 0.6377985839 0.6742370664 0.6878329335
HSMMtube EZH2 None 0.984216728 0.9854362178 0.984964653 0.1644615775 0.1947132578 0.1987579507
HUVEC CTCF None 0.982231848 0.9847767197 0.9866238512 0.6652413535 0.6970859984 0.7086061324
HUVEC EZH2 None 0.985643204 0.9871545436 0.9870954606 0.3573330741 0.4004923819 0.4098367673
HUVEC Pol2(b) None 0.923989395 0.931500822 0.9239079205 0.1687234423 0.1810987098 0.18334311
K562 CHD1 None 0.954814543 0.9589930511 0.9594348937 0.2158266721 0.2292443166 0.225249131
K562 CTCF None 0.970549293 0.9758263405 0.9778692369 0.6238341427 0.6608491882 0.6744054116
K562 EZH2 None 0.887793906 0.9233489985 0.9226019077 0.0344581093 0.0521139377 0.020309774
K562 HDAC1 None 0.965512702 0.9677822315 0.9669353428 0.3204846573 0.3432210499 0.3507928258
K562 HDAC2 None 0.952215035 0.9542979809 0.9572958376 0.1036084987 0.1158599558 0.1273267735
K562 HDAC6 None 0.980055802 0.9821017836 0.9793290012 0.0148905445 0.0535166661 0.0251497757
K562 p300 None 0.905436095 0.9141952885 0.9256002824 0.0952271705 0.1862205502 0.1640130414
K562 PHF8 None 0.98363375 0.9860795594 0.985607495 0.6930461418 0.7236060015 0.720118456
K562 PLU1 None 0.964963856 0.9693179544 0.9666295432 0.4451475662 0.4783755687 0.4724317677
K562 Pol2(b) None 0.945730788 0.9521967827 0.9527718891 0.2919024114 0.3261037125 0.3356876152
K562 RBBP5 None 0.96120623 0.9644706488 0.9659898602 0.4377177306 0.4644582196 0.4712045733
K562 SAP30 None 0.983896185 0.9852306994 0.9853598619 0.3694789309 0.39310946 0.4045027333
NH-A CTCF None 0.9802973 0.9845971005 0.9865739076 0.6580704962 0.6875824863 0.7028876098
NH-A EZH2 None 0.986685557 0.988368782 0.9882851576 0.3599478829 0.3987127271 0.4150729698
NHDF-Ad CTCF None 0.976131175 0.9804474397 0.9829092571 0.6184704078 0.6535446682 0.6695206568
NHDF-Ad EZH2 None 0.985680664 0.9875543693 0.986955128 0.3151414248 0.3337529063 0.3448397937
NHEK CTCF None 0.972821769 0.9778310698 0.9809396865 0.634254649 0.6670594032 0.6823347375
NHEK EZH2 None 0.978477202 0.9799864113 0.980734817 0.3021336967 0.3157092454 0.3330726839
NHEK Pol2(b) None 0.858047706 0.8703413276 0.8730132103 0.0886599013 0.0983012757 0.098653143
NHLF CTCF None 0.980536775 0.9839292003 0.985494076 0.6335788106 0.670823372 0.6830652013
NHLF EZH2 None 0.974710131 0.9775796968 0.9780148663 0.2605260639 0.2815290078 0.2880523893
Osteobl CTCF None 0.96530837 0.9720288862 0.974641306 0.6701567958 0.7027804547 0.7124233217
A549 ATF3 EtOH_0.02pct 0.913191801 0.9264451382 0.9302667377 0.1156891746 0.1526060859 0.1644041678
A549 BCL3 EtOH_0.02pct 0.867672168 0.885564787 0.8896445111 0.0965988712 0.1252343956 0.13488281
A549 CREB1 DEX_100nM 0.965667429 0.9707381698 0.9751988107 0.440254602 0.460590878 0.4722409415
A549 CTCF DEX_100nM 0.987773364 0.9890462208 0.989452416 0.5615943806 0.5953253649 0.6026868212
A549 CTCF EtOH_0.02pct 0.987068508 0.9890167653 0.9898131995 0.6045159522 0.6366799232 0.6486217846
A549 ELF1 EtOH_0.02pct 0.938142161 0.9430139601 0.9476777723 0.284819154 0.3125382996 0.3263152759
A549 ETS1 EtOH_0.02pct 0.94348497 0.9539543235 0.9574034223 0.2728200465 0.3286600881 0.3273683297
A549 FOSL2 EtOH_0.02pct 0.932658125 0.9388592782 0.9415868826 0.3436661118 0.3583663102 0.3678631104
A549 FOXA1 DEX_100nM 0.900893332 0.9087721073 0.9447428751 0.0546206532 0.0666712185 0.1451606436
A549 GABP EtOH_0.02pct 0.943008355 0.950767034 0.9538515123 0.3657591591 0.4093104536 0.4112527958
A549 GR DEX_500pM 0.922765243 0.9298149609 0.9495471386 0.0265567574 0.0499302535 0.0527968841
A549 GR DEX_50nM 0.863613911 0.879447292 0.9361639391 0.1399418871 0.1568244938 0.2870797628
A549 GR DEX_5nM 0.891522056 0.9035275558 0.945185153 0.112678278 0.1256717768 0.1907263731
A549 GR DEX_100nM 0.889334483 0.9071279742 0.9469760718 0.1503976556 0.1695907435 0.2528581938
A549 NRSF EtOH_0.02pct 0.904815163 0.9124184714 0.915961175 0.2423103444 0.2976020104 0.3118385927
A549 p300 EtOH_0.02pct 0.883371053 0.8945068734 0.9013679742 0.1795984696 0.2020195342 0.2141727035
A549 Pol2 DEX_100nM 0.959203153 0.9620424255 0.9623946038 0.6167099767 0.6290626753 0.6333890097
A549 Pol2 EtOH_0.02pct 0.960457188 0.9627685921 0.9631449594 0.6341176844 0.647462131 0.6498752533
A549 Sin3Ak-20 EtOH_0.02pct 0.885424571 0.8994366684 0.9034507076 0.1022110914 0.1213813776 0.1290610381
A549 SIX5 EtOH_0.02pct 0.940631616 0.9518052788 0.9570528537 0.247223069 0.3205163571 0.3281333775
A549 TAF1 EtOH_0.02pct 0.933993717 0.940490221 0.9429302203 0.3615552207 0.3900378902 0.3961077968
A549 TCF12 EtOH_0.02pct 0.881868319 0.8955252256 0.9016646363 0.2044397311 0.2329184519 0.238297591
A549 USF1 DEX_100nM 0.945060376 0.9537281917 0.9602748636 0.2417131675 0.2813411332 0.2900766955
A549 USF1 EtOH_0.02pct 0.96826118 0.9728937341 0.9766374594 0.3306685763 0.3800210921 0.3865999797
A549 USF1 EtOH_0.02pct 0.930509026 0.946998574 0.9531375752 0.2453563413 0.3077332024 0.3166876439
A549 YY1 EtOH_0.02pct 0.94125701 0.9494180942 0.9504524644 0.3178900159 0.334962954 0.3384931077
A549 ZBTB33 EtOH_0.02pct 0.91312342 0.9265630838 0.9302141958 0.1468035717 0.1915081846 0.2063157408
ECC-1 CTCF DMSO_0.02pct 0.994901971 0.9958435791 0.9959950236 0.7529076808 0.7823943699 0.7909016603
ECC-1 ERalpha BPA_100nM 0.878895275 0.8897221839 0.9184460837 0.0273335519 0.0379383794 0.0648413315
ECC-1 ERalpha Estradiol_10nM 0.854146372 0.86106586 0.8956970883 0.0740760624 0.0863007771 0.135406221
ECC-1 ERalpha Genistein_100nM 0.8639426 0.8739236752 0.9064942098 0.0647234055 0.086265127 0.1272227789
ECC-1 FOXA1 DMSO_0.02pct 0.920940703 0.931902483 0.9385456568 0.0697933009 0.0884958054 0.090638139
ECC-1 GR DEX_100nM 0.875242027 0.8963543857 0.930369757 0.0587697101 0.0700206789 0.1102768402
ECC-1 Pol2 DMSO_0.02pct 0.970602594 0.9726180948 0.9712892904 0.5920347998 0.6154780478 0.6154882772
GM12878 ATF2 None 0.908166107 0.9132904078 0.9230021295 0.2241970281 0.2421655478 0.2673604307
GM12878 ATF3 None 0.971901032 0.9866986273 0.9878185074 0.2339069125 0.3313722512 0.3271799542
GM12878 BATF None 0.932021719 0.9430773707 0.946920663 0.2294284351 0.2767155166 0.2861975225
GM12878 BCL11A None 0.942711195 0.9468372534 0.9527767026 0.1762335988 0.1935423413 0.2137608637
GM12878 BCL3 None 0.904599574 0.9108492771 0.9124129072 0.1674409144 0.1900477246 0.1924355171
GM12878 BCLAF1 None 0.958378312 0.9580874208 0.9615134541 0.1373245399 0.1724751132 0.1659944502
GM12878 CEBPB None 0.917012442 0.9226003818 0.930790745 0.1024498692 0.1287914315 0.1563126712
GM12878 EBF1 None 0.903966501 0.9302351346 0.9337608469 0.1808819955 0.2410076858 0.2487389752
GM12878 Egr-1 None 0.968068142 0.9701509225 0.971402839 0.2555446054 0.2900144575 0.3065526201
GM12878 ELF1 None 0.971719081 0.9749631323 0.9765481283 0.4803459136 0.5150997706 0.5157658868
GM12878 ETS1 None 0.985629811 0.9833999229 0.9795323406 0.2598804586 0.31586556 0.3121810976
GM12878 FOXM1 None 0.907992477 0.9146737698 0.9234702959 0.2021063255 0.2239470419 0.2425029589
GM12878 GABP None 0.987640089 0.9887693347 0.9895853063 0.5211708004 0.5879808903 0.5792690335
GM12878 IRF4 None 0.93451815 0.9449396806 0.9463605124 0.175851082 0.2088054602 0.214229064
GM12878 MEF2A None 0.929263022 0.9277432118 0.9471411277 0.1542119377 0.1610140019 0.2034633346
GM12878 MEF2C None 0.935128543 0.9278796573 0.9542268994 0.0957349301 0.1017272794 0.1596416237
GM12878 MTA3 None 0.899905648 0.905764824 0.9149004494 0.1468437541 0.1673900592 0.1855909428
GM12878 NFATC1 None 0.89701768 0.9030247151 0.9105011561 0.1668825727 0.1920175472 0.2002772131
GM12878 NFIC None 0.900132328 0.9049927131 0.9151011751 0.2451126828 0.2654825617 0.2943599712
GM12878 NRSF None 0.972767885 0.956573419 0.962673382 0.4367634119 0.4476968191 0.4522332143
GM12878 p300 None 0.958002113 0.9593558777 0.9636630109 0.111535973 0.1289293905 0.1591332532
GM12878 PAX5-C20 None 0.900678121 0.9061810605 0.9293936559 0.164839885 0.18788587 0.226109771
GM12878 PAX5-N19 None 0.915295958 0.9201533587 0.9381133297 0.1697664153 0.1733422745 0.2096374694
GM12878 Pbx3 None 0.931529498 0.9335511308 0.9399893473 0.1118729229 0.1190741396 0.1311465655
GM12878 PML None 0.926881395 0.9328674616 0.9370142756 0.3131697665 0.3492676138 0.3643677193
GM12878 Pol2-4H8 None 0.892877934 0.8991389796 0.9006586914 0.3619131875 0.3853461261 0.3907466247
GM12878 Pol2 None 0.95735067 0.9597579012 0.9589542133 0.5921757818 0.6093626208 0.6068627917
GM12878 POU2F2 None 0.925661202 0.9230673756 0.93713417 0.1980847371 0.2117357157 0.2367415244
GM12878 PU.1 None 0.963193627 0.9632249064 0.9651372034 0.4391917679 0.4559983592 0.4698004437
GM12878 Rad21 None 0.980068363 0.9827949116 0.9848205415 0.5819218297 0.6097084983 0.6241192752
GM12878 RUNX3 None 0.918940734 0.9218221875 0.9298618877 0.3849156092 0.3970460566 0.4205824127
GM12878 RXRA None 0.975478372 0.9724747877 0.9770622257 0.0232369252 0.0564727959 0.0507670433
GM12878 SIX5 None 0.990721252 0.992780882 0.9913390725 0.4757663138 0.6106198874 0.5944140419
GM12878 SP1 None 0.955073265 0.9578227053 0.9608520834 0.3273311996 0.3505493266 0.36548824
GM12878 SRF None 0.926471266 0.9293669359 0.9376433201 0.1406488061 0.1697369901 0.1733029038
GM12878 STAT5A None 0.900454995 0.907508557 0.9103818673 0.1029319524 0.1253718151 0.1337787033
GM12878 TAF1 None 0.962067709 0.9637928771 0.9655038861 0.3601003837 0.3909275947 0.4040592957
GM12878 TCF12 None 0.948741631 0.9549397194 0.9588437906 0.2004203585 0.2299460069 0.2457627546
GM12878 TCF3 None 0.947997051 0.9536777309 0.9565741271 0.1801572105 0.2149013197 0.2367071382
GM12878 USF1 None 0.982516349 0.9836420692 0.985332868 0.3839730223 0.3952286217 0.4087156953
GM12878 YY1 None 0.952042593 0.9568501278 0.9578263334 0.4037606453 0.4406802525 0.4479567735
GM12878 ZBTB33 None 0.969481667 0.9764611998 0.9791643545 0.0673206715 0.1074382609 0.124612115
GM12878 ZEB1 None 0.966827784 0.9716692832 0.9714642484 0.1700890536 0.190417269 0.1793707361
GM12891 PAX5-C20 None 0.917241364 0.9243967329 0.9522438548 0.0262350127 0.0322873569 0.0514225548
GM12891 Pol2-4H8 None 0.90092174 0.9065664386 0.9056351305 0.3018536691 0.3173007247 0.3269424868
GM12891 Pol2 None 0.909010551 0.9152013441 0.9132158071 0.3311246319 0.3467490723 0.3526225559
GM12891 POU2F2 None 0.930523887 0.9285544421 0.9432047351 0.1549935461 0.174399278 0.1979373849
GM12891 PU.1 None 0.963082388 0.9639820871 0.9666167458 0.4391877037 0.4623438539 0.4796264808
GM12891 TAF1 None 0.963908335 0.9653858419 0.9665571923 0.3581434308 0.3883551495 0.3970420846
GM12891 YY1 None 0.966720448 0.9713125527 0.9707997484 0.3703016666 0.4097398753 0.4025665874
GM12892 PAX5-C20 None 0.951680706 0.9547420635 0.9686877489 0.2677825365 0.2806027906 0.3055286255
GM12892 Pol2-4H8 None 0.899228266 0.906943281 0.9068974691 0.3082094965 0.3341591964 0.3377448163
GM12892 Pol2 None 0.930859483 0.9353026743 0.9344052442 0.4493677779 0.4783926554 0.4780984708
GM12892 TAF1 None 0.970675427 0.9737780927 0.9750309546 0.3888536642 0.4187896969 0.4405132202
GM12892 YY1 None 0.954630578 0.9619970517 0.9589830655 0.3429711745 0.3750428505 0.3683852164
H1-hESC ATF2 None 0.914795823 0.9368482221 0.9449290507 0.11430116 0.1460018314 0.1548320541
H1-hESC ATF3 None 0.982504366 0.9869583832 0.9879195085 0.2733466691 0.3494076266 0.3513156571
H1-hESC BCL11A None 0.940037271 0.9561607131 0.9671266945 0.0673760091 0.1063478549 0.1542592364
H1-hESC CTCF None 0.983673756 0.9866620088 0.9878663054 0.5912212261 0.6318271747 0.6441338247
H1-hESC Egr-1 None 0.953604242 0.9597357964 0.9624300411 0.1623174572 0.184926903 0.1823215617
H1-hESC FOSL1 None 0.937050394 0.9395333561 0.9414613865 0.0258085095 0.025401472 0.0290483918
H1-hESC GABP None 0.98281473 0.9864028797 0.9855950259 0.3442922395 0.3880918685 0.3931281162
H1-hESC HDAC2 None 0.948779038 0.9586092875 0.9680401901 0.0668142747 0.1008334063 0.1175927477
H1-hESC JunD None 0.957098716 0.9642650237 0.968462805 0.1668331466 0.2118655214 0.2230956277
H1-hESC NANOG None 0.930438563 0.9415615003 0.9620653198 0.0738693862 0.1100891083 0.1667331474
H1-hESC NRSF None 0.952885124 0.922498624 0.9326753672 0.4428276858 0.370143416 0.4009775729
H1-hESC p300 None 0.940837667 0.9532142954 0.9636637423 0.1360969316 0.176543707 0.2023147669
H1-hESC Pol2-4H8 None 0.90698199 0.9140409662 0.9175040938 0.3089698853 0.3239217936 0.3255906285
H1-hESC Pol2 None 0.936257213 0.9429938763 0.9447009015 0.4972371445 0.5105718007 0.5118825048
H1-hESC POU5F1 None 0.94708764 0.9527541485 0.9699815165 0.1012301303 0.1497462237 0.2359797116
H1-hESC Rad21 None 0.974008375 0.9795066112 0.9819361964 0.6624543612 0.7029845522 0.7138230725
H1-hESC RXRA None 0.956119035 0.9684214011 0.9720137373 0.0195073535 0.0293180491 0.0313414463
H1-hESC Sin3Ak-20 None 0.957022324 0.9638000606 0.9695904431 0.2032544779 0.2286356348 0.2366071726
H1-hESC SIX5 None 0.955924198 0.9723195295 0.9718700506 0.2870435449 0.469140595 0.4408596668
H1-hESC SP1 None 0.93694478 0.9468154701 0.9532997302 0.233113743 0.2762345923 0.2975049915
H1-hESC SP2 None 0.971738645 0.9683538751 0.9695642634 0.2276379997 0.2826467581 0.2642805945
H1-hESC SP4 None 0.974701339 0.9757572735 0.9779733446 0.2883646038 0.3119982721 0.3121792138
H1-hESC SRF None 0.874915349 0.8896656717 0.8917022173 0.0793087334 0.1132099945 0.1117309073
H1-hESC TAF1 None 0.975171221 0.9786042729 0.9796099719 0.5247012617 0.5449373105 0.5520732027
H1-hESC TAF7 None 0.958718248 0.9651535151 0.9677382445 0.316933269 0.3495375822 0.356294002
H1-hESC TCF12 None 0.94269021 0.9543157436 0.9646693752 0.1138852714 0.1692861124 0.2151014137
H1-hESC TEAD4 None 0.946155967 0.9546726682 0.9583895647 0.2208444389 0.2674330015 0.2751128757
H1-hESC USF1 None 0.976938955 0.9786663234 0.9825068289 0.44260659 0.4875125505 0.5059860099
H1-hESC YY1 None 0.955840635 0.9630946657 0.9661859932 0.3197877876 0.360491089 0.3514997523
HCT-116 Pol2-4H8 None 0.904003718 0.9135019835 0.9152648306 0.4208146406 0.4479476946 0.4492155244
HCT-116 YY1 None 0.966481725 0.968814438 0.9696686704 0.3088576714 0.3528384273 0.3451717667
HCT-116 ZBTB33 None 0.961492995 0.9672737402 0.9694169269 0.1716541648 0.2045846457 0.2192087617
HeLa-S3 GABP None 0.982048618 0.9841824284 0.9831439957 0.4157367763 0.4641053124 0.4552553625
HeLa-S3 NRSF None 0.940969855 0.9170494829 0.9237384739 0.3570522259 0.3466580641 0.3540489934
HeLa-S3 Pol2 None 0.910957167 0.9208174738 0.9195818662 0.4783268376 0.496106993 0.4970863478
HeLa-S3 TAF1 None 0.95272497 0.9571752254 0.9570508226 0.3628497046 0.383000623 0.3839948442
HepG2 ATF3 None 0.984173628 0.9853375695 0.986407746 0.2332904948 0.2950734391 0.2867631156
HepG2 BHLHE40 None 0.970076098 0.9726726567 0.97638331 0.1010812133 0.1401786256 0.1478950879
HepG2 CEBPB None 0.97629226 0.9798983376 0.9830245299 0.2960548151 0.3298919553 0.3579400959
HepG2 CEBPD None 0.971372911 0.9734531173 0.9752810434 0.1995865581 0.2273294418 0.244530596
HepG2 CTCF None 0.986842904 0.9894502401 0.9902877165 0.6384822147 0.6682747916 0.6744760844
HepG2 ELF1 None 0.965702763 0.968509434 0.9735853323 0.3580461342 0.3882699188 0.4009475303
HepG2 FOSL2 None 0.95448315 0.9577394921 0.9594462676 0.3106102447 0.3281569807 0.3472836878
HepG2 FOXA1 None 0.944196728 0.9479972942 0.955602655 0.3410689103 0.3655986265 0.4002072025
HepG2 FOXA1 None 0.943532165 0.9474185875 0.9559726508 0.3730164239 0.3986251809 0.4430068709
HepG2 FOXA2 None 0.943101921 0.9496773275 0.9571483424 0.328173443 0.3550117913 0.392062381
HepG2 GABP None 0.988331069 0.9889153843 0.989334857 0.5615857258 0.6146950796 0.6134919602
HepG2 HDAC2 None 0.937250962 0.9427759817 0.9545955076 0.1721660298 0.1939871298 0.2275163864
HepG2 HNF4A None 0.962022049 0.9677974205 0.9724958555 0.2630983553 0.3226134119 0.3389676585
HepG2 HNF4G None 0.954636203 0.964082586 0.9663509468 0.2526675933 0.3135248965 0.3357531316
HepG2 JunD None 0.955196962 0.9580064168 0.9611587191 0.2614049025 0.2746839327 0.3004667806
HepG2 MBD4 None 0.916877278 0.9243278149 0.9326562758 0.080176469 0.1018035969 0.1243221058
HepG2 MYBL2 None 0.908103887 0.916692844 0.9291954649 0.1958640078 0.2221842949 0.2472900406
HepG2 NFIC None 0.908727988 0.9198669882 0.9340149391 0.1669846481 0.2000157659 0.2308869644
HepG2 NRSF None 0.984887604 0.9730258606 0.9773479201 0.4743190962 0.4594240085 0.4814851252
HepG2 NRSF None 0.953006243 0.952145282 0.9534019969 0.3508334727 0.3997471575 0.4030209028
HepG2 p300 None 0.932979836 0.9334264124 0.9462499317 0.2306318915 0.2441792544 0.2794539026
HepG2 Pol2-4H8 None 0.908404142 0.917114166 0.9212209018 0.3929313058 0.427557353 0.4299585869
HepG2 Pol2 None 0.948906184 0.9520784028 0.9540168787 0.5067501397 0.5304835663 0.536508853
HepG2 Rad21 None 0.976796245 0.9817102762 0.9834068178 0.6041747227 0.6430259741 0.6503722257
HepG2 RXRA None 0.942017622 0.9439449016 0.9523221354 0.1882529823 0.1931508812 0.2225834428
HepG2 Sin3Ak-20 None 0.950666732 0.9530346247 0.9580219341 0.3145083628 0.3323794457 0.3466209382
HepG2 SP1 None 0.942727504 0.9457528152 0.9567566297 0.2723298678 0.2981141925 0.3376637027
HepG2 SP2 None 0.991742099 0.9764715457 0.9844073894 0.3101412898 0.3469494172 0.3391759718
HepG2 SRF None 0.853729196 0.8830707385 0.8943369262 0.0388119002 0.0488461242 0.0471176518
HepG2 TAF1 None 0.986033679 0.9877858688 0.988767402 0.5628536055 0.58585271 0.5970603703
HepG2 TCF12 None 0.977847001 0.976825683 0.979742224 0.0672963554 0.0756261759 0.0876948977
HepG2 TEAD4 None 0.911202801 0.9181630611 0.9303326364 0.1318960115 0.1611364597 0.1815966655
HepG2 USF1 None 0.982911581 0.9838251012 0.9861459923 0.3881287745 0.4287163717 0.4478367039
HepG2 YY1 None 0.967588379 0.9728953179 0.9727784545 0.4482513983 0.4723309152 0.4722563246
HepG2 ZBTB33 None 0.954026245 0.9651302502 0.9661387087 0.0790686198 0.1174764704 0.125552766
HepG2 ZBTB7A None 0.967724078 0.9738842641 0.971904114 0.1376572052 0.1808411338 0.1639986248
HUVEC Pol2-4H8 None 0.918693054 0.9247237765 0.9273973263 0.3771773874 0.3946793551 0.4033486662
HUVEC Pol2 None 0.926147666 0.931827469 0.9315142585 0.4084871564 0.4306684059 0.4264381328
K562 ATF3 None 0.966515758 0.9721638341 0.9730587549 0.2484379299 0.2857303607 0.2748678079
K562 BCL3 None 0.946783024 0.9554450659 0.9459470353 0.0553591435 0.1088576622 0.1052386966
K562 BCLAF1 None 0.951982546 0.959141183 0.9578337446 0.1165703659 0.1640285273 0.1541963317
K562 CBX3 None 0.867518233 0.884903249 0.8885686063 0.1352866583 0.1621216082 0.173981456
K562 CEBPB None 0.945297111 0.9551490026 0.9572510168 0.2332564112 0.2803514876 0.288073354
K562 CTCF None 0.983784131 0.985872524 0.987293719 0.6036741685 0.6288561897 0.6390566875
K562 CTCFL None 0.989923324 0.9910625988 0.99129723 0.286065903 0.3366369385 0.3419942188
K562 E2F6 None 0.963235911 0.9671991791 0.9669198194 0.3782305504 0.4041660108 0.3954799839
K562 Egr-1 None 0.93145635 0.9367165694 0.9443809755 0.2727619812 0.2930985012 0.3094456794
K562 ELF1 None 0.958270991 0.9640659832 0.9660217553 0.3942231784 0.4250538938 0.4269535615
K562 ETS1 None 0.974433524 0.97967719 0.9794087519 0.3349948468 0.392435143 0.3911718881
K562 FOSL1 None 0.977913227 0.9800456704 0.9802582471 0.3002657032 0.2978205212 0.2975684573
K562 GABP None 0.970624016 0.9756290883 0.9767580527 0.4303230006 0.4910304276 0.4819384429
K562 GATA2 None 0.958298093 0.9609016971 0.9641431613 0.2556532661 0.2720793142 0.2954446842
K562 HDAC2 None 0.946921693 0.9534719242 0.9521795671 0.1008028612 0.1208685547 0.1217277902
K562 Max None 0.946450203 0.9540627812 0.9542279027 0.442044106 0.4794807215 0.4799725743
K562 MEF2A None 0.916608232 0.9186269631 0.9442410221 0.0486008006 0.0568499064 0.0788917835
K562 NR2F2 None 0.920975477 0.921977789 0.9310641277 0.170702367 0.1788581076 0.1977491139
K562 NRSF None 0.950617333 0.9362099268 0.946081271 0.2874978746 0.2976296301 0.3102825777
K562 PML None 0.942659129 0.9482534278 0.9508857186 0.3120154544 0.3411815633 0.3538273612
K562 Pol2-4H8 None 0.931789038 0.9394680345 0.9427374744 0.3381259817 0.3724464404 0.3800195724
K562 Pol2 None 0.951292087 0.9573202711 0.9566508143 0.5694093985 0.5941370556 0.5923720289
K562 PU.1 None 0.967879614 0.9695063651 0.9705452213 0.2723484948 0.2956476248 0.30876616
K562 Rad21 None 0.987508717 0.9897809471 0.990494482 0.5604969249 0.5879629984 0.6031421351
K562 Sin3Ak-20 None 0.973752096 0.9752788312 0.9744663253 0.286774099 0.3147911583 0.3197958986
K562 SIX5 None 0.991661661 0.992597429 0.9927044313 0.4014411066 0.5278058844 0.5178885508
K562 SP1 None 0.972705412 0.9766417759 0.9754055002 0.2705344424 0.3052179829 0.3057602634
K562 SP2 None 0.991181539 0.990315691 0.9887350186 0.325415287 0.3979500619 0.3665750428
K562 SRF None 0.914001353 0.9274252752 0.9214355933 0.0895806469 0.1140080435 0.110218537
K562 STAT5A None 0.948215404 0.9554148261 0.9618986289 0.1697467004 0.2053742136 0.2352125441
K562 TAF1 None 0.973415421 0.9760487589 0.9770781498 0.4397489265 0.4773975598 0.4745565971
K562 TAF7 None 0.890440546 0.9002221892 0.8967684085 0.0646282247 0.0876667369 0.0898538039
K562 TEAD4 None 0.922597989 0.9281418359 0.9352835744 0.2557320977 0.2724623556 0.3005842979
K562 THAP1 None 0.985768313 0.9870756199 0.9872178469 0.1912092913 0.2038986038 0.2239311866
K562 TRIM28 None 0.916828143 0.9255093875 0.931864418 0.1365893287 0.1702169565 0.1924764785
K562 USF1 None 0.974563686 0.9784236299 0.980118877 0.3730212095 0.4043807529 0.410338512
K562 YY1 None 0.983002327 0.9854776025 0.9856071218 0.4249507699 0.4591471573 0.4500335383
K562 YY1 None 0.957374991 0.9615162959 0.9618907144 0.3688559756 0.3818059706 0.3833951744
K562 ZBTB33 None 0.95579861 0.9655289978 0.965171869 0.0635043277 0.1179764305 0.1382449256
K562 ZBTB7A None 0.970400592 0.9729512323 0.9725393711 0.3732385345 0.4183472309 0.4070665878
PANC-1 NRSF None 0.975145248 0.9662209715 0.9706774866 0.4055904944 0.4254288586 0.4336422232
PANC-1 Pol2-4H8 None 0.928962738 0.9367444641 0.9400506563 0.1695854082 0.1862793916 0.1884898743
PANC-1 Sin3Ak-20 None 0.98032654 0.9828703892 0.9836137727 0.1696981438 0.1797628867 0.18866366
PFSK-1 FOXP2 None 0.962361693 0.9660926119 0.9685787597 0.3299423229 0.3498613614 0.3634783447
PFSK-1 NRSF None 0.935109016 0.9084583717 0.9189211229 0.352803205 0.3326201837 0.3530935108
PFSK-1 Sin3Ak-20 None 0.93017281 0.9386223412 0.94050771 0.0798899517 0.0937313141 0.0907111984
PFSK-1 TAF1 None 0.922334826 0.932479034 0.9363289499 0.21673075 0.2511980678 0.2535121772
SK-N-MC FOXP2 None 0.910221709 0.9229915871 0.9271757569 0.2324645568 0.2663238013 0.271994269
SK-N-MC Pol2-4H8 None 0.907063492 0.922659045 0.9277382769 0.2609754838 0.3171721568 0.3212749626
SK-N-SH NRSF None 0.957974346 0.9620247382 0.9646742073 0.2922922953 0.3503163541 0.3581043185
SK-N-SH NRSF None 0.959115812 0.9490695495 0.9563363723 0.2844833024 0.3130052409 0.3202903988
SK-N-SH Pol2-4H8 None 0.901610066 0.9112461973 0.9169266514 0.3011309921 0.3228061757 0.3317004972
SK-N-SH_RA CTCF None 0.991020275 0.9925112453 0.993109771 0.6051194637 0.6567849142 0.6558767904
SK-N-SH_RA p300 None 0.891925063 0.9021498795 0.9129219219 0.2221561078 0.2482990118 0.2811973026
SK-N-SH_RA Rad21 None 0.958137666 0.9654464768 0.968358229 0.544030423 0.583184878 0.5952788994
SK-N-SH_RA USF1 None 0.97806443 0.9803033507 0.9818530175 0.3889709427 0.4281967261 0.4328321062
SK-N-SH_RA YY1 None 0.944735901 0.9526772207 0.9532393437 0.3018505231 0.3336284479 0.3250784593
SK-N-SH Sin3Ak-20 None 0.946856187 0.9499456797 0.9516528677 0.2881952312 0.2975122269 0.3020643052
SK-N-SH TAF1 None 0.968996752 0.9710532092 0.9740312141 0.4096547227 0.4396124184 0.4493194084
T-47D CTCF DMSO_0.02pct 0.987168417 0.989672474 0.9902873531 0.6688819076 0.7066353615 0.7044341238
T-47D ERalpha BPA_100nM 0.895361686 0.8928562875 0.9318265709 0.0301599999 0.032850466 0.0631459576
T-47D ERalpha Genistein_100nM 0.877178508 0.8762248817 0.9077456616 0.0642349674 0.0756844733 0.1102756375
T-47D ERalpha Estradiol_10nM 0.877228411 0.8769052904 0.9076118656 0.0638402657 0.0757606477 0.1085298334
T-47D FOXA1 DMSO_0.02pct 0.91807632 0.9285201721 0.9350478333 0.2447470384 0.286568245 0.3120955676
T-47D GATA3 DMSO_0.02pct 0.864564285 0.8705376135 0.879725744 0.1495396195 0.1672782512 0.1855924799
T-47D p300 DMSO_0.02pct 0.882579323 0.9046639173 0.911042115 0.100503896 0.1281163987 0.1416627291
U87 NRSF None 0.977759226 0.9751771461 0.9774293797 0.3988980674 0.442989008 0.455183631
U87 Pol2-4H8 None 0.916523037 0.9245304476 0.9254428519 0.3458986732 0.3711992009 0.3731753762
A549 BHLHE40 None 0.958361915 0.9628913734 0.9611578511 0.1239080485 0.1620875684 0.1723714816
A549 CEBPB None 0.971565265 0.9744582046 0.9754643281 0.4907546392 0.5156231971 0.5227081586
A549 Max None 0.970096237 0.9754088659 0.9747158017 0.314981117 0.3529522611 0.3620171368
A549 Pol2(phosphoS2) None 0.663888085 0.6974486873 0.7123312742 0.0084924559 0.0106617549 0.0111984691
A549 Rad21 None 0.988579197 0.9904369263 0.9907646878 0.6365909802 0.6789528243 0.6875560307
GM08714 ZNF274 None 0.972015609 0.9721406481 0.9778215127 0.5178691056 0.577759454 0.5665969252
GM10847 NFKB TNFa 0.951498795 0.9528794929 0.9566706116 0.1596064538 0.2030075943 0.2108233533
GM10847 Pol2 None 0.991693325 0.9916603977 0.9909112535 0.5294120967 0.5760412503 0.5761552344
GM12878 BHLHE40 None 0.944348841 0.9490013827 0.9547896043 0.2204954172 0.2329333001 0.2558359133
GM12878 BRCA1 None 0.997287365 0.9976887085 0.9976343205 0.0575293557 0.156831512 0.2086819655
GM12878 c-Fos None 0.988763616 0.9920844732 0.9918623898 0.4086685815 0.4285958845 0.4554074146
GM12878 CHD1 None 0.888391109 0.8925588265 0.8910353905 0.0705529056 0.0776158379 0.0799401582
GM12878 CHD2 None 0.942040607 0.9444981241 0.9499855718 0.2989824922 0.3265784711 0.3428206794
GM12878 COREST None 0.960820639 0.9698412098 0.9717532102 0.0523036476 0.079914393 0.0802887235
GM12878 CTCF None 0.979011087 0.9840308561 0.9850540848 0.5499689112 0.6069305147 0.6184375267
GM12878 E2F4 None 0.970666767 0.9761846959 0.9745794096 0.1961313594 0.2310114598 0.2186653604
GM12878 EBF1 None 0.892538354 0.9266219751 0.9286584045 0.187258841 0.2907553325 0.2965776912
GM12878 ELK1 None 0.965664017 0.9674143397 0.9681504459 0.404357562 0.4367006564 0.4321749902
GM12878 IKZF1 None 0.923745016 0.9295752387 0.933616055 0.1334705724 0.1471858172 0.1628663396
GM12878 JunD None 0.966194552 0.9719814817 0.9762383299 0.1016885358 0.1198933822 0.1386802665
GM12878 Max None 0.957453008 0.9590169974 0.9617199005 0.3424415077 0.3752422524 0.3767462842
GM12878 MAZ None 0.951987599 0.9550698848 0.958207404 0.4059345745 0.4359519567 0.4461413565
GM12878 Mxi1 None 0.939281483 0.943380586 0.943988237 0.3382483259 0.3680957645 0.3651069178
GM12878 NF-E2 None 0.985723035 0.989221985 0.9898800254 0.3453461211 0.432098025 0.4194995723
GM12878 NFKB TNFa 0.939836519 0.9410918647 0.9456719595 0.2170273763 0.2397213541 0.2528069901
GM12878 NF-YA None 0.987151504 0.9866589996 0.9895264832 0.4052235139 0.4643453868 0.4839805224
GM12878 NF-YB None 0.953241064 0.9591166541 0.9602819436 0.4111414119 0.4578999617 0.4542969165
GM12878 Nrf1 None 0.987961857 0.991582287 0.990430398 0.4514471688 0.5274658782 0.5167792949
GM12878 p300 None 0.959971103 0.960545921 0.967295692 0.149608807 0.1664059666 0.1941345453
GM12878 p300 None 0.931861711 0.9306409618 0.9406473446 0.2056752218 0.2142406298 0.2481324177
GM12878 Pol2 None 0.919500854 0.9212813946 0.9208844573 0.3834909452 0.4022568126 0.40810318
GM12878 Pol2(phosphoS2) None 0.924078021 0.9271725698 0.9249840707 0.3403140703 0.37146931 0.3654875734
GM12878 Pol2 None 0.96813096 0.9694441414 0.9692944746 0.4034917103 0.4309952899 0.4273513005
GM12878 Pol3 None 0.942061887 0.9867335502 0.9623137445 9.53E-005 0.0037484529 0.0001098919
GM12878 Rad21 None 0.979247993 0.983166793 0.9844200608 0.5944255049 0.6355415533 0.6446807255
GM12878 RFX5 None 0.921216659 0.9336516692 0.9379358583 0.2088979125 0.2308818899 0.2460282498
GM12878 SIN3A None 0.950010504 0.9544582322 0.953165641 0.3272046502 0.35371216 0.3473436429
GM12878 SMC3 None 0.977133874 0.9792136824 0.9801736763 0.6669760629 0.6983036203 0.7045337821
GM12878 STAT1 None 0.925506337 0.9259664392 0.9330128638 0.0622603416 0.057410479 0.0584752095
GM12878 STAT3 None 0.911616503 0.919094302 0.922780706 0.086468066 0.0961130876 0.095655996
GM12878 TBLR1 None 0.927338626 0.9313030945 0.9372081571 0.1834184053 0.2023151467 0.2138062823
GM12878 TBP None 0.911404453 0.9132139835 0.917221013 0.220134142 0.2360317734 0.2432075699
GM12878 TR4 None 0.962338054 0.9663422149 0.9625883897 0.1450253066 0.1442411779 0.1368235146
GM12878 USF2 None 0.973089523 0.9763835216 0.9780786865 0.324565079 0.3621034369 0.3733885519
GM12878 WHIP None 0.871817325 0.8803175014 0.8799191054 0.1004774159 0.1191010557 0.1192643185
GM12878 YY1 None 0.926697195 0.9331938847 0.9276689666 0.0743555715 0.0891445487 0.0897463169
GM12878 Znf143 None 0.982639769 0.9878181318 0.9884064521 0.6167990015 0.668861718 0.669663005
GM12878 ZNF274 None 0.706886447 0.7412895001 0.7656852358 0.0018856182 0.0291676899 0.0269677594
GM12878 ZZZ3 None 0.908275757 0.9318954798 0.9377596725 0.0339956562 0.1252520171 0.0773120828
GM12891 NFKB TNFa 0.93821577 0.942286792 0.9481327735 0.297770668 0.329406904 0.3553336475
GM12891 Pol2 None 0.924227214 0.9282791878 0.925939815 0.37161083 0.4011183169 0.3986571712
GM12892 NFKB TNFa 0.95623254 0.9577323395 0.9624050789 0.1681099067 0.2130798946 0.227921733
GM12892 Pol2 None 0.948067411 0.9498654293 0.9502086953 0.4806571069 0.5040437053 0.5095692331
GM15510 NFKB TNFa 0.948288218 0.9527039123 0.9552836504 0.2631774513 0.2896409651 0.3068732393
GM15510 Pol2 None 0.974398294 0.9746445937 0.9759299805 0.593161713 0.6159501318 0.6218546852
GM18505 NFKB TNFa 0.943585332 0.9440786525 0.9482653621 0.1562811151 0.1955714226 0.2110601172
GM18505 Pol2 None 0.93632009 0.9399577842 0.9397525117 0.4406089736 0.4609616308 0.4619846299
GM18526 NFKB TNFa 0.958548139 0.9590482379 0.9669919686 0.074905123 0.1082382796 0.1116057632
GM18526 Pol2 None 0.975301099 0.9756104858 0.9761219528 0.5479445821 0.5752779268 0.5781913692
GM18951 NFKB TNFa 0.941896065 0.9433104112 0.9506112343 0.1982900321 0.2277260139 0.2434876616
GM18951 Pol2 None 0.96602387 0.967690973 0.9678068719 0.5959859467 0.6145268512 0.6168810033
GM19099 NFKB TNFa 0.959763371 0.9581351495 0.965568454 0.1636351184 0.2022076714 0.2130808888
GM19099 Pol2 None 0.948350092 0.9512310719 0.9506952167 0.4737021424 0.5013811863 0.5020881638
GM19193 NFKB TNFa 0.967053845 0.9646108733 0.9711412081 0.1411869233 0.1892265809 0.197227612
GM19193 Pol2 None 0.957867377 0.9596919733 0.959463632 0.5155114851 0.5359780333 0.5360236388
H1-hESC Bach1 None 0.952436603 0.955696693 0.9668872042 0.2039066275 0.2371177632 0.2756690509
H1-hESC BRCA1 None 0.950789565 0.9523023422 0.9707970543 0.0862294044 0.1131974161 0.1475533905
H1-hESC CEBPB None 0.973389416 0.9805334329 0.9814236126 0.3279828933 0.4360858677 0.4156381053
H1-hESC CHD1 None 0.94649488 0.9519094994 0.9496743383 0.0598169768 0.0640012708 0.0524086532
H1-hESC CHD2 None 0.967552972 0.9730314159 0.9792090164 0.2551693801 0.2795655476 0.2944515603
H1-hESC c-Jun None 0.960741366 0.9718025676 0.9759024382 0.0995249894 0.1970710245 0.2195003864
H1-hESC c-Myc None 0.971816478 0.981301879 0.9813202619 0.1766529477 0.2108506255 0.2230572683
H1-hESC CtBP2 None 0.950831481 0.9585541956 0.9625719547 0.1522983817 0.1721467872 0.1792074016
H1-hESC GTF2F1 None 0.958486059 0.9660448994 0.9666544705 0.2061245646 0.233855773 0.2262477328
H1-hESC JunD None 0.949495575 0.963394935 0.9668638855 0.2191328697 0.2781016907 0.2990592202
H1-hESC MafK None 0.970228644 0.9685842845 0.9765850051 0.3371714553 0.3588718885 0.3934315848
H1-hESC Max None 0.946810238 0.9635798771 0.9664236995 0.2344474848 0.2944497002 0.3094495485
H1-hESC Mxi1 None 0.968895137 0.975403812 0.9782577233 0.218558087 0.2737178374 0.2802870509
H1-hESC Nrf1 None 0.99285262 0.9931634923 0.9925734017 0.3950084296 0.4902688135 0.4564230619
H1-hESC Rad21 None 0.980032382 0.9838506649 0.985781192 0.618603579 0.6559008123 0.6713280058
H1-hESC RFX5 None 0.8494893 0.8804005493 0.8925887033 0.0285155969 0.0278858979 0.0359254058
H1-hESC SIN3A None 0.94653831 0.9576579558 0.9603577545 0.3634725128 0.397430396 0.4068450576
H1-hESC SUZ12 None 0.977584734 0.9809174269 0.9830808211 0.2515550019 0.2825105878 0.2867290899
H1-hESC TBP None 0.957975186 0.9635167782 0.9653996297 0.3928260042 0.4221970565 0.4209023557
H1-hESC USF2 None 0.983206523 0.9859779391 0.988311348 0.3673398732 0.4279736785 0.447742214
H1-hESC Znf143 None 0.95304759 0.9628309618 0.9651070442 0.5379671251 0.5998517928 0.6057938599
HCT-116 Pol2 None 0.954535075 0.9553844795 0.9575439011 0.4872009004 0.5096186544 0.5058050742
HCT-116 TCF7L2 None 0.898262337 0.9110015747 0.915173472 0.2236575237 0.2502711742 0.253583038
HEK293 ELK4 None 0.896890814 0.8949537497 0.9060050672 0.1974080417 0.1544068435 0.1667740292
HEK293 KAP1 None 0.817216556 0.8387503714 0.8463625764 0.1122810792 0.1447726327 0.1482025248
HEK293 Pol2 None 0.99142818 0.9935264042 0.9926183504 0.5293071082 0.5733229236 0.5716214687
HEK293 TCF7L2 None 0.86299402 0.8763973093 0.8943416215 0.0695423682 0.0818942513 0.1012377408
HEK293-T-REx ZNF263 None 0.873951723 0.879532693 0.884966736 0.2362858771 0.2456102544 0.2562754494
HeLa-S3 AP-2alpha None 0.901188029 0.9269345527 0.9319740321 0.1953882299 0.2534146393 0.2657225957
HeLa-S3 AP-2gamma None 0.897349879 0.921372763 0.9266156025 0.2296593833 0.2796171616 0.2925320269
HeLa-S3 BAF155 None 0.909466684 0.9207932953 0.9240407605 0.1469075408 0.1725206361 0.1783457395
HeLa-S3 BAF170 None 0.928472309 0.945188657 0.9458760826 0.0701424726 0.0977072651 0.1035375933
HeLa-S3 BDP1 None 0.912300929 0.879690726 0.9181861875 0.0094745525 0.1091674489 0.0815463412
HeLa-S3 BRCA1 None 0.944826433 0.9536617187 0.9526704473 0.2264573908 0.2456885694 0.2550116687
HeLa-S3 BRF1 None 0.830668202 0.6870009289 0.6706933004 9.59E-005 0.0001540748 0.00016358
HeLa-S3 BRF2 None 0.795259425 0.8319303906 0.8180800334 0.005320839 0.1182812848 0.1172239833
HeLa-S3 Brg1 None 0.89154856 0.9069980404 0.9169661803 0.0223766101 0.0308726575 0.040570769
HeLa-S3 CEBPB None 0.935635239 0.9405004934 0.9433734235 0.3849546469 0.3999277787 0.4104757414
HeLa-S3 c-Fos None 0.974039806 0.9778544571 0.9786975768 0.2478384611 0.2577592611 0.2787892846
HeLa-S3 CHD2 None 0.94516379 0.9507745807 0.9511260493 0.3774504352 0.3995431913 0.4075236312
HeLa-S3 c-Jun None 0.94977116 0.9561553047 0.9597024501 0.3220448462 0.3388049903 0.3573777223
HeLa-S3 c-Myc None 0.954464015 0.9608111732 0.9611966987 0.2359868261 0.24782928 0.2622125745
HeLa-S3 COREST None 0.915107288 0.928832674 0.9288165306 0.2240310212 0.2486062498 0.2548511962
HeLa-S3 E2F1 None 0.986673104 0.9875975824 0.9866971326 0.272889854 0.3112027095 0.3015962517
HeLa-S3 E2F4 None 0.969831507 0.9703142406 0.9722014953 0.1976883321 0.2348903387 0.2328930004
HeLa-S3 E2F6 None 0.971110759 0.9749493103 0.9744898384 0.2399004288 0.2669190721 0.2652919273
HeLa-S3 ELK1 None 0.974264398 0.9749144223 0.9736699672 0.4202237625 0.4584158778 0.4520580034
HeLa-S3 ELK4 None 0.962083008 0.9674286083 0.9695528218 0.3619190558 0.3972915702 0.3928203531
HeLa-S3 GTF2F1 None 0.931200033 0.9375029287 0.9387117497 0.2413487483 0.2689824211 0.2778446738
HeLa-S3 HA-E2F1 None 0.991011533 0.9916110075 0.99149024 0.4120700807 0.4408273312 0.4349266868
HeLa-S3 Ini1 None 0.958058206 0.9625434899 0.9632401843 0.1784875906 0.187617239 0.1969136863
HeLa-S3 IRF3 None 0.986984377 0.983817243 0.9869970768 0.4166262817 0.4673161223 0.4976733192
HeLa-S3 JunD None 0.949783336 0.9560160487 0.958135165 0.362784171 0.3801997563 0.3899905513
HeLa-S3 MafK None 0.951266053 0.9526659241 0.959055364 0.2592272543 0.2798526369 0.3010974693
HeLa-S3 Max None 0.92969034 0.9370059885 0.9390643021 0.3546265004 0.3820506926 0.3852923451
HeLa-S3 MAZ None 0.966530426 0.9695434968 0.9703262557 0.3944165364 0.4315522067 0.4341364676
HeLa-S3 Mxi1 None 0.948104524 0.9533207297 0.9527708544 0.309183947 0.323208362 0.3298965037
HeLa-S3 NF-YA None 0.968547009 0.9766898594 0.9736352702 0.3366022903 0.3960821361 0.3949417919
HeLa-S3 NF-YB None 0.948726249 0.9580801086 0.9568413776 0.2714319967 0.3304008651 0.3282461398
HeLa-S3 Nrf1 None 0.973955704 0.981810786 0.9806218411 0.3810707518 0.4551814844 0.4251546696
HeLa-S3 p300 None 0.923274474 0.9302815085 0.9348039858 0.2616118609 0.2723041643 0.2862550101
HeLa-S3 Pol2(phosphoS2) None 0.909935156 0.9155228438 0.9135328863 0.325006685 0.3394661258 0.3417708888
HeLa-S3 Pol2 None 0.956122846 0.9590446908 0.959385817 0.5721778278 0.5850735079 0.5850981598
HeLa-S3 PRDM1 None 0.897594092 0.9083897188 0.913207362 0.0424886299 0.045772289 0.0504819558
HeLa-S3 Rad21 None 0.961280216 0.9687175471 0.9707852674 0.5203020501 0.5594103565 0.5683609622
HeLa-S3 RFX5 None 0.921993905 0.9320719804 0.9341306033 0.2559404092 0.2852672282 0.2904865125
HeLa-S3 RPC155 None 0.919073389 0.9313112855 0.9294428216 0.0588460459 0.0950581068 0.0818821504
HeLa-S3 SMC3 None 0.961740521 0.9669931679 0.9676377844 0.4864425364 0.5227354475 0.5303914104
HeLa-S3 SPT20 None 0.78394455 0.8192629955 0.8127455621 0.0045635432 0.0063629451 0.0061069594
HeLa-S3 STAT1 IFNg30 0.877472064 0.9093234244 0.9082345261 0.1621918041 0.2229388261 0.2264478323
HeLa-S3 STAT3 None 0.933638563 0.9413763581 0.9465774773 0.2136359571 0.2294738713 0.2529158304
HeLa-S3 TBP None 0.912152882 0.9182497412 0.9177700983 0.2625939294 0.2774108834 0.2810150516
HeLa-S3 TCF7L2 None 0.867147037 0.883335318 0.8917520706 0.1833404396 0.2046307928 0.2157033965
HeLa-S3 TCF7L2 None 0.869614462 0.8870918371 0.901551719 0.045142588 0.0584390038 0.0661823286
HeLa-S3 TFIIIC-110 None 0.935291396 0.9476630186 0.9446612627 0.0729402765 0.1080520618 0.0818851604
HeLa-S3 TR4 None 0.890227568 0.9092524968 0.9025962101 0.0521923309 0.0688820667 0.0593948777
HeLa-S3 USF2 None 0.954394551 0.9582009681 0.9607987869 0.2730430987 0.3010503702 0.2984258478
HeLa-S3 ZKSCAN1 None 0.907010836 0.9167770384 0.9129832835 0.0991556084 0.1050017082 0.1096700619
HeLa-S3 Znf143 None 0.960100483 0.9700917501 0.9694252119 0.3090620603 0.3768008847 0.3852099035
HeLa-S3 ZNF274 None 0.904008615 0.9488066459 0.9781635972 0.0001826966 8.07E-005 0.000204328
HeLa-S3 ZZZ3 None 0.8552139 0.8719412281 0.8711216823 0.0101903224 0.0192317255 0.0128659213
HepG2 ARID3A None 0.924680304 0.9325557575 0.9445739383 0.1553355656 0.1954110073 0.2315842094
HepG2 BHLHE40 None 0.950947837 0.9575306497 0.9614360817 0.2236230141 0.2507381381 0.2731908416
HepG2 BRCA1 None 0.98621887 0.9834149093 0.9821357613 0.1195390146 0.176534914 0.2390467951
HepG2 CEBPB forskolin 0.972425369 0.9762431589 0.9800007912 0.3135871968 0.3492247828 0.3732403215
HepG2 CEBPB None 0.977058861 0.9786490304 0.9809749382 0.5495075473 0.578317969 0.5878052903
HepG2 CHD2 None 0.970338458 0.9744224356 0.9784246314 0.1695735024 0.1735097977 0.2059582571
HepG2 c-Jun None 0.971476918 0.978725691 0.9807135168 0.2930106352 0.3534419384 0.3690516234
HepG2 COREST None 0.954514827 0.9627896881 0.9639717809 0.124740978 0.1428501679 0.1508492291
HepG2 ERRA forskolin 0.974446616 0.9721820137 0.97969149 0.0444135007 0.0442407683 0.068160706
HepG2 GRp20 forskolin 0.995746624 0.9882704964 0.993490472 0.1770628196 0.1694147823 0.2143978799
HepG2 HNF4A forskolin 0.96533547 0.9751489054 0.9753982569 0.2164925704 0.2736733855 0.2877306303
HepG2 HSF1 forskolin 0.938378268 0.9546673366 0.9499338908 0.0276789242 0.117965213 0.0977432533
HepG2 IRF3 None 0.96252579 0.9796253831 0.9587462474 0.3505723485 0.3833801114 0.3960797435
HepG2 JunD None 0.971357556 0.9789559287 0.9794703069 0.4572702957 0.5635122092 0.557782156
HepG2 MafF None 0.97621061 0.9741433897 0.9786240681 0.5173007103 0.5210778447 0.557013944
HepG2 MafK None 0.982220392 0.976950271 0.9821081632 0.6808233258 0.674506345 0.7166454229
HepG2 MafK None 0.978928306 0.9735920633 0.9799804596 0.5427906177 0.5361386285 0.5857222781
HepG2 Max None 0.97537436 0.9787578082 0.9803796961 0.3376552104 0.3670900728 0.3815914646
HepG2 MAZ None 0.9755044 0.9781791257 0.9797186692 0.3761549076 0.4058252686 0.4155539509
HepG2 Mxi1 None 0.962458524 0.9677889048 0.9716621836 0.409133848 0.4384522371 0.459995062
HepG2 Nrf1 None 0.993560086 0.9891206806 0.99520519 0.3687796018 0.5115930905 0.460824168
HepG2 p300 None 0.947080433 0.956166629 0.9602072781 0.1131163299 0.142860189 0.1592406137
HepG2 PGC1A forskolin 0.923869356 0.9326227878 0.9379826192 0.0179598406 0.0405256663 0.0311145453
HepG2 Pol2 forskolin 0.958010755 0.9615836602 0.9621819668 0.4003811875 0.4238001228 0.4293972451
HepG2 Pol2 None 0.940325898 0.9453190288 0.9511087619 0.4018628553 0.4260174661 0.4359467563
HepG2 Pol2(phosphoS2) None 0.844868067 0.8581569071 0.8627773289 0.0774637746 0.08102546 0.080839601
HepG2 Rad21 None 0.981928132 0.9854983477 0.9869685849 0.5838942442 0.6189287455 0.629192897
HepG2 RFX5 None 0.897626983 0.9127508282 0.9194211039 0.2368650033 0.2450791488 0.2675597859
HepG2 SMC3 None 0.97976786 0.9836429365 0.9854432516 0.5949143371 0.6250749104 0.634544185
HepG2 SREBP1 NA 0.980876577 0.9831756594 0.9866502313 0.1769249135 0.1935396233 0.2305351255
HepG2 TBP None 0.950510123 0.9557388547 0.9609466688 0.3415372568 0.3581089208 0.3738284719
HepG2 TCF7L2 None 0.899442773 0.9038006303 0.9297832294 0.0452437007 0.0502207626 0.0650570568
HepG2 TR4 None 0.955447688 0.9624911553 0.9640745092 0.1619391492 0.1719670663 0.1838263468
HepG2 USF2 None 0.988657533 0.9890982433 0.9887737187 0.3233984481 0.3635448823 0.3834066078
HepG2 ZNF274 None 0.581511778 0.6670968366 0.7275367351 3.08E-005 4.57E-005 4.47E-005
HUVEC c-Fos None 0.943040764 0.9487503928 0.9514795891 0.4358094152 0.4581633877 0.4696052398
HUVEC c-Jun None 0.954824284 0.9597116124 0.963484394 0.3315946609 0.3441445349 0.3615544309
HUVEC GATA2 None 0.903775129 0.9064635804 0.9132200497 0.2605976416 0.2780224339 0.2890174567
HUVEC Max None 0.982212477 0.9852562828 0.984702898 0.2980944365 0.3289242773 0.3460876403
HUVEC Pol2 None 0.919660131 0.9263211135 0.9220596619 0.2874975035 0.2976915518 0.3020382927
IMR90 CEBPB None 0.957708483 0.9637558238 0.9650904318 0.4919401381 0.5420531576 0.5401249531
IMR90 CTCF None 0.981451777 0.9842912699 0.9864397146 0.6523086521 0.6798995739 0.688950478
IMR90 MafK None 0.969615656 0.9657285516 0.9721700967 0.4775199829 0.4808510652 0.5147301608
IMR90 Pol2 None 0.927833154 0.937206881 0.9380889128 0.3818104049 0.4024431401 0.3991847654
IMR90 Rad21 None 0.972486883 0.9766567544 0.9784386487 0.5413565194 0.5734305941 0.5818752134
K562 ARID3A None 0.934062532 0.9391425527 0.9455237214 0.1087013446 0.1250696444 0.1390694186
K562 ATF1 None 0.963418585 0.9672234155 0.9700869407 0.2570334661 0.2711906 0.2815419744
K562 ATF3 None 0.973900614 0.9828363322 0.9835288124 0.2727262125 0.304604719 0.3115346942
K562 Bach1 None 0.950839028 0.9436074736 0.9594276228 0.1821638931 0.1827378884 0.2241930902
K562 BDP1 None 0.962916158 0.9855939079 0.9856282881 0.02438521 0.1444657232 0.0849190659
K562 BHLHE40 None 0.947173928 0.9536344182 0.9551671176 0.2524667175 0.2781837559 0.2955396696
K562 BRF1 None NA (No positive in Test region) NA (No positive in Test region) NA (No positive in Test region) NA (No positive in Test region) NA (No positive in Test region) NA (No positive in Test region)
K562 BRF2 None 0.74819253 0.7724808411 0.7803056277 0.0009795952 0.0014624101 0.0016285697
K562 Brg1 None 0.918584226 0.9218355805 0.9342219554 0.0479995425 0.0858655159 0.0751181881
K562 CCNT2 None 0.965327055 0.9685694122 0.9708003507 0.4608400929 0.4762241784 0.4806962995
K562 CEBPB None 0.960665533 0.9666298204 0.9680735257 0.3613216701 0.4150668701 0.412074842
K562 c-Fos None 0.985619676 0.9885708426 0.9878148693 0.3026929829 0.3863038538 0.3706404057
K562 CHD2 None 0.964351433 0.9724745702 0.9739243327 0.250524291 0.2900019285 0.3201981118
K562 c-Jun IFNa30 0.964481926 0.9714108495 0.9736695755 0.2360376418 0.2539203201 0.2679488202
K562 c-Jun IFNa6h 0.973187226 0.9764013741 0.9783773265 0.2101917392 0.2369280038 0.2448974561
K562 c-Jun IFNg30 0.966103179 0.9688250143 0.9728571751 0.2380527252 0.2524485802 0.2647302574
K562 c-Jun IFNg6h 0.970025495 0.9731121602 0.976838734 0.2421054547 0.2582823528 0.2793040465
K562 c-Jun None 0.980988424 0.984443504 0.9853087182 0.2611140981 0.2636396669 0.2751547332
K562 c-Myc IFNa30 0.966540975 0.9728478807 0.9729499533 0.2519688919 0.2922449667 0.305405802
K562 c-Myc IFNa6h 0.959245505 0.9650735567 0.9668557068 0.2636892069 0.3016570054 0.3212834487
K562 c-Myc IFNg30 0.945047181 0.9522589817 0.9548750288 0.3691681549 0.4129032512 0.4171942304
K562 c-Myc IFNg6h 0.944248372 0.9524571882 0.9546665539 0.307861141 0.341884344 0.3526749785
K562 c-Myc None 0.940281022 0.9514997452 0.9528958563 0.3350527649 0.372841064 0.3825290469
K562 c-Myc None 0.97813479 0.9847799238 0.983466606 0.2001988236 0.2393153863 0.2680609717
K562 COREST None 0.90852965 0.9216249359 0.9278027356 0.0908301481 0.1114428789 0.1240380537
K562 COREST None 0.910644066 0.919859629 0.9242951647 0.2252629956 0.2588015808 0.2674827525
K562 CTCF None 0.981151975 0.9842335227 0.9858823887 0.5696212872 0.60917709 0.6219490554
K562 E2F4 None 0.99107002 0.9917196327 0.9919605522 0.4184436898 0.4401530067 0.4370225731
K562 E2F6 None 0.965098778 0.9702246006 0.9700180837 0.3305398437 0.3481893039 0.3539006679
K562 ELK1 None 0.974589357 0.9784537379 0.9753326227 0.4136783169 0.4441093304 0.4177791387
K562 GATA1 None 0.978051988 0.9807040913 0.980481771 0.1682315749 0.2216134416 0.2316192952
K562 GATA2 None 0.961217893 0.9612273609 0.9644461882 0.2126801834 0.2434963081 0.2642987212
K562 GTF2B None 0.954309796 0.9541906051 0.9548652815 0.1176004091 0.1200848055 0.1353151171
K562 GTF2F1 None 0.96506466 0.9677719231 0.9625312161 0.171097575 0.1635415889 0.170076579
K562 HMGN3 None 0.976333515 0.9782441732 0.979397291 0.4622290315 0.4760330677 0.4756086476
K562 Ini1 None 0.901901388 0.9071662568 0.9204009093 0.0336110878 0.0385238151 0.0357654519
K562 IRF1 IFNa30 0.951022563 0.9514747967 0.9575021675 0.0386066173 0.1142969593 0.0977089268
K562 IRF1 IFNa6h 0.958966786 0.9701867516 0.9677568217 0.1847280829 0.2503923405 0.2547991781
K562 IRF1 IFNg30 0.948844348 0.9586937083 0.9591777311 0.2302324275 0.2747917465 0.277756562
K562 IRF1 IFNg6h 0.980912905 0.9852577293 0.9849634923 0.5501279067 0.5709988117 0.5779082967
K562 JunD None 0.947257027 0.9536185696 0.9552887628 0.3435554085 0.3660137276 0.3807936015
K562 KAP1 None 0.925209972 0.9400334827 0.9491108825 0.157878409 0.201032915 0.2088290385
K562 MafF None 0.963101561 0.9554674341 0.9684742861 0.3689656423 0.3667760256 0.4044569455
K562 MafK None 0.965006155 0.9592753598 0.9704801062 0.3444216999 0.3599519393 0.3899762238
K562 Max None 0.94846597 0.9557053353 0.9573863871 0.360380742 0.390771066 0.3972594861
K562 MAZ None 0.960352133 0.9661639201 0.967374813 0.4505824153 0.486423036 0.4840890014
K562 Mxi1 None 0.967138875 0.9727030543 0.9719194586 0.1992709656 0.2401873071 0.2367753984
K562 NELFe None 0.964381961 0.9732969122 0.9566703976 0.0415701794 0.0861384577 0.0735934488
K562 NF-E2 None 0.977988324 0.9742489751 0.9877401353 0.1569331325 0.1501391405 0.1790071177
K562 NF-YA None 0.987424696 0.9922700527 0.990801199 0.354487204 0.4179446045 0.4326182044
K562 NF-YB None 0.98470109 0.9884350516 0.9870534658 0.5119024821 0.576932268 0.5716654409
K562 Nrf1 None 0.983965801 0.9862416379 0.9823769791 0.3438405823 0.4230226749 0.3984643887
K562 p300 None 0.923888769 0.9316272593 0.9392382482 0.2285923842 0.2470760059 0.2788665303
K562 Pol2 IFNa30 0.963741275 0.9676227508 0.9660172289 0.442209667 0.4806516352 0.4784136624
K562 Pol2 IFNa6h 0.96184002 0.9662335091 0.9660957085 0.4435149581 0.4758224123 0.4677408262
K562 Pol2 IFNg30 0.958878363 0.965031109 0.9641262052 0.4349475879 0.4741292248 0.473573784
K562 Pol2 IFNg6h 0.960834777 0.9647754736 0.9641944955 0.4928738799 0.5347168988 0.5293268756
K562 Pol2 None 0.917259479 0.924504988 0.9277509149 0.1272429014 0.1462572541 0.1540752166
K562 Pol2(phosphoS2) None 0.886828058 0.8927657449 0.8910725691 0.0834586811 0.0899313936 0.0916620738
K562 Pol2(phosphoS2) None 0.797058054 0.8120251956 0.8086756199 0.0082317638 0.0131570372 0.015171423
K562 Pol2 None 0.960974957 0.9652734728 0.9650338462 0.4816115689 0.5152471067 0.5059679825
K562 Pol3 None 0.890884397 0.9403193692 0.9625380751 2.01E-005 3.68E-005 5.87E-005
K562 Rad21 None 0.993792069 0.9946906954 0.9951200454 0.5798398162 0.6071512411 0.621012042
K562 RFX5 None 0.859807842 0.8913547148 0.8738947526 0.0469636853 0.0703747609 0.0700842696
K562 RPC155 None 0.927892057 0.9389298964 0.9376706098 0.0439444726 0.1063860965 0.0848134052
K562 SETDB1 MNaseD 0.906713255 0.9291423427 0.9271812763 0.0795104171 0.1082978351 0.1212712882
K562 SETDB1 None 0.947483511 0.9563614794 0.958453705 0.0834718243 0.1208767547 0.1218054134
K562 SIRT6 None 0.961653335 0.9682838091 0.971255932 0.0714029533 0.1049010697 0.1142701763
K562 SMC3 None 0.988945081 0.9908611659 0.9915263101 0.6372524144 0.6694034166 0.6752234197
K562 STAT1 IFNa30 0.95395197 0.9689457661 0.9737647372 0.0531801834 0.1284980816 0.1039309194
K562 STAT1 IFNa6h 0.947853716 0.9570563248 0.9617451139 0.0324300423 0.0968913262 0.0697141601
K562 STAT1 IFNg30 0.943786192 0.9615689588 0.9674549482 0.1132095327 0.1842403477 0.1784704542
K562 STAT1 IFNg6h 0.938983932 0.9654779307 0.9646320419 0.0731234411 0.1176625463 0.1005487853
K562 STAT2 IFNa30 0.963029732 0.9727057901 0.9731185763 0.0622482816 0.1191596187 0.1128838625
K562 STAT2 IFNa6h 0.945908447 0.9597572445 0.9623083047 0.0425176946 0.1311167129 0.0800372016
K562 TAL1 None 0.95609869 0.9577860829 0.9652070231 0.3195901798 0.3451966146 0.3973983428
K562 TBLR1 None 0.938348496 0.9433329617 0.9444787571 0.0863531312 0.1325628509 0.1267848296
K562 TBLR1 None 0.957451023 0.9601557343 0.9644588629 0.1816055513 0.205592704 0.2120731592
K562 TBP None 0.944047109 0.950474196 0.9513945047 0.3473851595 0.3731390894 0.3722378023
K562 TFIIIC-110 None 0.896968084 0.9116102186 0.9060624384 0.0438442985 0.0806191684 0.0661074666
K562 TR4 None 0.93742265 0.9083330904 0.9230971339 0.0235446551 0.0554128128 0.0330123186
K562 UBF None 0.978336658 0.9817429685 0.9807419504 0.1982602625 0.221139982 0.2164342306
K562 UBTF None 0.963889909 0.9656844182 0.9648731504 0.2804650586 0.2861085577 0.2847365445
K562 USF2 None 0.980823973 0.9861606442 0.9832642084 0.3883038401 0.4130545066 0.4169099124
K562 YY1 None 0.989605582 0.9905754486 0.9900878273 0.4080076526 0.4191616678 0.4173644024
K562 Znf143 None 0.947255308 0.9564911159 0.9599244267 0.5250592272 0.5776746894 0.5778401377
K562 ZNF263 None 0.958072088 0.9618142162 0.9619672154 0.1362665987 0.1434349157 0.1453186384
K562 ZNF274 None 0.907017758 0.9113510333 0.9211295225 0.241459744 0.3359252143 0.3216119092
K562 ZNF274 None 0.955764053 0.9522797291 0.9511921323 0.335516309 0.4317187828 0.3626646715
MCF10A-Er-Src c-Fos EtOH_0.01pct 0.963784786 0.9684605521 0.9701119804 0.508411464 0.5266147879 0.5346144893
MCF10A-Er-Src c-Fos 4OHTAM_1uM_12hr 0.959944882 0.9648792331 0.9657713751 0.5488466043 0.5691102469 0.5757134619
MCF10A-Er-Src c-Fos 4OHTAM_1uM_4hr 0.958512878 0.9644488446 0.9656945242 0.5166305733 0.5406689543 0.5467986113
MCF10A-Er-Src c-Fos 4OHTAM_1uM_36hr 0.966971328 0.9706667032 0.9711136569 0.5528743707 0.5660738709 0.5719023362
MCF10A-Er-Src c-Myc EtOH_0.01pct 0.935641807 0.9460528179 0.9488038105 0.3152832893 0.3507919313 0.3561323378
MCF10A-Er-Src c-Myc 4OHTAM_1uM_4hr 0.943119387 0.9529758204 0.9544410135 0.3018918606 0.325546451 0.3423066275
MCF10A-Er-Src E2F4 4OHTAM_1uM_36hr 0.951546023 0.9578803519 0.9575323622 0.348864744 0.3611082299 0.3662970698
MCF10A-Er-Src Pol2 EtOH_0.01pct 0.919756971 0.9278421751 0.9268899342 0.4771043033 0.4925724591 0.4926149051
MCF10A-Er-Src Pol2 4OHTAM_1uM_36hr 0.935138106 0.940105597 0.9396333753 0.5072873685 0.5294196952 0.5291784537
MCF10A-Er-Src STAT3 EtOH_0.01pct_4hr 0.938500045 0.9500152278 0.9532146667 0.3591432162 0.3963202814 0.4100645621
MCF10A-Er-Src STAT3 EtOH_0.01pct_12hr 0.938311222 0.9481845757 0.9518791759 0.3579766226 0.3880214669 0.4070306011
MCF10A-Er-Src STAT3 EtOH_0.01pct 0.948802012 0.9605165946 0.9642676054 0.2245163806 0.2556532506 0.2767378665
MCF10A-Er-Src STAT3 4OHTAM_1uM_12hr 0.940365076 0.9494282427 0.9530013091 0.344302482 0.375027323 0.3924705518
MCF10A-Er-Src STAT3 4OHTAM_1uM_36hr 0.935409158 0.9462393329 0.9494939886 0.3813530035 0.4260344184 0.4426638478
MCF-7 GATA3 None 0.882689026 0.8808270538 0.893885959 0.1337826388 0.1439164507 0.1607058761
MCF-7 GATA3 None 0.884446632 0.8884568815 0.9025032036 0.0738016682 0.0731175998 0.0964362635
MCF-7 HA-E2F1 None 0.948594117 0.9566382961 0.9587931759 0.4420111846 0.4640117028 0.461920568
MCF-7 TCF7L2 None 0.854328689 0.8751404052 0.8836378287 0.0935339081 0.1234305964 0.1345874645
MCF-7 ZNF217 None 0.845105762 0.8879042483 0.8977062406 0.1105046273 0.167044987 0.1885858243
NB4 c-Myc None 0.951126091 0.9592759671 0.960172935 0.3152592223 0.3646180691 0.3684373926
NB4 Max None 0.949470627 0.9585663422 0.9584721242 0.3449586106 0.3955546107 0.393987281
NB4 Pol2 None 0.97445289 0.9758462393 0.9752251607 0.505064049 0.5361264984 0.5323969252
NT2-D1 SUZ12 None 0.96806588 0.972292737 0.9725613594 0.2079327202 0.2427749575 0.2422762388
NT2-D1 YY1 None 0.978374342 0.9830058849 0.9830834964 0.3141474818 0.3636984595 0.344061629
NT2-D1 ZNF274 None 0.91620714 0.9249288171 0.9204906683 0.3035398083 0.3448341944 0.2966121865
PANC-1 TCF7L2 None 0.848677092 0.8597834968 0.8779486188 0.082182932 0.0946832937 0.1018101092
PBDEFetal GATA1 None 0.977962325 0.9793327679 0.9800145775 0.1531850467 0.1885067031 0.2365583007
PBDE GATA1 None 0.915923306 0.9275206094 0.9304194504 0.2614663212 0.3048258671 0.3268971943
PBDE Pol2 None 0.952697224 0.9577033236 0.9562359448 0.5011057766 0.5299800163 0.5310562774
Raji Pol2 None 0.951517191 0.950649667 0.9533847209 0.5563462454 0.5758574674 0.5774872492
SH-SY5Y GATA2 None 0.917607875 0.9139864831 0.921388512 0.3070148238 0.3088512512 0.3294331456
SH-SY5Y GATA3 None 0.922760288 0.9237149565 0.9318836841 0.2065588378 0.2194866895 0.2467320274
U2OS KAP1 None 0.847567839 0.871573801 0.8790980947 0.1209258809 0.1452818469 0.1476926416
U2OS SETDB1 None 0.891739628 0.9055654324 0.910909404 0.3539622489 0.4152090289 0.4331705866
K562 eGFP-FOS None 0.980419497 0.9820375392 0.9825655142 0.318198062 0.3383593479 0.3396571851
K562 eGFP-GATA2 None 0.933816856 0.9377676027 0.9437693542 0.1874983638 0.2026203621 0.2275357713
K562 eGFP-HDAC8 None 0.885867671 0.8963648833 0.9015019529 0.0204912692 0.0244857493 0.0313144337
K562 eGFP-JunB None 0.959344023 0.9629214265 0.9645038013 0.2308506361 0.2645308548 0.2651005374
K562 eGFP-JunD None 0.919036699 0.9278493559 0.9317507533 0.2650104548 0.2934146821 0.3018865974
A549 CTCF None 0.97943824 0.9852409592 0.9864813315 0.634364492 0.6822922475 0.6886501668
A549 Pol2 None 0.983537983 0.9845859072 0.9848060617 0.4758166407 0.5014422642 0.5061631991
Fibrobl CTCF None 0.981667872 0.9859475549 0.9865289498 0.5879522506 0.6286493432 0.6373643567
Gliobla CTCF None 0.979205239 0.983514676 0.9847879735 0.6533898409 0.682350819 0.6927915837
Gliobla Pol2 None 0.982239475 0.9831471308 0.9833126761 0.4484269974 0.479842232 0.4839272764
GM12878 c-Myc None 0.981507603 0.982223037 0.983075606 0.2549075212 0.3050488911 0.3267080517
GM12878 CTCF None 0.98547325 0.9888679029 0.989356631 0.6122115296 0.6454336376 0.6507174182
GM12878 Pol2 None 0.942645883 0.9457589203 0.94398137 0.4203826654 0.4438860807 0.4428656132
GM12891 CTCF None 0.98203375 0.986917685 0.9869800275 0.5649951703 0.619215016 0.6260689435
GM12892 CTCF None 0.976850556 0.9838173802 0.9840161027 0.5557373624 0.6069473908 0.6099822526
GM19238 CTCF None 0.977065791 0.983717163 0.9843497075 0.5913270913 0.6448719879 0.6517945125
GM19239 CTCF None 0.981206568 0.9854088462 0.9863621522 0.5228896013 0.5787069864 0.5869761929
GM19240 CTCF None 0.982284463 0.9873484077 0.987426194 0.613320057 0.6616209455 0.6630247534
H1-hESC c-Myc None 0.912264644 0.9194903178 0.9179522295 0.0250503538 0.022574465 0.020449743
H1-hESC CTCF None 0.986843822 0.9908473757 0.9916254659 0.5461145512 0.6243978119 0.6397933306
H1-hESC Pol2 None 0.955230213 0.9604060543 0.9612253606 0.4525427631 0.4678089721 0.4716766638
HeLa-S3 c-Myc None 0.953793902 0.9616376105 0.9625193135 0.0947385611 0.1198202865 0.1258692011
HeLa-S3 CTCF None 0.983390667 0.9871115413 0.9882833911 0.587809246 0.6287037459 0.6362723607
HeLa-S3 Pol2 None 0.949030559 0.9527597484 0.9511432642 0.4991348169 0.5326713636 0.5311097962
HepG2 c-Myc None 0.985493686 0.9876188275 0.9875461328 0.1468443771 0.2003418136 0.2371182068
HepG2 CTCF None 0.993867968 0.9955324582 0.995720875 0.7347990283 0.764153341 0.771240209
HepG2 Pol2 None 0.935757735 0.9421611486 0.9431608 0.3928996726 0.4074481721 0.4131826108
HUVEC c-Myc None 0.97741601 0.9812138786 0.9801907348 0.1704759298 0.1971586933 0.2121033697
HUVEC CTCF None 0.985417704 0.9881278773 0.9890396384 0.5559284224 0.588793724 0.6004387517
HUVEC Pol2 None 0.977861799 0.9788580936 0.9783578767 0.4552188304 0.5010767595 0.5065756864
K562 c-Myc None 0.978468129 0.9818984289 0.981977419 0.2043344272 0.2465485727 0.25864734
K562 CTCF None 0.985276433 0.9883184645 0.9895367714 0.593767632 0.6289346951 0.6358901528
K562 Pol2 None 0.948191162 0.9546250396 0.9536266877 0.4314425316 0.4643546708 0.4559514313
MCF-7 c-Myc estrogen 0.95436269 0.9627683266 0.9655566448 0.2040085188 0.2385317868 0.2594906586
MCF-7 c-Myc serum_stimulated_media 0.969123341 0.9722531766 0.9734801499 0.3539128017 0.3768946309 0.3920640089
MCF-7 c-Myc serum_starved_media 0.964784201 0.9678507409 0.9676389063 0.1435316952 0.1779885319 0.1766228014
MCF-7 c-Myc vehicle 0.949546075 0.9595068193 0.9609970159 0.3586178619 0.3953353822 0.4082976544
MCF-7 CTCF estrogen 0.980948526 0.9846674935 0.9859609727 0.5852836465 0.6521294775 0.6604820439
MCF-7 CTCF serum_stimulated_media 0.980036951 0.9835620545 0.9844487351 0.6039451503 0.6442456539 0.648550554
MCF-7 CTCF serum_starved_media 0.978199867 0.9826405646 0.9833364484 0.582998545 0.6232193025 0.6300535026
MCF-7 CTCF None 0.979445883 0.984418652 0.9851506937 0.5992568532 0.6440205591 0.652074639
MCF-7 CTCF vehicle 0.975924418 0.9811237603 0.9826726276 0.6429636728 0.6833826518 0.6894038223
MCF-7 Pol2 serum_stimulated_media 0.97466673 0.9760946349 0.9763034458 0.5537711966 0.5817102039 0.5851307814
MCF-7 Pol2 serum_starved_media 0.97222939 0.9743369827 0.9741474115 0.4714502389 0.5028120103 0.5022073008
MCF-7 Pol2 None 0.929799688 0.9350954604 0.9357745583 0.3923924946 0.4148724665 0.4102451952
NHEK CTCF None 0.980631381 0.986267542 0.9869974926 0.6232304816 0.6680686323 0.6734871582
ProgFib CTCF None 0.983642828 0.9877449728 0.9884029893 0.5624671566 0.615093159 0.6193981952
ProgFib Pol2 None 0.951535351 0.9539642157 0.9532977309 0.4243827051 0.4517958387 0.4513854255
A549 CTCF None 0.979687352 0.9835144853 0.9855156747 0.6436818089 0.6889449559 0.7047235443
AG04449 CTCF None 0.983731802 0.9864274423 0.9878542937 0.6184795282 0.6574918937 0.6589745126
AG04450 CTCF None 0.976416475 0.9803404694 0.9832773112 0.6190081946 0.654670732 0.6667782941
AG09309 CTCF None 0.982668654 0.9862567977 0.987488322 0.6632647686 0.7027894713 0.7155834297
AG09319 CTCF None 0.978336314 0.9816625496 0.9835436525 0.6486175458 0.6810816018 0.6919745276
AG10803 CTCF None 0.977383406 0.9814808001 0.9836928361 0.6204530897 0.6498434737 0.6628024584
AoAF CTCF None 0.979360564 0.9830636763 0.9845727481 0.598640769 0.635875111 0.6458501586
BE2_C CTCF None 0.974790176 0.9796246062 0.9815985316 0.6629807575 0.6893772406 0.7026572718
BJ CTCF None 0.97794502 0.9814425689 0.9834981576 0.6566954202 0.6877814739 0.6971624875
Caco-2 CTCF None 0.988277636 0.9908286144 0.9916066473 0.6859076405 0.71033521 0.7230363795
GM06990 CTCF None 0.98146852 0.9852277674 0.9862333408 0.6522628273 0.6889207705 0.6983274347
GM12801 CTCF None 0.996388547 0.9953458122 0.9970761167 0.262530792 0.3311145781 0.3156353128
GM12864 CTCF None 0.98151416 0.9846504534 0.9860605255 0.6589525918 0.6918374579 0.7073420905
GM12865 CTCF None 0.98390459 0.9870662366 0.9879795883 0.6762328666 0.707483546 0.721661871
GM12872 CTCF None 0.98152822 0.9843798705 0.9859284124 0.6606721204 0.6913432817 0.710295133
GM12873 CTCF None 0.978608357 0.9831937621 0.9847130084 0.6683007765 0.7047957857 0.7166120086
GM12874 CTCF None 0.988394464 0.9901986458 0.9911804825 0.6628420778 0.6996436124 0.7119373728
GM12875 CTCF None 0.987006149 0.989213454 0.9902034153 0.661661065 0.6979438148 0.7139402552
GM12878 CTCF None 0.987368435 0.9893447954 0.9906678015 0.6692351969 0.7092044344 0.7241019391
HAc CTCF None 0.975613821 0.9798392204 0.982014569 0.6441960059 0.6786092417 0.6907878784
HA-sp CTCF None 0.983502301 0.9863719045 0.9877767541 0.6661068791 0.7014041713 0.7101149886
HBMEC CTCF None 0.975665601 0.9800162517 0.9822821308 0.6549571456 0.6902909769 0.7020135332
HCFaa CTCF None 0.983294086 0.9861855774 0.9877353184 0.6403265252 0.6730266411 0.6876812422
HCM CTCF None 0.973604251 0.9784178921 0.9801124412 0.6579124509 0.6910412395 0.702937013
HCPEpiC CTCF None 0.973270922 0.9772286972 0.9796452014 0.653758508 0.6826491567 0.696569071
HCT-116 CTCF None 0.980597414 0.9842567521 0.9864037722 0.6560473552 0.687327747 0.7007447474
HEEpiC CTCF None 0.977437764 0.9820767832 0.984083028 0.6365819992 0.6737203457 0.6822350963
HEK293 CTCF None 0.985172767 0.9884973948 0.9897097693 0.6535256458 0.690025418 0.7070159064
HeLa-S3 CTCF None 0.986136886 0.9886791267 0.9898866619 0.6475668682 0.6841937577 0.7016434011
HepG2 CTCF None 0.985827054 0.9885907841 0.9900503703 0.6458350738 0.6981071248 0.7101281676
HFF CTCF None 0.985359606 0.9878920586 0.9892274307 0.6502645795 0.6806507575 0.6913464373
HFF-Myc CTCF None 0.979757933 0.9832194472 0.9851106451 0.6720929806 0.7058487057 0.7220906358
HL-60 CTCF None 0.99534579 0.9964539538 0.9963882656 0.6719854829 0.7162271327 0.7213985799
HMEC CTCF None 0.976528422 0.9820951465 0.9841888842 0.6452989091 0.6846393313 0.6971786094
HMF CTCF None 0.979291738 0.9823873848 0.9843323321 0.642813225 0.6790010372 0.6912620016
HPAF CTCF None 0.974620232 0.9786277864 0.9812772568 0.6569568246 0.6891918549 0.6993529624
HPF CTCF None 0.980724019 0.9837574936 0.9856762945 0.6254417713 0.6579455483 0.6692696342
HRE CTCF None 0.983126406 0.9862219651 0.9876128498 0.6547078271 0.6899446179 0.7031286346
HRPEpiC CTCF None 0.982951122 0.9856156775 0.9873026534 0.6554673855 0.691513455 0.701818171
HUVEC CTCF None 0.987347169 0.98933668 0.9907458115 0.6685874614 0.6989467976 0.7117877305
HVMF CTCF None 0.97860556 0.9826177938 0.9847582666 0.6556989052 0.6919562649 0.7025413595
K562 CTCF None 0.985286372 0.9879720679 0.9892988855 0.6362143562 0.6786052834 0.6914938274
MCF-7 CTCF None 0.979258003 0.9829565056 0.9847807514 0.6317482051 0.6684723725 0.6790873808
NB4 CTCF None 0.9896524 0.9912005647 0.9920472408 0.6774548825 0.7123401532 0.7219869959
NHDF-neo CTCF None 0.973276768 0.9775043029 0.980357983 0.6277904411 0.6574463533 0.6684000909
NHEK CTCF None 0.980588747 0.9847427439 0.9865238478 0.6511940384 0.6939337318 0.702404389
NHLF CTCF None 0.981196103 0.9847984869 0.9865292986 0.5986568508 0.6361550939 0.6496131843
RPTEC CTCF None 0.976169465 0.9808942024 0.9833661054 0.7018637467 0.7354453655 0.7459585685
SAEC CTCF None 0.985076566 0.987506187 0.9890320487 0.6749445408 0.704766648 0.7148845286
SK-N-SH_RA CTCF None 0.987171383 0.9893747767 0.9903807755 0.6760556135 0.7009598675 0.7120835834
WERI-Rb-1 CTCF None 0.984834186 0.9882083673 0.9894220417 0.6258399563 0.6699902575 0.6852139695
WI-38 CTCF None 0.934407177 0.9415380569 0.9465819889 0.6887911683 0.7130838079 0.7255293238
H1-hESC H2AK5ac None 0.852599169 0.854419934 0.8561582159 0.3477778841 0.3581539389 0.3579776436
H1-hESC H2AZ None 0.880007212 0.8832374816 0.8871899401 0.1616547769 0.1694169117 0.1752259634
H1-hESC H2BK120ac None 0.79927369 0.810604665 0.8163277808 0.0558695687 0.0696698588 0.0823048758
H1-hESC H2BK12ac None 0.857873957 0.8624424789 0.8663964897 0.1615870082 0.1706132358 0.178968358
H1-hESC H2BK15ac None 0.887357172 0.8877396686 0.8912001794 0.1234058579 0.1195628325 0.1244528457
H1-hESC H2BK20ac None 0.824878544 0.8301233517 0.8387192216 0.0557121031 0.0611895815 0.0720371355
H1-hESC H2BK5ac None 0.854260176 0.8626338187 0.8681665624 0.2330776027 0.2467524507 0.2595484192
H1-hESC H3K14ac None 0.887574475 0.8947536836 0.8953682251 0.0677252321 0.0732038497 0.0746380092
H1-hESC H3K18ac None 0.855361559 0.8602512305 0.8642925068 0.3220196615 0.3346568735 0.3422921394
H1-hESC H3K23ac None 0.870666876 0.8726540782 0.8723437514 0.050421386 0.0507011538 0.054306288
H1-hESC H3K23me2 None 0.955764483 0.9582963183 0.9591367444 0.5096895409 0.5300437341 0.5362555966
H1-hESC H3K27ac None 0.85577742 0.8651904248 0.8731465121 0.4039985175 0.430010867 0.4436935957
H1-hESC H3K27me3 None 0.879300676 0.8834539436 0.8842837308 0.4456224156 0.4684332076 0.4713907477
H1-hESC H3K36me3 None 0.789815069 0.8030492517 0.8056884221 0.1845510422 0.2095461868 0.2124096666
H1-hESC H3K4ac None 0.856771026 0.8665710174 0.8674846505 0.0534762577 0.062165076 0.0697570973
H1-hESC H3K4me1 None 0.848721749 0.8568741855 0.8634689525 0.3559210234 0.3772135902 0.3936794386
H1-hESC H3K4me2 None 0.909884497 0.9175300603 0.9232614248 0.7210142153 0.7403730313 0.7496709582
H1-hESC H3K4me3 None 0.975875068 0.977770481 0.978460547 0.8742301548 0.8831260897 0.8814531352
H1-hESC H3K56ac None 0.899505858 0.9057404747 0.9052512376 0.2986279363 0.3210154139 0.3193659667
H1-hESC H3K79me1 None 0.875457392 0.8788750468 0.8817620633 0.1162473841 0.1189596462 0.1227265618
H1-hESC H3K79me2 None 0.850005808 0.8565250037 0.859920157 0.1246035335 0.1297120546 0.1321584956
H1-hESC H3K9ac None 0.940702611 0.9433224791 0.9455568926 0.6482981757 0.6632430548 0.6642391135
H1-hESC H3K9me3 None 0.822731426 0.8321046412 0.8362938618 0.2275912984 0.2585931421 0.2693038403
H1-hESC H4K20me1 None 0.867600161 0.8708293034 0.8738221661 0.2554766574 0.2605002529 0.2632976267
H1-hESC H4K5ac None 0.858919871 0.8691221694 0.8735366122 0.3147650756 0.3368166242 0.3463993532
H1-hESC H4K8ac None 0.919454075 0.9201573761 0.9201730272 0.4849090605 0.4894548236 0.4894025808
H1-hESC H4K91ac None 0.832206416 0.8411349676 0.8455255484 0.501414705 0.5203134392 0.5296433949
K562 H2AZ None 0.860586294 0.8681109475 0.8705971969 0.4558146462 0.4755502493 0.4748192417
K562 H3K27ac None 0.856293606 0.8666965149 0.8690877695 0.4622216253 0.4864024116 0.4895676929
K562 H3K27me3 None 0.852639587 0.8560830308 0.8573672429 0.0982533857 0.0993487531 0.0979255625
K562 H3K36me3 None 0.787930951 0.796791058 0.7988019666 0.142557417 0.159331738 0.1648155937
K562 H3K4me1 None 0.79713282 0.8079979697 0.8113776338 0.336085661 0.3575600385 0.3681487692
K562 H3K4me2 None 0.878500794 0.8869956816 0.889163566 0.5601163098 0.5822017775 0.5846288945
K562 H3K4me3 None 0.895148203 0.9036289369 0.9041670261 0.5825216305 0.6045901221 0.6021849037
K562 H3K79me2 None 0.808862625 0.8160448702 0.8164867066 0.3381227404 0.3560004725 0.3586087374
K562 H3K9ac None 0.880763544 0.8890009973 0.8893470086 0.5269793832 0.5519283254 0.5494629072
K562 H3K9me1 None 0.879541083 0.8818445518 0.882513382 0.045134338 0.0478725204 0.0494076076
K562 H3K9me3 None 0.852637767 0.8649878937 0.8726852866 0.0696910737 0.0834678822 0.0915095232
K562 H4K20me1 None 0.866490655 0.8703149768 0.8728550624 0.1390754684 0.1510787114 0.1516121135
Monocytes-CD14+RO01746 H2AZ None 0.882343773 0.8887792338 0.8899695324 0.5818127726 0.5995145867 0.5984924021
Monocytes-CD14+RO01746 H3K27ac None 0.797300125 0.806139098 0.8082901864 0.4658676558 0.4866655183 0.4895113661
Monocytes-CD14+RO01746 H3K27me3 None 0.79487771 0.8012487655 0.8020228832 0.4261946829 0.4439775973 0.4421194874
Monocytes-CD14+RO01746 H3K36me3 None 0.756955851 0.767041312 0.770749731 0.2540853711 0.2744152954 0.2788802742
Monocytes-CD14+RO01746 H3K4me1 None 0.807208262 0.8167643581 0.8197776349 0.5183822124 0.5440619068 0.5466017199
Monocytes-CD14+RO01746 H3K4me2 None 0.896572791 0.9030440033 0.9057030886 0.6746255279 0.6951632979 0.6977500104
Monocytes-CD14+RO01746 H3K4me3 None 0.886542685 0.8938658479 0.8967303372 0.6387933437 0.6625141368 0.6637712153
Monocytes-CD14+RO01746 H3K79me2 None 0.769437441 0.7761280719 0.7772863311 0.3033911813 0.3189867894 0.3177647605
Monocytes-CD14+RO01746 H3K9ac None 0.909013415 0.9132690154 0.9136283308 0.6038788423 0.6242576302 0.6209087168
Monocytes-CD14+RO01746 H3K9me3 None 0.819250503 0.8325791143 0.8371220711 0.2922157992 0.3337290792 0.3368616895
Monocytes-CD14+RO01746 H4K20me1 None 0.752118164 0.7578406444 0.7604623758 0.2640966183 0.270723636 0.2728613916
NH-A H2AZ None 0.934543991 0.9392002695 0.9399091969 0.6437496583 0.6629703199 0.6623842773
NH-A H3K27ac None 0.848327563 0.8542354926 0.8585425293 0.5302574079 0.5463726595 0.5528595521
NH-A H3K27me3 None 0.82906793 0.8369093452 0.8382013711 0.2841125709 0.3034164725 0.3064127091
NH-A H3K36me3 None 0.775040075 0.7892603313 0.7907479881 0.1339311254 0.1547194325 0.1588093334
NH-A H3K4me1 None 0.821700313 0.8304620728 0.8344759352 0.5183195833 0.5381410548 0.5433955269
NH-A H3K4me2 None 0.886510301 0.8931699377 0.8960804723 0.700399792 0.7176369585 0.7215997302
NH-A H3K4me3 None 0.927049068 0.9313099343 0.9320655591 0.7079955575 0.7216265635 0.7226247325
NH-A H3K79me2 None 0.792846795 0.798146873 0.8005050776 0.3358301735 0.3503761566 0.3544394817
NH-A H3K9ac None 0.881435935 0.8875260961 0.8900372998 0.6024409751 0.6211545144 0.6238219452
NH-A H3K9me3 None 0.825823587 0.8337961341 0.8404417538 0.1520151689 0.1734896264 0.1831975289
NH-A H4K20me1 None 0.802550874 0.8079022344 0.8101819597 0.2509737201 0.2570375686 0.2605225157
NHDF-Ad H2AZ None 0.931306796 0.9367174587 0.937709383 0.5558069154 0.5793366784 0.577937178
NHDF-Ad H3K27ac None 0.850121839 0.8554689856 0.8597481281 0.4032638485 0.4213770727 0.4292404554
NHDF-Ad H3K27me3 None 0.863633544 0.8713280448 0.8727391571 0.201301708 0.2228935191 0.2315335657
NHDF-Ad H3K36me3 None 0.793156759 0.8063869871 0.8073027439 0.0501394385 0.0638338905 0.0650649444
NHDF-Ad H3K4me1 None 0.797057481 0.8057607535 0.8103393841 0.3359489464 0.3515302348 0.3588099372
NHDF-Ad H3K4me2 None 0.883647778 0.8921135175 0.8952531888 0.58096511 0.6034376713 0.6088256245
NHDF-Ad H3K4me3 None 0.942126729 0.9462047018 0.9460857168 0.6536548136 0.6742294981 0.6734876817
NHDF-Ad H3K79me2 None 0.793253397 0.798341161 0.8001414634 0.2740517041 0.2833860324 0.2886426019
NHDF-Ad H3K9ac None 0.919771445 0.9247334392 0.9256288897 0.565631271 0.58867175 0.587977934
NHDF-Ad H3K9me3 None 0.864055626 0.8776549151 0.8841444113 0.0941720729 0.1247220385 0.1225577509
NHDF-Ad H4K20me1 None 0.806867737 0.8117449971 0.8137530724 0.1643012019 0.1658497171 0.1657284111
NHEK H2AZ None 0.885739743 0.8956652489 0.8990363601 0.5079551702 0.5324983482 0.5337551275
NHEK H3K27ac None 0.834274015 0.8483122487 0.8506502014 0.5050920005 0.5330842291 0.5368595139
NHEK H3K27me3 None 0.863407124 0.8697048507 0.8712294842 0.3752903284 0.3952662538 0.3993363415
NHEK H3K36me3 None 0.792085568 0.7999561275 0.8011173347 0.2167018366 0.2374562719 0.2371179192
NHEK H3K4me1 None 0.792994287 0.8132133538 0.8172787346 0.4688211946 0.5122188934 0.5187199438
NHEK H3K4me2 None 0.857601665 0.8735562199 0.876420776 0.608435773 0.6411839974 0.6443263952
NHEK H3K4me3 None 0.912941488 0.9216491466 0.9221132597 0.6842982774 0.7046821057 0.7032752975
NHEK H3K79me2 None 0.794500485 0.8003556863 0.8016078641 0.3431902128 0.3560726582 0.3598899366
NHEK H3K9ac None 0.885189826 0.8935875722 0.8959025471 0.5893755065 0.6119542401 0.6130664601
NHEK H3K9me1 None 0.825638522 0.8273324413 0.8305537365 0.0578280465 0.0602220842 0.0595818597
NHEK H3K9me3 None 0.816711468 0.8258959928 0.8345254074 0.1414399689 0.1701882645 0.1821615795
NHEK H4K20me1 None 0.807668425 0.8153839223 0.8170854733 0.1030521431 0.1111097606 0.1094073472
NHLF H2AZ None 0.926982544 0.9335734378 0.9340833222 0.5161821139 0.5419271984 0.5419153716
NHLF H3K27ac None 0.851935222 0.8585712996 0.8625349946 0.5026534138 0.5221558294 0.5277363364
NHLF H3K27me3 None 0.849496802 0.8560380923 0.8564923185 0.2692090938 0.2910871011 0.2963368947
NHLF H3K36me3 None 0.881215023 0.887763229 0.8885718027 0.2065267859 0.2269791282 0.2244888146
NHLF H3K4me1 None 0.79589153 0.8054663863 0.8086881293 0.2843854378 0.3002328275 0.3017918915
NHLF H3K4me2 None 0.878682327 0.8869873567 0.8889944586 0.5692631153 0.5892591371 0.5918100879
NHLF H3K4me3 None 0.954684021 0.9582314816 0.9579712716 0.7267258389 0.746217479 0.7420011434
NHLF H3K79me2 None 0.800115089 0.8061569438 0.8065581722 0.3085817869 0.3237493771 0.3263071782
NHLF H3K9ac None 0.9467853 0.9495595781 0.9496488817 0.6639096913 0.6821765783 0.6793136581
NHLF H3K9me3 None 0.904843145 0.9126143963 0.916924719 0.1636607685 0.1929613651 0.1870375612
NHLF H4K20me1 None 0.793365318 0.8059370411 0.803589362 0.0244687879 0.0278311421 0.0268030011
Osteoblasts H2AZ None 0.88644934 0.8940104082 0.8954945067 0.539630734 0.5601726242 0.5593654542
Osteoblasts H3K27ac None 0.807465835 0.815111861 0.8197338723 0.4985397003 0.513862959 0.5220757725
Osteoblasts H3K27me3 None 0.782973876 0.7920978152 0.7929389282 0.2711379423 0.2852360191 0.2882751263
Osteoblasts H3K36me3 None 0.77057732 0.7809714792 0.7839078351 0.201519476 0.2221805502 0.2283720567
Osteoblasts H3K4me1 None 0.793169799 0.8035897924 0.8084505416 0.5010353968 0.5199837254 0.5272421514
Osteoblasts H3K4me2 None 0.86898309 0.8785501479 0.8816511717 0.6366412809 0.6560691864 0.6603864774
Osteoblasts H3K4me3 None 0.913910009 0.9204363533 0.9217600021 0.6801007395 0.6973398 0.6987628534
Osteoblasts H3K79me2 None 0.783730896 0.7899264513 0.7913043755 0.3385628618 0.3519748274 0.3561543399
Osteoblasts H3K9me3 None 0.807280998 0.8165270518 0.823870533 0.1037362926 0.1299171813 0.1307806846
================================================
FILE: data/README.md
================================================
Put .mat files here. You can download them from [DeepSEA] (http://deepsea.princeton.edu/media/code/deepsea_train_bundle.v0.9.tar.gz).
================================================
FILE: motifs/DanQ-JASPAR.meme
================================================
MEME version 4.9.0
ALPHABET= ACGT
strands: + -
Background letter frequencies (from uniform background):
A 0.25000 C 0.25000 G 0.25000 T 0.25000
MOTIF M0 O0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 1324 E= 1337.0e-6
0.222054 0.255287 0.283988 0.238671
0.259819 0.261329 0.231118 0.247734
0.213746 0.253776 0.275680 0.256798
0.258308 0.203927 0.312689 0.225076
0.230363 0.256798 0.319486 0.193353
0.266616 0.210725 0.300604 0.222054
0.246979 0.202417 0.277946 0.272659
0.198640 0.232628 0.301360 0.267372
0.172961 0.298338 0.231118 0.297583
0.087613 0.419940 0.048338 0.444109
0.061178 0.041541 0.081571 0.815710
0.003021 0.003021 0.981118 0.012840
0.111027 0.222054 0.020393 0.646526
0.006798 0.000755 0.991692 0.000755
0.002266 0.003776 0.991692 0.002266
0.004532 0.197130 0.058157 0.740181
0.043051 0.345921 0.080060 0.530967
0.354985 0.086103 0.107251 0.451662
0.204683 0.247734 0.337613 0.209970
0.200906 0.250000 0.347432 0.201662
0.259819 0.240181 0.315710 0.184290
0.222810 0.259063 0.273414 0.244713
0.216012 0.202417 0.302115 0.279456
0.256798 0.219789 0.284743 0.238671
0.239426 0.250000 0.272659 0.237915
0.217523 0.218278 0.283988 0.280211
0.242447 0.240937 0.269637 0.246979
0.249245 0.258308 0.272659 0.219789
0.234894 0.293051 0.230363 0.241692
0.236405 0.257553 0.263595 0.242447
MOTIF M1 O1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 1979 E= 1337.0e-6
0.232946 0.296109 0.236988 0.233957
0.235472 0.282466 0.259222 0.222840
0.253158 0.265791 0.247600 0.233451
0.208186 0.258211 0.293077 0.240526
0.231935 0.256190 0.273876 0.237999
0.232946 0.276908 0.254674 0.235472
0.243052 0.257706 0.279434 0.219808
0.235472 0.280950 0.243557 0.240020
0.250126 0.230925 0.266296 0.252653
0.245579 0.281455 0.262254 0.210712
0.267307 0.295099 0.237999 0.199596
0.218797 0.293077 0.248610 0.239515
0.295604 0.260738 0.209197 0.234462
0.244568 0.293583 0.194543 0.267307
0.360788 0.203133 0.233957 0.202122
0.169277 0.189995 0.206165 0.434563
0.248105 0.179889 0.359778 0.212228
0.042951 0.448711 0.451743 0.056594
0.002527 0.995452 0.000000 0.002021
0.001516 0.852451 0.004042 0.141991
0.053057 0.276908 0.100556 0.569480
0.101061 0.378979 0.435068 0.084891
0.583123 0.110157 0.265791 0.040930
0.146539 0.003537 0.846387 0.003537
0.002527 0.000505 0.993936 0.003032
0.051541 0.528550 0.374432 0.045478
0.253158 0.320869 0.184942 0.241031
0.432542 0.204649 0.213239 0.149570
0.195048 0.224356 0.202122 0.378474
0.275897 0.193027 0.284487 0.246589
MOTIF M2 O2
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2548 E= 1337.0e-6
0.247645 0.254317 0.244898 0.253140
0.286892 0.252355 0.233124 0.227630
0.182889 0.312794 0.222920 0.281397
0.253140 0.326923 0.226845 0.193093
0.227237 0.587127 0.067111 0.118524
0.971743 0.026688 0.001177 0.000392
0.000000 0.060440 0.939168 0.000392
0.000000 0.001962 0.998038 0.000000
0.028650 0.003140 0.005495 0.962716
0.246075 0.008634 0.667582 0.077708
0.356358 0.167582 0.252747 0.223312
0.260989 0.121664 0.392857 0.224490
0.240973 0.219388 0.282182 0.257457
0.260597 0.250000 0.250785 0.238619
0.242936 0.214678 0.290816 0.251570
0.263344 0.244113 0.273155 0.219388
0.229984 0.267268 0.281790 0.220958
0.227630 0.255102 0.279827 0.237441
0.276295 0.244898 0.255887 0.222920
0.220565 0.269231 0.297881 0.212323
0.215071 0.273155 0.261381 0.250392
0.235871 0.248823 0.274333 0.240973
0.222920 0.286892 0.264129 0.226060
0.218210 0.276295 0.254317 0.251177
0.236656 0.236264 0.246860 0.280220
0.204474 0.288854 0.281790 0.224882
0.245290 0.267661 0.233124 0.253925
0.260989 0.240581 0.243328 0.255102
0.267268 0.273155 0.253925 0.205651
0.237049 0.250785 0.251177 0.260989
MOTIF M3 O3
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2527 E= 1337.0e-6
0.226751 0.299169 0.296399 0.177681
0.298378 0.280570 0.273447 0.147606
0.246537 0.272260 0.218837 0.262366
0.125841 0.274634 0.278987 0.320538
0.193510 0.208152 0.223585 0.374753
0.234666 0.146814 0.428967 0.189553
0.207361 0.295607 0.231104 0.265928
0.250890 0.249307 0.287693 0.212109
0.225168 0.210922 0.189553 0.374357
0.201029 0.161061 0.449941 0.187970
0.087455 0.398892 0.326474 0.187178
0.203799 0.018203 0.718639 0.059359
0.006332 0.745944 0.000396 0.247329
0.102097 0.020973 0.874555 0.002374
0.031262 0.008310 0.038385 0.922042
0.011476 0.073605 0.885635 0.029284
0.237831 0.196676 0.285714 0.279778
0.114761 0.209339 0.439256 0.236644
0.227543 0.342699 0.171745 0.258013
0.291650 0.179660 0.358132 0.170558
0.220024 0.257222 0.311832 0.210922
0.215275 0.232687 0.333201 0.218837
0.182825 0.253660 0.295607 0.267907
0.242976 0.233874 0.344282 0.178868
0.199050 0.250099 0.345073 0.205778
0.240602 0.254848 0.305105 0.199446
0.203799 0.274634 0.232687 0.288880
0.269490 0.261179 0.283736 0.185596
0.263158 0.237040 0.259992 0.239810
0.311041 0.249703 0.284131 0.155125
MOTIF M4 O4
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2562 E= 1337.0e-6
0.212724 0.267760 0.312256 0.207260
0.252147 0.287666 0.264247 0.195941
0.231460 0.276347 0.261905 0.230289
0.273614 0.227166 0.288056 0.211163
0.184231 0.255269 0.325527 0.234973
0.153786 0.271272 0.302108 0.272834
0.198673 0.304840 0.285714 0.210773
0.262685 0.279859 0.249415 0.208041
0.270882 0.298595 0.225215 0.205308
0.295472 0.150273 0.405152 0.149102
0.375878 0.051522 0.489461 0.083138
0.089774 0.068696 0.782982 0.058548
0.274785 0.318891 0.176815 0.229508
0.735363 0.060109 0.114364 0.090164
0.017174 0.896565 0.049180 0.037080
0.581187 0.114754 0.135831 0.168228
0.148322 0.236924 0.391101 0.223653
0.207260 0.282592 0.277908 0.232240
0.174083 0.392662 0.299375 0.133880
0.179547 0.126073 0.121390 0.572990
0.044496 0.061671 0.871585 0.022248
0.119438 0.094848 0.072209 0.713505
0.298205 0.124902 0.368462 0.208431
0.071429 0.731460 0.087822 0.109290
0.133099 0.453942 0.077283 0.335675
0.176425 0.389930 0.161983 0.271663
0.176815 0.247853 0.296643 0.278689
0.214286 0.245511 0.283763 0.256440
0.215847 0.248244 0.298205 0.237705
0.227947 0.331382 0.249415 0.191257
MOTIF M5 O5
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2581 E= 1337.0e-6
0.187912 0.347927 0.240992 0.223169
0.341728 0.193723 0.266563 0.197985
0.165052 0.261914 0.351027 0.222007
0.347540 0.213096 0.254552 0.184812
0.227044 0.394033 0.266176 0.112747
0.195661 0.363425 0.199535 0.241379
0.273150 0.256102 0.146842 0.323905
0.360713 0.147617 0.395583 0.096087
0.151104 0.274312 0.285936 0.288648
0.350639 0.253778 0.202635 0.192948
0.364587 0.345215 0.196823 0.093375
0.064704 0.039132 0.041457 0.854707
0.097249 0.578071 0.204184 0.120496
0.297172 0.399070 0.112360 0.191399
0.075552 0.796590 0.040682 0.087176
0.783030 0.046494 0.094150 0.076327
0.122821 0.519179 0.276250 0.081751
0.211158 0.577683 0.149167 0.061991
0.175126 0.211546 0.067416 0.545912
0.605192 0.097249 0.112747 0.184812
0.105773 0.227819 0.445564 0.220845
0.105773 0.216970 0.460674 0.216583
0.129020 0.162728 0.099186 0.609066
0.138706 0.048431 0.705928 0.106935
0.213096 0.169314 0.418442 0.199148
0.158078 0.184037 0.536614 0.121271
0.794266 0.073227 0.061991 0.070515
0.109260 0.193723 0.389771 0.307245
0.156141 0.179775 0.308020 0.356064
0.222394 0.333979 0.283224 0.160403
MOTIF M6 O6
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2411 E= 1337.0e-6
0.261302 0.278723 0.250518 0.209457
0.265035 0.193281 0.299461 0.242223
0.229365 0.310245 0.255910 0.204479
0.230195 0.277478 0.250933 0.241394
0.271257 0.276234 0.261302 0.191207
0.197843 0.318125 0.293654 0.190377
0.171713 0.379096 0.232684 0.216508
0.291995 0.276234 0.313978 0.117793
0.318125 0.101618 0.267109 0.313148
0.265035 0.098299 0.576109 0.060556
0.248030 0.192451 0.347574 0.211945
0.024471 0.231854 0.434674 0.309000
0.069266 0.705516 0.024886 0.200332
0.656574 0.080465 0.162588 0.100373
0.233928 0.209457 0.424305 0.132310
0.032766 0.425550 0.072169 0.469515
0.134384 0.440066 0.381584 0.043965
0.527582 0.048528 0.360846 0.063044
0.404397 0.092493 0.296557 0.206553
0.024056 0.292825 0.651182 0.031937
0.024886 0.814185 0.022397 0.138532
0.377852 0.070510 0.487350 0.064289
0.184985 0.080465 0.244712 0.489838
0.287433 0.044795 0.603484 0.064289
0.455827 0.126918 0.277063 0.140191
0.292410 0.508503 0.077146 0.121941
0.264206 0.280796 0.258399 0.196599
0.224388 0.271672 0.292825 0.211116
0.168810 0.321443 0.284529 0.225218
0.233098 0.282455 0.299046 0.185400
MOTIF M7 O7
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 1934 E= 1337.0e-6
0.203723 0.264736 0.290072 0.241468
0.226474 0.250259 0.298345 0.224922
0.205274 0.230093 0.284385 0.280248
0.192865 0.241986 0.323164 0.241986
0.204757 0.254395 0.267322 0.273526
0.207342 0.229576 0.284385 0.278697
0.198035 0.258532 0.321096 0.222337
0.229576 0.244054 0.317477 0.208893
0.187177 0.262151 0.342813 0.207859
0.201138 0.282316 0.341262 0.175284
0.233713 0.234747 0.325750 0.205791
0.218718 0.262151 0.291107 0.228025
0.215098 0.182523 0.443123 0.159255
0.315926 0.048604 0.612720 0.022751
0.034643 0.002068 0.702172 0.261117
0.003102 0.000517 0.988625 0.007756
0.001034 0.002068 0.987590 0.009307
0.003102 0.000517 0.274560 0.721820
0.009307 0.984488 0.006205 0.000000
0.033609 0.265253 0.104964 0.596174
0.087901 0.381075 0.208893 0.322130
0.195450 0.313340 0.292658 0.198552
0.252327 0.220786 0.350052 0.176836
0.229059 0.224405 0.308170 0.238366
0.229059 0.311272 0.281799 0.177870
0.207859 0.251810 0.250259 0.290072
0.188211 0.280248 0.290589 0.240951
0.188728 0.288521 0.295760 0.226991
0.204757 0.292141 0.250259 0.252844
0.246122 0.232678 0.334023 0.187177
MOTIF M8 O8
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2492 E= 1337.0e-6
0.309390 0.248395 0.227929 0.214286
0.256019 0.219101 0.288122 0.236758
0.230337 0.316613 0.235955 0.217095
0.199839 0.337480 0.206260 0.256421
0.205859 0.239968 0.274478 0.279695
0.252408 0.295746 0.241573 0.210273
0.009631 0.026886 0.010433 0.953050
0.008427 0.001204 0.971509 0.018860
0.964286 0.016051 0.002408 0.017255
0.022071 0.696228 0.111156 0.170546
0.046148 0.539727 0.406100 0.008026
0.040530 0.257223 0.005217 0.697030
0.209069 0.479133 0.132424 0.179374
0.455859 0.120385 0.216292 0.207464
0.226726 0.189406 0.308989 0.274880
0.223515 0.230337 0.293339 0.252809
0.233949 0.215490 0.282504 0.268058
0.182183 0.260835 0.287319 0.269663
0.236758 0.251605 0.234751 0.276886
0.221509 0.256421 0.245586 0.276485
0.197432 0.346308 0.240770 0.215490
0.201043 0.283307 0.255618 0.260032
0.250401 0.251605 0.272472 0.225522
0.245987 0.296148 0.248796 0.209069
0.292937 0.266051 0.221509 0.219502
0.186998 0.283708 0.258427 0.270867
0.245586 0.232343 0.279294 0.242777
0.206661 0.301364 0.245185 0.246790
0.223515 0.263644 0.277287 0.235554
0.242376 0.281300 0.228732 0.247592
MOTIF M9 O9
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2582 E= 1337.0e-6
0.256003 0.227730 0.244771 0.271495
0.240511 0.250581 0.262974 0.245933
0.264911 0.211851 0.269171 0.254067
0.205267 0.270720 0.267235 0.256778
0.267622 0.252905 0.227343 0.252130
0.249419 0.230442 0.268397 0.251743
0.241673 0.230829 0.322231 0.205267
0.260263 0.236251 0.311387 0.192099
0.276917 0.127033 0.277304 0.318745
0.249032 0.197909 0.390782 0.162277
0.176607 0.234702 0.261813 0.326878
0.000775 0.012006 0.000000 0.987219
0.003873 0.000000 0.989543 0.006584
0.010844 0.987219 0.000000 0.001936
0.998064 0.000000 0.001936 0.000000
0.420604 0.185515 0.213788 0.180093
0.089078 0.413246 0.212239 0.285438
0.327266 0.268784 0.156468 0.247483
0.175058 0.305190 0.251743 0.268009
0.180480 0.372967 0.183191 0.263362
0.256778 0.277692 0.223857 0.241673
0.235089 0.223470 0.287374 0.254067
0.269558 0.260263 0.273044 0.197134
0.240124 0.304028 0.199070 0.256778
0.232378 0.290860 0.209527 0.267235
0.249419 0.268009 0.220759 0.261813
0.278854 0.244384 0.236251 0.240511
0.256778 0.265686 0.236638 0.240899
0.242835 0.272657 0.259489 0.225019
0.259489 0.278079 0.237413 0.225019
MOTIF M10 O10
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2579 E= 1337.0e-6
0.273362 0.231873 0.233812 0.260954
0.240791 0.254362 0.233812 0.271035
0.259015 0.251648 0.256301 0.233036
0.265607 0.245832 0.252036 0.236526
0.235363 0.251648 0.224506 0.288484
0.300504 0.251260 0.219853 0.228383
0.269484 0.291198 0.211322 0.227995
0.255913 0.318728 0.223342 0.202016
0.271423 0.254750 0.283831 0.189996
0.284219 0.241954 0.246995 0.226832
0.295851 0.240791 0.222179 0.241179
0.271811 0.209383 0.286545 0.232261
0.229159 0.262505 0.212098 0.296239
0.335789 0.222567 0.216363 0.225281
0.328810 0.146181 0.217138 0.307871
0.356340 0.065142 0.294300 0.284219
0.038387 0.060876 0.810779 0.089957
0.004265 0.968592 0.000775 0.026367
0.038775 0.000000 0.956185 0.005041
0.098100 0.771229 0.079488 0.051183
0.317953 0.217138 0.119038 0.345870
0.275688 0.282668 0.161303 0.280341
0.219465 0.229934 0.206669 0.343932
0.295851 0.217138 0.224506 0.262505
0.229934 0.276851 0.226444 0.266770
0.208608 0.285382 0.238077 0.267933
0.218302 0.222955 0.246607 0.312136
0.182241 0.278790 0.269872 0.269097
0.211710 0.228383 0.318728 0.241179
0.211710 0.240016 0.290035 0.258240
MOTIF M11 O11
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2581 E= 1337.0e-6
0.290585 0.300659 0.183262 0.225494
0.237505 0.261139 0.243317 0.258040
0.285161 0.202247 0.290585 0.222007
0.288648 0.189849 0.327005 0.194498
0.237505 0.164665 0.351802 0.246029
0.202247 0.352189 0.254940 0.190624
0.092600 0.147230 0.083301 0.676869
0.141806 0.064316 0.137544 0.656335
0.682681 0.055405 0.194111 0.067803
0.143743 0.251065 0.132119 0.473072
0.189849 0.034870 0.750872 0.024409
0.008911 0.036807 0.001550 0.952731
0.651685 0.206509 0.075165 0.066641
0.767919 0.086013 0.092987 0.053080
0.120108 0.409144 0.196435 0.274312
0.169702 0.382022 0.179000 0.269275
0.141031 0.310345 0.146842 0.401782
0.348315 0.199535 0.224332 0.227819
0.297172 0.283224 0.232468 0.187137
0.235180 0.278962 0.247578 0.238280
0.244479 0.184037 0.224332 0.347152
0.181713 0.232468 0.308408 0.277412
0.197210 0.342503 0.197210 0.263076
0.331654 0.216583 0.204959 0.246804
0.213096 0.214645 0.246416 0.325843
0.261139 0.223169 0.271600 0.244091
0.233243 0.264239 0.212321 0.290198
0.189461 0.266563 0.258040 0.285936
0.180163 0.281286 0.237505 0.301046
0.212321 0.337079 0.230918 0.219682
MOTIF M12 O12
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2580 E= 1337.0e-6
0.453876 0.168992 0.166279 0.210853
0.269767 0.252713 0.241085 0.236434
0.133333 0.086822 0.285271 0.494574
0.235659 0.382558 0.156202 0.225581
0.133333 0.355814 0.047674 0.463178
0.851938 0.060853 0.056202 0.031008
0.863178 0.034884 0.011240 0.090698
0.089147 0.031395 0.036822 0.842636
0.042636 0.184109 0.084884 0.688372
0.659690 0.077907 0.206202 0.056202
0.139147 0.227519 0.543023 0.090310
0.328295 0.438760 0.097674 0.135271
0.308527 0.194961 0.148837 0.347674
0.205814 0.174419 0.366279 0.253488
0.258527 0.337209 0.228295 0.175969
0.334884 0.228682 0.269380 0.167054
0.182946 0.220155 0.313566 0.283333
0.233721 0.279457 0.315116 0.171705
0.194186 0.319767 0.229070 0.256977
0.235271 0.275969 0.250000 0.238760
0.182171 0.312016 0.219380 0.286434
0.169767 0.293798 0.286434 0.250000
0.386822 0.175194 0.256977 0.181008
0.313953 0.296124 0.279457 0.110465
0.250775 0.198062 0.397674 0.153488
0.231395 0.237984 0.388760 0.141860
0.249612 0.199225 0.357364 0.193798
0.184496 0.241860 0.381395 0.192248
0.252713 0.206202 0.405039 0.136047
0.250775 0.290310 0.259302 0.199612
MOTIF M13 O13
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2297 E= 1337.0e-6
0.251633 0.207662 0.261646 0.279060
0.266870 0.222899 0.265564 0.244667
0.255115 0.265564 0.259469 0.219852
0.279930 0.247714 0.242055 0.230300
0.281672 0.240749 0.298650 0.178929
0.390945 0.194602 0.259034 0.155420
0.481933 0.206356 0.161080 0.150631
0.444493 0.143230 0.185024 0.227253
0.158032 0.480627 0.296038 0.065303
0.538529 0.305616 0.137135 0.018720
0.059643 0.002612 0.929038 0.008707
0.034393 0.004789 0.953853 0.006966
0.974750 0.016543 0.003483 0.005224
0.887244 0.025250 0.013931 0.073574
0.072704 0.205921 0.712233 0.009142
0.161950 0.206356 0.158903 0.472791
0.330431 0.185459 0.209404 0.274706
0.243361 0.266434 0.331302 0.158903
0.275577 0.231171 0.293426 0.199826
0.213757 0.239443 0.294297 0.252503
0.266434 0.193731 0.270353 0.269482
0.229865 0.212016 0.336526 0.221593
0.227253 0.267305 0.249020 0.256421
0.235960 0.229430 0.286461 0.248150
0.286461 0.191554 0.294732 0.227253
0.266434 0.157162 0.335220 0.241184
0.243361 0.255551 0.303439 0.197649
0.242055 0.250327 0.265564 0.242055
0.245973 0.266870 0.280801 0.206356
0.227688 0.245538 0.290379 0.236395
MOTIF M14 O14
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2573 E= 1337.0e-6
0.280995 0.208706 0.327244 0.183055
0.285659 0.268558 0.251457 0.194326
0.329576 0.186164 0.256121 0.228138
0.267781 0.147299 0.340847 0.244073
0.307035 0.195103 0.284493 0.213370
0.287991 0.196658 0.306257 0.209094
0.374660 0.169841 0.211426 0.244073
0.281772 0.230082 0.250291 0.237855
0.268947 0.249903 0.289545 0.191605
0.219588 0.207151 0.258453 0.314808
0.314808 0.217256 0.286436 0.181500
0.313642 0.218422 0.322192 0.145744
0.370385 0.164788 0.268169 0.196658
0.542946 0.080839 0.187719 0.188496
0.163234 0.036533 0.697629 0.102604
0.749709 0.059075 0.121259 0.069957
0.146910 0.148076 0.258065 0.446949
0.750097 0.052468 0.158570 0.038865
0.835212 0.022542 0.096774 0.045472
0.052468 0.025262 0.890789 0.031481
0.859308 0.036145 0.068403 0.036145
0.155849 0.214147 0.143801 0.486203
0.736106 0.094831 0.100272 0.068791
0.437233 0.083171 0.317917 0.161679
0.268558 0.157015 0.359114 0.215313
0.317917 0.136805 0.373883 0.171395
0.369996 0.197046 0.235523 0.197435
0.321415 0.208706 0.248737 0.221143
0.300039 0.191994 0.279440 0.228527
0.347843 0.160902 0.277497 0.213758
MOTIF M15 O15
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2553 E= 1337.0e-6
0.215825 0.228359 0.219350 0.336467
0.266353 0.222092 0.194673 0.316882
0.254994 0.238151 0.282805 0.224050
0.184097 0.415198 0.135919 0.264787
0.381120 0.259694 0.178222 0.180964
0.608696 0.101841 0.109283 0.180180
0.643165 0.091265 0.148061 0.117509
0.120251 0.338425 0.443400 0.097924
0.475519 0.125734 0.334117 0.064630
0.317274 0.146103 0.158637 0.377987
0.878574 0.042695 0.023110 0.055621
0.902859 0.053271 0.033686 0.010184
0.949863 0.008617 0.036428 0.005092
0.122601 0.778300 0.034861 0.064238
0.659616 0.150411 0.061888 0.128085
0.473169 0.151586 0.133568 0.241676
0.262828 0.151586 0.227967 0.357618
0.233843 0.281238 0.305523 0.179397
0.230317 0.318057 0.233451 0.218175
0.282805 0.246377 0.207599 0.263220
0.269487 0.198198 0.266353 0.265962
0.266353 0.227184 0.258911 0.247552
0.387779 0.230709 0.184881 0.196631
0.315315 0.249510 0.196240 0.238935
0.293380 0.245202 0.220525 0.240893
0.283980 0.251077 0.253036 0.211908
0.222092 0.281238 0.238935 0.257736
0.238935 0.161770 0.262828 0.336467
0.278888 0.195456 0.288288 0.237368
0.245593 0.250685 0.236976 0.266745
MOTIF M16 O16
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2553 E= 1337.0e-6
0.235801 0.247552 0.216608 0.300039
0.200940 0.237759 0.267528 0.293772
0.199373 0.356443 0.217000 0.227184
0.259303 0.146494 0.137485 0.456718
0.194673 0.249119 0.369761 0.186447
0.185664 0.071680 0.097924 0.644732
0.029377 0.025069 0.821387 0.124168
0.007442 0.020760 0.005092 0.966706
0.638856 0.309832 0.021152 0.030161
0.471994 0.311398 0.120251 0.096357
0.687427 0.079906 0.085781 0.146886
0.033294 0.810027 0.043087 0.113592
0.788484 0.049354 0.047787 0.114375
0.228359 0.136702 0.298472 0.336467
0.362711 0.207599 0.241285 0.188406
0.297689 0.261261 0.260478 0.180572
0.291814 0.285155 0.193498 0.229534
0.277712 0.227184 0.196631 0.298472
0.247944 0.252252 0.276146 0.223658
0.254994 0.231101 0.284763 0.229142
0.239326 0.273796 0.258519 0.228359
0.267137 0.295339 0.153545 0.283980
0.244810 0.179788 0.238543 0.336859
0.189581 0.322758 0.242460 0.245202
0.272229 0.301998 0.215825 0.209949
0.293772 0.233451 0.261653 0.211124
0.240110 0.220917 0.291814 0.247160
0.242460 0.228750 0.226400 0.302389
0.270270 0.209166 0.267528 0.253036
0.245593 0.288680 0.240501 0.225225
MOTIF M17 O17
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2033 E= 1337.0e-6
0.290703 0.218396 0.169208 0.321692
0.266601 0.219380 0.234629 0.279390
0.276931 0.226267 0.225283 0.271520
0.293655 0.238072 0.289720 0.178554
0.334481 0.275455 0.144614 0.245450
0.416134 0.117068 0.073291 0.393507
0.452041 0.157403 0.209543 0.181013
0.454009 0.055583 0.194294 0.296114
0.331038 0.077718 0.447614 0.143630
0.018692 0.610428 0.010330 0.360551
0.695032 0.232661 0.004919 0.067388
0.966552 0.016724 0.007870 0.008854
0.981800 0.004919 0.002459 0.010821
0.005903 0.318249 0.012789 0.663060
0.931136 0.013773 0.025578 0.029513
0.315298 0.143630 0.154943 0.386129
0.296606 0.154943 0.216429 0.332022
0.261190 0.145106 0.249877 0.343827
0.348746 0.169700 0.300541 0.181013
0.267585 0.229710 0.248401 0.254304
0.322676 0.189867 0.195770 0.291687
0.282833 0.210526 0.232169 0.274471
0.311854 0.188392 0.204132 0.295622
0.279390 0.230202 0.238564 0.251845
0.285293 0.229710 0.234137 0.250861
0.282833 0.261682 0.221840 0.233645
0.316773 0.215937 0.198229 0.269061
0.339400 0.199705 0.209543 0.251353
0.280866 0.217413 0.208559 0.293163
0.289720 0.210034 0.209051 0.291195
MOTIF M18 O18
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2501 E= 1337.0e-6
0.316673 0.191923 0.281487 0.209916
0.325470 0.229108 0.208317 0.237105
0.348661 0.210316 0.226709 0.214314
0.305078 0.305478 0.193123 0.196321
0.365854 0.201919 0.141543 0.290684
0.298681 0.194322 0.174730 0.332267
0.411036 0.166333 0.207917 0.214714
0.328669 0.139144 0.306677 0.225510
0.333067 0.311076 0.122351 0.233507
0.245102 0.196721 0.276289 0.281887
0.509796 0.173131 0.161136 0.155938
0.258297 0.262695 0.241903 0.237105
0.235506 0.279888 0.228709 0.255898
0.321871 0.238705 0.235106 0.204318
0.263495 0.262695 0.206317 0.267493
0.321471 0.218313 0.147541 0.312675
0.336665 0.257897 0.196321 0.209116
0.362655 0.179128 0.226309 0.231907
0.472611 0.100760 0.221911 0.204718
0.425830 0.079968 0.386246 0.107957
0.063575 0.213115 0.070372 0.652939
0.814074 0.142343 0.031587 0.011995
0.920832 0.023990 0.036785 0.018393
0.982807 0.002399 0.010396 0.004398
0.041184 0.511395 0.102759 0.344662
0.856058 0.035986 0.024790 0.083167
0.243103 0.205518 0.135146 0.416234
0.361056 0.241104 0.178329 0.219512
0.162735 0.275090 0.098361 0.463814
0.354258 0.157537 0.217113 0.271092
MOTIF M19 O19
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2156 E= 1337.0e-6
0.269944 0.253711 0.237013 0.239332
0.274583 0.243970 0.226345 0.255102
0.265306 0.275046 0.211039 0.248609
0.259276 0.248609 0.224026 0.268089
0.276902 0.236549 0.241651 0.244898
0.250464 0.256494 0.235622 0.257421
0.268089 0.237477 0.221243 0.273191
0.271800 0.230983 0.211039 0.286178
0.243506 0.215213 0.258813 0.282468
0.274119 0.229128 0.231911 0.264842
0.208720 0.219852 0.213822 0.357607
0.172078 0.309369 0.185529 0.333024
0.194805 0.357607 0.211039 0.236549
0.070965 0.233766 0.071892 0.623377
0.181818 0.007421 0.003711 0.807050
0.991187 0.001391 0.006494 0.000928
0.003711 0.002319 0.001391 0.992579
0.000464 0.991187 0.000464 0.007885
0.312616 0.019481 0.051020 0.616883
0.193414 0.251855 0.316327 0.238404
0.230519 0.258813 0.177644 0.333024
0.304731 0.266234 0.177180 0.251855
0.269944 0.238868 0.207792 0.283395
0.269481 0.233302 0.216605 0.280612
0.266234 0.251855 0.224026 0.257885
0.265306 0.283859 0.191558 0.259276
0.241187 0.383581 0.182746 0.192486
0.323748 0.355751 0.150278 0.170223
0.349722 0.242579 0.205473 0.202226
0.267625 0.235622 0.242115 0.254638
MOTIF M20 O20
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 1278 E= 1337.0e-6
0.264476 0.253521 0.215180 0.266823
0.264476 0.220657 0.234742 0.280125
0.228482 0.278560 0.241784 0.251174
0.263693 0.242567 0.214397 0.279343
0.294210 0.233177 0.219092 0.253521
0.262128 0.241002 0.211268 0.285603
0.252739 0.217527 0.221440 0.308294
0.175274 0.251956 0.190141 0.382629
0.078247 0.358372 0.174491 0.388889
0.046166 0.618153 0.129108 0.206573
0.051643 0.034429 0.008607 0.905321
0.100939 0.007042 0.007042 0.884977
0.976526 0.006260 0.010172 0.007042
0.006260 0.003130 0.005477 0.985133
0.003912 0.981221 0.005477 0.009390
0.320814 0.033646 0.041471 0.604069
0.183099 0.281690 0.290297 0.244914
0.241784 0.240219 0.154930 0.363067
0.321596 0.212833 0.247261 0.218310
0.258216 0.262128 0.214397 0.265258
0.280908 0.251174 0.197183 0.270736
0.283255 0.244914 0.205790 0.266041
0.276995 0.266041 0.195618 0.261346
0.222222 0.417840 0.178404 0.181534
0.366197 0.319249 0.161972 0.152582
0.325509 0.260563 0.221440 0.192488
0.291080 0.230047 0.269953 0.208920
0.244131 0.240219 0.259781 0.255869
0.236307 0.244131 0.237872 0.281690
0.222222 0.258998 0.237872 0.280908
MOTIF M21 O21
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 1333 E= 1337.0e-6
0.200300 0.208552 0.246062 0.345086
0.144786 0.144786 0.324831 0.385596
0.178545 0.170293 0.428357 0.222806
0.256564 0.192048 0.262566 0.288822
0.264816 0.205551 0.231058 0.298575
0.270068 0.199550 0.245311 0.285071
0.281320 0.212303 0.238560 0.267817
0.232558 0.221305 0.222056 0.324081
0.374344 0.152288 0.238560 0.234809
0.229557 0.289572 0.291823 0.189047
0.613653 0.046512 0.033008 0.306827
0.009752 0.005251 0.983496 0.001500
0.970743 0.007502 0.012003 0.009752
0.003751 0.007502 0.004501 0.984246
0.880720 0.002251 0.012753 0.104276
0.894974 0.010503 0.033758 0.060765
0.234809 0.122281 0.600150 0.042761
0.406602 0.165791 0.347337 0.080270
0.373593 0.201800 0.249062 0.175544
0.312828 0.214554 0.222056 0.250563
0.286572 0.214554 0.237809 0.261065
0.273818 0.210053 0.234809 0.281320
0.273068 0.217554 0.243811 0.265566
0.261815 0.236309 0.259565 0.242311
0.275319 0.228057 0.221305 0.275319
0.256564 0.212303 0.266317 0.264816
0.276819 0.199550 0.261815 0.261815
0.267817 0.240060 0.243811 0.248312
0.284321 0.204051 0.237059 0.274569
0.306827 0.219805 0.242311 0.231058
MOTIF M22 O22
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2579 E= 1337.0e-6
0.240016 0.284994 0.203180 0.271811
0.243117 0.295851 0.226057 0.234975
0.227220 0.265219 0.246219 0.261342
0.219465 0.273750 0.271035 0.235750
0.261342 0.260954 0.282280 0.195425
0.224118 0.319504 0.243117 0.213261
0.286933 0.271423 0.246219 0.195425
0.235750 0.207445 0.265995 0.290810
0.217138 0.195812 0.367197 0.219853
0.367972 0.236914 0.196976 0.198139
0.587825 0.214424 0.183017 0.014734
0.975960 0.015510 0.005816 0.002714
0.921675 0.020163 0.020551 0.037611
0.005816 0.020938 0.060489 0.912757
0.022102 0.958123 0.018224 0.001551
0.329585 0.349748 0.039550 0.281117
0.125630 0.537418 0.200078 0.136875
0.282280 0.306320 0.180690 0.230710
0.191159 0.233036 0.395890 0.179915
0.211710 0.343156 0.219465 0.225669
0.210159 0.303218 0.234975 0.251648
0.252423 0.295463 0.190384 0.261729
0.234975 0.318340 0.234199 0.212485
0.238852 0.248546 0.215200 0.297402
0.201629 0.279566 0.255913 0.262893
0.224506 0.234587 0.322606 0.218302
0.194649 0.297014 0.297790 0.210547
0.211322 0.234587 0.293137 0.260954
0.297014 0.242730 0.249321 0.210934
0.246995 0.283443 0.278015 0.191547
MOTIF M23 O23
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 1617 E= 1337.0e-6
0.255411 0.244280 0.310451 0.189858
0.222635 0.225727 0.341991 0.209647
0.202226 0.250464 0.388374 0.158936
0.298701 0.218924 0.289425 0.192950
0.280148 0.156463 0.357452 0.205937
0.283859 0.170686 0.418058 0.127396
0.202226 0.029066 0.448361 0.320346
0.233766 0.000000 0.764997 0.001237
0.001237 0.000618 0.998145 0.000000
0.001855 0.000618 0.996908 0.000618
0.257267 0.390229 0.006803 0.345702
0.028448 0.003092 0.952999 0.015461
0.012987 0.002474 0.721707 0.262832
0.290662 0.004329 0.662338 0.042672
0.043908 0.063080 0.751391 0.141620
0.139147 0.571429 0.049474 0.239951
0.163884 0.414348 0.135436 0.286333
0.241187 0.230056 0.209029 0.319728
0.204082 0.251701 0.331478 0.212740
0.222635 0.244898 0.330241 0.202226
0.256030 0.197897 0.373531 0.172542
0.236858 0.212740 0.346320 0.204082
0.205318 0.227582 0.340136 0.226964
0.211503 0.248609 0.341991 0.197897
0.236240 0.260977 0.290043 0.212740
0.181818 0.275819 0.338899 0.203463
0.228819 0.271490 0.286333 0.213358
0.213976 0.244898 0.344465 0.196660
0.200371 0.234385 0.364255 0.200989
0.271490 0.252938 0.278293 0.197279
MOTIF M24 O24
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2543 E= 1337.0e-6
0.233189 0.199764 0.195832 0.371215
0.280771 0.180495 0.218639 0.320094
0.246166 0.170271 0.219819 0.363744
0.265435 0.177743 0.255604 0.301219
0.254424 0.175777 0.180102 0.389697
0.257177 0.199371 0.241840 0.301612
0.292175 0.125442 0.197405 0.384978
0.198584 0.101848 0.242627 0.456941
0.301219 0.184035 0.191899 0.322847
0.253244 0.268974 0.116791 0.360991
0.223751 0.062918 0.029886 0.683445
0.051907 0.018089 0.793158 0.136846
0.003932 0.016123 0.002753 0.977192
0.054660 0.011011 0.125836 0.808494
0.005112 0.007078 0.029099 0.958710
0.568620 0.017302 0.215100 0.198978
0.044042 0.151003 0.060558 0.744396
0.278411 0.166339 0.153362 0.401888
0.357845 0.118757 0.170271 0.353126
0.235549 0.182855 0.248919 0.332678
0.277625 0.206842 0.214314 0.301219
0.256390 0.206842 0.198584 0.338183
0.311443 0.209202 0.151789 0.327566
0.254817 0.162407 0.220999 0.361777
0.260716 0.165946 0.165552 0.407786
0.211561 0.158867 0.307118 0.322454
0.235942 0.193472 0.228864 0.341722
0.217853 0.208022 0.264255 0.309870
0.249312 0.219426 0.200551 0.330712
0.246166 0.168698 0.266614 0.318521
MOTIF M25 O25
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2289 E= 1337.0e-6
0.276977 0.195282 0.197466 0.330275
0.240716 0.222805 0.204019 0.332460
0.283530 0.226737 0.164701 0.325033
0.291394 0.204019 0.205767 0.298820
0.240716 0.199214 0.213194 0.346876
0.193097 0.200524 0.278724 0.327654
0.182176 0.218873 0.208825 0.390127
0.209699 0.211883 0.257318 0.321101
0.286588 0.128877 0.124509 0.460026
0.228484 0.109655 0.146352 0.515509
0.017038 0.023591 0.012232 0.947138
0.197903 0.010922 0.605068 0.186107
0.002621 0.017475 0.006116 0.973788
0.004369 0.004369 0.071210 0.920052
0.049803 0.013980 0.057230 0.878986
0.225863 0.033202 0.186981 0.553954
0.027523 0.154216 0.106597 0.711664
0.244211 0.226737 0.113587 0.415465
0.070336 0.201398 0.050240 0.678025
0.346003 0.048930 0.101791 0.503277
0.256007 0.121887 0.322848 0.299257
0.182612 0.182612 0.342945 0.291830
0.179118 0.264308 0.243775 0.312800
0.353866 0.166448 0.205767 0.273919
0.231105 0.228047 0.236785 0.304063
0.243775 0.182176 0.270424 0.303626
0.224115 0.196156 0.240716 0.339013
0.295762 0.216689 0.241153 0.246396
0.238532 0.209699 0.265181 0.286588
0.231542 0.255133 0.173001 0.340323
MOTIF M26 O26
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2534 E= 1337.0e-6
0.286504 0.238358 0.254933 0.220205
0.367798 0.153907 0.161010 0.317285
0.351618 0.213102 0.227703 0.207577
0.429361 0.066298 0.187451 0.316890
0.114049 0.039858 0.705998 0.140095
0.134175 0.088398 0.135754 0.641673
0.846093 0.056827 0.046567 0.050513
0.914759 0.049724 0.021705 0.013812
0.941594 0.023283 0.021310 0.013812
0.159432 0.636543 0.034728 0.169298
0.903315 0.041831 0.028808 0.026046
0.297948 0.157853 0.350829 0.193370
0.269929 0.201657 0.250592 0.277822
0.232833 0.268350 0.201263 0.297553
0.273086 0.283346 0.188240 0.255328
0.337806 0.257301 0.153118 0.251776
0.265588 0.182320 0.263615 0.288477
0.286109 0.177585 0.295580 0.240726
0.307419 0.164562 0.327151 0.200868
0.243094 0.205998 0.308998 0.241910
0.341358 0.165746 0.286109 0.206788
0.235991 0.176796 0.231650 0.355564
0.169692 0.217837 0.344120 0.268350
0.217443 0.307814 0.228098 0.246646
0.248619 0.193370 0.230466 0.327545
0.275059 0.201657 0.309392 0.213891
0.334649 0.187056 0.243094 0.235201
0.188635 0.193765 0.333070 0.284530
0.249408 0.241910 0.280979 0.227703
0.235596 0.206788 0.280979 0.276638
MOTIF M27 O27
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2385 E= 1337.0e-6
0.212159 0.225157 0.293082 0.269602
0.244025 0.261635 0.230608 0.263732
0.231447 0.277987 0.250734 0.239832
0.271279 0.244864 0.240252 0.243606
0.293920 0.261635 0.239832 0.204612
0.286373 0.221803 0.238574 0.253249
0.234382 0.219287 0.231447 0.314885
0.225996 0.257023 0.211740 0.305241
0.237317 0.229350 0.249057 0.284277
0.268344 0.230189 0.261216 0.240252
0.271698 0.238994 0.259958 0.229350
0.305241 0.255765 0.220545 0.218449
0.265409 0.234382 0.257023 0.243187
0.283438 0.219287 0.286373 0.210901
0.290985 0.249895 0.246960 0.212159
0.285954 0.144654 0.291824 0.277568
0.479665 0.228512 0.267086 0.024738
0.006289 0.008805 0.005451 0.979455
0.006289 0.001677 0.414256 0.577778
0.555975 0.002935 0.275472 0.165618
0.122013 0.449057 0.198323 0.230608
0.246960 0.232285 0.441090 0.079665
0.183648 0.210063 0.001258 0.605031
0.506918 0.487631 0.000419 0.005031
0.988260 0.000839 0.007547 0.003354
0.023480 0.277568 0.200419 0.498532
0.282600 0.332914 0.117820 0.266667
0.216352 0.279245 0.220545 0.283857
0.218868 0.271279 0.217610 0.292243
0.262474 0.247799 0.215514 0.274214
MOTIF M28 O28
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 899 E= 1337.0e-6
0.288098 0.192436 0.202447 0.317019
0.320356 0.211346 0.197998 0.270300
0.324805 0.190211 0.159066 0.325918
0.354839 0.182425 0.180200 0.282536
0.327030 0.193548 0.196885 0.282536
0.312570 0.176863 0.162403 0.348165
0.264739 0.209121 0.174638 0.351502
0.337041 0.194661 0.165740 0.302558
0.367075 0.112347 0.241379 0.279199
0.292547 0.045606 0.441602 0.220245
0.177976 0.122358 0.133482 0.566185
0.193548 0.164627 0.068966 0.572859
0.870968 0.025584 0.046719 0.056730
0.806452 0.068966 0.030033 0.094549
0.380423 0.021135 0.020022 0.578420
0.268076 0.215795 0.177976 0.338154
0.824249 0.011123 0.030033 0.134594
0.057842 0.026696 0.067853 0.847608
0.033370 0.023359 0.010011 0.933259
0.729700 0.041157 0.066741 0.162403
0.731924 0.056730 0.179088 0.032258
0.130145 0.675195 0.046719 0.147942
0.270300 0.317019 0.057842 0.354839
0.340378 0.218020 0.191324 0.250278
0.358176 0.143493 0.265851 0.232481
0.342603 0.143493 0.278087 0.235818
0.260289 0.238042 0.212458 0.289210
0.313682 0.174638 0.211346 0.300334
0.295884 0.169077 0.199110 0.335929
0.254727 0.200222 0.234705 0.310345
MOTIF M29 O29
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 1549 E= 1337.0e-6
0.286637 0.229180 0.163331 0.320852
0.255003 0.200775 0.216914 0.327308
0.213686 0.252421 0.200775 0.333118
0.260168 0.286637 0.160103 0.293092
0.264687 0.200129 0.162686 0.372498
0.280181 0.210458 0.185281 0.324080
0.065203 0.020013 0.012266 0.902518
0.358941 0.009684 0.626856 0.004519
0.009684 0.012912 0.003228 0.974177
0.011620 0.003228 0.095546 0.889606
0.003873 0.002582 0.175597 0.817947
0.608134 0.012912 0.264041 0.114913
0.022595 0.479664 0.016785 0.480955
0.312460 0.145255 0.018076 0.524209
0.086507 0.238864 0.081343 0.593286
0.449322 0.012266 0.040671 0.497740
0.315042 0.113622 0.307941 0.263396
0.156875 0.245320 0.298903 0.298903
0.272434 0.221433 0.230471 0.275662
0.318270 0.209813 0.194319 0.277598
0.277598 0.226598 0.202066 0.293738
0.293738 0.199484 0.187218 0.319561
0.314396 0.211750 0.210458 0.263396
0.313751 0.191091 0.240801 0.254358
0.265978 0.208522 0.217560 0.307941
0.253066 0.232408 0.202066 0.312460
0.275662 0.226598 0.194319 0.303422
0.271143 0.203357 0.202066 0.323434
0.259522 0.214332 0.211104 0.315042
0.265332 0.233699 0.222724 0.278244
MOTIF M30 O30
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2564 E= 1337.0e-6
0.224259 0.250780 0.288222 0.236739
0.256240 0.283541 0.273011 0.187207
0.200468 0.266771 0.276521 0.256240
0.226599 0.323713 0.288222 0.161466
0.247660 0.244930 0.258970 0.248440
0.132605 0.334243 0.319033 0.214119
0.266771 0.396256 0.110374 0.226599
0.122465 0.086973 0.689158 0.101404
0.046412 0.871685 0.043682 0.038222
0.754680 0.081513 0.080343 0.083463
0.069033 0.068643 0.822543 0.039782
0.082683 0.730889 0.083853 0.102574
0.037441 0.037832 0.119735 0.804992
0.043682 0.054602 0.867395 0.034321
0.067473 0.783151 0.060842 0.088534
0.225039 0.088534 0.358034 0.328393
0.167317 0.372855 0.326053 0.133775
0.240640 0.324883 0.196568 0.237910
0.189548 0.332683 0.212168 0.265601
0.251170 0.139626 0.367005 0.242200
0.175897 0.269111 0.326443 0.228549
0.218019 0.313183 0.226989 0.241810
0.186817 0.237910 0.360764 0.214509
0.179017 0.257800 0.398206 0.164977
0.225039 0.207098 0.288612 0.279251
0.217629 0.244930 0.316303 0.221139
0.284711 0.318253 0.208268 0.188768
0.302652 0.179407 0.277691 0.240250
0.185647 0.276911 0.297582 0.239860
0.227379 0.331903 0.248830 0.191888
MOTIF M31 O31
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 746 E= 1337.0e-6
0.282842 0.211796 0.206434 0.298928
0.309651 0.233244 0.180965 0.276139
0.302949 0.168901 0.198391 0.329759
0.270777 0.175603 0.268097 0.285523
0.281501 0.221180 0.150134 0.347185
0.186327 0.264075 0.121984 0.427614
0.183646 0.213137 0.172922 0.430295
0.175603 0.277480 0.115282 0.431635
0.402145 0.081769 0.297587 0.218499
0.041555 0.384718 0.454424 0.119303
0.009383 0.009383 0.002681 0.978552
0.029491 0.058981 0.002681 0.908847
0.002681 0.002681 0.005362 0.989276
0.008043 0.861930 0.004021 0.126005
0.612601 0.010724 0.197051 0.179625
0.092493 0.339142 0.222520 0.345845
0.081769 0.024129 0.016086 0.878016
0.126005 0.091153 0.013405 0.769437
0.022788 0.292225 0.033512 0.651475
0.136729 0.428954 0.166220 0.268097
0.320375 0.189008 0.190349 0.300268
0.258713 0.280161 0.138070 0.323056
0.260054 0.164879 0.120643 0.454424
0.281501 0.189008 0.130027 0.399464
0.219839 0.253351 0.144772 0.382038
0.215818 0.265416 0.175603 0.343164
0.257373 0.249330 0.206434 0.286863
0.241287 0.238606 0.234584 0.285523
0.242627 0.218499 0.229223 0.309651
0.246649 0.238606 0.221180 0.293566
MOTIF M32 O32
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 462 E= 1337.0e-6
0.253247 0.235931 0.242424 0.268398
0.320346 0.209957 0.188312 0.281385
0.339827 0.255411 0.203463 0.201299
0.346320 0.190476 0.201299 0.261905
0.344156 0.166667 0.253247 0.235931
0.341991 0.177489 0.274892 0.205628
0.354978 0.199134 0.186147 0.259740
0.413420 0.160173 0.181818 0.244589
0.329004 0.177489 0.225108 0.268398
0.300866 0.214286 0.201299 0.283550
0.318182 0.177489 0.357143 0.147186
0.822511 0.015152 0.136364 0.025974
0.818182 0.012987 0.071429 0.097403
0.900433 0.008658 0.032468 0.058442
0.465368 0.121212 0.344156 0.069264
0.255411 0.153680 0.038961 0.551948
0.132035 0.010823 0.852814 0.004329
0.965368 0.012987 0.015152 0.006494
0.967532 0.006494 0.015152 0.010823
0.984848 0.002165 0.006494 0.006494
0.043290 0.426407 0.506494 0.023810
0.212121 0.274892 0.080087 0.432900
0.547619 0.103896 0.255411 0.093074
0.549784 0.179654 0.149351 0.121212
0.510823 0.090909 0.190476 0.207792
0.352814 0.186147 0.170996 0.290043
0.277056 0.244589 0.188312 0.290043
0.370130 0.201299 0.158009 0.270563
0.370130 0.160173 0.220779 0.248918
0.294372 0.209957 0.227273 0.268398
MOTIF M33 O33
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2467 E= 1337.0e-6
0.299149 0.213620 0.269558 0.217673
0.280908 0.318200 0.137009 0.263883
0.246048 0.264694 0.153628 0.335630
0.298338 0.205513 0.250101 0.246048
0.325902 0.177138 0.169031 0.327929
0.226591 0.320227 0.180786 0.272396
0.288204 0.175517 0.214836 0.321443
0.169031 0.282124 0.165383 0.383462
0.274017 0.136603 0.155655 0.433725
0.154844 0.089582 0.223348 0.532225
0.210377 0.493312 0.125253 0.171058
0.186461 0.092015 0.032023 0.689501
0.909607 0.026753 0.032023 0.031617
0.400892 0.038103 0.110255 0.450750
0.657479 0.023510 0.051480 0.267531
0.604378 0.046210 0.068099 0.281313
0.701257 0.051074 0.039319 0.208350
0.061613 0.053912 0.041751 0.842724
0.845561 0.018646 0.079449 0.056344
0.271180 0.099716 0.467369 0.161735
0.569518 0.227402 0.074179 0.128901
0.433725 0.197000 0.116336 0.252939
0.384272 0.182002 0.231455 0.202270
0.373328 0.220511 0.150385 0.255776
0.355898 0.184840 0.213620 0.245642
0.303608 0.170653 0.148764 0.376976
0.246048 0.223348 0.250912 0.279692
0.398460 0.136198 0.176733 0.288610
0.302797 0.203486 0.272801 0.220916
0.239562 0.246859 0.197406 0.316173
MOTIF M34 O34
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2516 E= 1337.0e-6
0.222576 0.215024 0.306041 0.256359
0.207472 0.216216 0.308029 0.268283
0.236486 0.228537 0.292925 0.242051
0.253577 0.233704 0.262719 0.250000
0.267886 0.193959 0.265103 0.273052
0.244833 0.177663 0.355326 0.222178
0.236884 0.144277 0.412560 0.206280
0.257154 0.143879 0.391892 0.207075
0.189189 0.129968 0.425278 0.255564
0.206677 0.175278 0.341415 0.276630
0.238474 0.182830 0.172496 0.406200
0.343800 0.011526 0.581081 0.063593
0.008347 0.000000 0.990859 0.000795
0.003577 0.000000 0.993641 0.002782
0.003577 0.009141 0.984897 0.002385
0.131161 0.005962 0.441971 0.420906
0.121622 0.800477 0.039348 0.038553
0.204690 0.257154 0.116852 0.421304
0.231717 0.338235 0.195151 0.234897
0.249603 0.298092 0.204690 0.247615
0.282591 0.265103 0.234102 0.218203
0.257949 0.193164 0.324324 0.224563
0.232512 0.209062 0.303259 0.255167
0.226550 0.259141 0.299285 0.215024
0.211049 0.258744 0.343800 0.186407
0.212639 0.288156 0.269475 0.229730
0.229730 0.290143 0.253180 0.226948
0.223768 0.234102 0.308426 0.233704
0.235294 0.275835 0.282591 0.206280
0.183227 0.320747 0.275835 0.220191
MOTIF M35 O35
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 423 E= 1337.0e-6
0.210402 0.340426 0.226950 0.222222
0.191489 0.278960 0.338061 0.191489
0.217494 0.338061 0.245863 0.198582
0.257683 0.229314 0.347518 0.165485
0.255319 0.165485 0.425532 0.153664
0.167849 0.638298 0.101655 0.092199
0.156028 0.832151 0.000000 0.011820
0.470449 0.066194 0.278960 0.184397
0.099291 0.304965 0.581560 0.014184
0.059102 0.669031 0.054374 0.217494
0.995272 0.000000 0.004728 0.000000
0.000000 0.000000 1.000000 0.000000
0.312057 0.016548 0.657210 0.014184
0.130024 0.063830 0.555556 0.250591
0.035461 0.004728 0.955083 0.004728
0.011820 0.026005 0.827423 0.134752
0.193853 0.718676 0.030733 0.056738
0.274232 0.163121 0.427896 0.134752
0.139480 0.368794 0.347518 0.144208
0.134752 0.345154 0.271868 0.248227
0.269504 0.217494 0.340426 0.172577
0.137116 0.231678 0.373522 0.257683
0.189125 0.248227 0.349882 0.212766
0.148936 0.262411 0.413712 0.174941
0.234043 0.252955 0.309693 0.203310
0.182033 0.314421 0.340426 0.163121
0.182033 0.378251 0.281324 0.158392
0.210402 0.326241 0.274232 0.189125
0.215130 0.271868 0.316785 0.196217
0.203310 0.252955 0.347518 0.196217
MOTIF M36 O36
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2580 E= 1337.0e-6
0.250775 0.235659 0.193798 0.319767
0.178682 0.317054 0.287597 0.216667
0.212403 0.291473 0.210465 0.285659
0.300388 0.233333 0.228295 0.237984
0.287209 0.281783 0.258527 0.172481
0.298837 0.219380 0.267054 0.214729
0.247674 0.245349 0.329070 0.177907
0.240310 0.234496 0.274419 0.250775
0.225194 0.323643 0.225969 0.225194
0.286047 0.325581 0.219767 0.168605
0.385271 0.234496 0.161240 0.218992
0.210078 0.246124 0.266279 0.277519
0.176744 0.369767 0.272481 0.181008
0.302326 0.262791 0.287597 0.147287
0.348062 0.205039 0.248062 0.198837
0.272868 0.390698 0.165116 0.171318
0.376357 0.306202 0.142636 0.174806
0.217054 0.452326 0.275194 0.055426
0.009690 0.984884 0.003876 0.001550
0.877907 0.015504 0.025581 0.081008
0.031008 0.515116 0.240310 0.213566
0.232946 0.123256 0.627132 0.016667
0.114341 0.054264 0.052713 0.778682
0.019380 0.003101 0.925581 0.051938
0.033333 0.187209 0.623256 0.156202
0.184496 0.294961 0.195349 0.325194
0.219380 0.251938 0.255039 0.273643
0.279457 0.208527 0.264729 0.247287
0.187984 0.228682 0.334109 0.249225
0.168217 0.293023 0.327907 0.210853
MOTIF M37 O37
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2537 E= 1337.0e-6
0.255420 0.270792 0.256996 0.216791
0.267639 0.244777 0.265274 0.222310
0.208120 0.245566 0.275916 0.270398
0.238865 0.234529 0.303114 0.223492
0.272763 0.233741 0.278676 0.214821
0.245566 0.211667 0.318092 0.224675
0.239259 0.245566 0.309815 0.205361
0.286165 0.249901 0.247536 0.216397
0.204572 0.257785 0.299172 0.238471
0.181317 0.250690 0.316121 0.251872
0.227040 0.349626 0.139535 0.283800
0.114702 0.190382 0.033110 0.661805
0.016161 0.001182 0.967284 0.015372
0.135199 0.117067 0.002759 0.744974
0.001182 0.001577 0.995664 0.001577
0.000394 0.001971 0.997241 0.000394
0.002759 0.148601 0.206149 0.642491
0.141900 0.300749 0.167127 0.390225
0.327158 0.096571 0.300355 0.275916
0.231770 0.263697 0.324005 0.180528
0.271581 0.238076 0.305479 0.184864
0.259756 0.213638 0.321640 0.204966
0.246748 0.241230 0.292866 0.219156
0.242412 0.232558 0.269216 0.255814
0.236894 0.212456 0.296807 0.253843
0.234135 0.253449 0.273946 0.238471
0.228616 0.248325 0.269610 0.253449
0.248325 0.249113 0.294048 0.208514
0.232164 0.230981 0.301143 0.235711
0.247536 0.255026 0.253055 0.244383
MOTIF M38 O38
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 1105 E= 1337.0e-6
0.219910 0.299548 0.226244 0.254299
0.247964 0.257014 0.274208 0.220814
0.298643 0.273303 0.181900 0.246154
0.221719 0.272398 0.303167 0.202715
0.187330 0.390045 0.247059 0.175566
0.234389 0.244344 0.167421 0.353846
0.166516 0.264253 0.349321 0.219910
0.235294 0.261538 0.279638 0.223529
0.237104 0.256109 0.280543 0.226244
0.225339 0.333937 0.098643 0.342081
0.179186 0.272398 0.164706 0.383710
0.148416 0.343891 0.256109 0.251584
0.053394 0.289593 0.192760 0.464253
0.037104 0.356561 0.442534 0.163801
0.846154 0.016290 0.113122 0.024434
0.025339 0.127602 0.050679 0.796380
0.067873 0.002715 0.032579 0.896833
0.011765 0.019005 0.945701 0.023529
0.006335 0.003620 0.984615 0.005430
0.126697 0.389140 0.065158 0.419005
0.041629 0.372851 0.101357 0.484163
0.295023 0.214480 0.354751 0.135747
0.351131 0.179186 0.292308 0.177376
0.228959 0.209050 0.247059 0.314932
0.244344 0.236199 0.280543 0.238914
0.217195 0.210860 0.269683 0.302262
0.233484 0.214480 0.264253 0.287783
0.228054 0.226244 0.294118 0.251584
0.221719 0.257919 0.315837 0.204525
0.209955 0.264253 0.217195 0.308597
MOTIF M39 O39
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2561 E= 1337.0e-6
0.233893 0.392425 0.185084 0.188598
0.190551 0.294416 0.259274 0.255759
0.230379 0.274502 0.263959 0.231160
0.285826 0.281531 0.249512 0.183132
0.274112 0.236236 0.226084 0.263569
0.188989 0.298711 0.185865 0.326435
0.218665 0.333073 0.264740 0.183522
0.238969 0.237017 0.247169 0.276845
0.319797 0.166341 0.330730 0.183132
0.247560 0.133542 0.447872 0.171027
0.126904 0.557204 0.278016 0.037876
0.176494 0.808278 0.009762 0.005467
0.358454 0.024600 0.502929 0.114018
0.031238 0.281531 0.680984 0.006248
0.570480 0.257712 0.010933 0.160875
0.931277 0.013276 0.005076 0.050371
0.058961 0.015619 0.916829 0.008590
0.293245 0.098009 0.264740 0.344006
0.133932 0.101523 0.616166 0.148380
0.274112 0.110894 0.478719 0.136275
0.212027 0.208903 0.436158 0.142913
0.203827 0.409996 0.181179 0.204998
0.242874 0.250683 0.302616 0.203827
0.174151 0.352987 0.235455 0.237407
0.228426 0.344397 0.193284 0.233893
0.254588 0.316283 0.222179 0.206950
0.208903 0.292464 0.262398 0.236236
0.284654 0.215541 0.215150 0.284654
0.242093 0.211246 0.320187 0.226474
0.275283 0.213198 0.319016 0.192503
MOTIF M40 O40
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2582 E= 1337.0e-6
0.288149 0.283501 0.171572 0.256778
0.238575 0.264524 0.258327 0.238575
0.238575 0.277304 0.233927 0.250194
0.254841 0.273431 0.237413 0.234314
0.258714 0.266460 0.268009 0.206816
0.344694 0.218435 0.214950 0.221921
0.245546 0.258714 0.261425 0.234314
0.259489 0.306739 0.264136 0.169636
0.295895 0.238187 0.225794 0.240124
0.242835 0.292409 0.251743 0.213013
0.302866 0.251743 0.288536 0.156855
0.359799 0.123548 0.374129 0.142525
0.208753 0.348567 0.225019 0.217661
0.063129 0.511619 0.142912 0.282339
0.103796 0.196747 0.065453 0.634005
0.003486 0.580945 0.077847 0.337723
0.995740 0.000775 0.003486 0.000000
0.998451 0.000000 0.001549 0.000000
0.000775 0.001936 0.994191 0.003098
0.463594 0.108830 0.128582 0.298993
0.304415 0.216112 0.237026 0.242448
0.268009 0.232378 0.198683 0.300930
0.111541 0.344307 0.205267 0.338885
0.264524 0.240899 0.201394 0.293184
0.273431 0.235476 0.250581 0.240511
0.258327 0.223083 0.278466 0.240124
0.247483 0.257552 0.260651 0.234314
0.268784 0.243997 0.258327 0.228892
0.235089 0.233153 0.269171 0.262587
0.231603 0.254841 0.237413 0.276143
MOTIF M41 O41
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2581 E= 1337.0e-6
0.225881 0.237505 0.310732 0.225881
0.250291 0.267726 0.229368 0.252615
0.260752 0.274312 0.242542 0.222394
0.314994 0.259977 0.244091 0.180938
0.280511 0.216195 0.292910 0.210384
0.230531 0.277024 0.258427 0.234018
0.243317 0.272762 0.239442 0.244479
0.255715 0.282449 0.190236 0.271600
0.176288 0.303758 0.293297 0.226656
0.213096 0.221232 0.187912 0.377761
0.384347 0.130570 0.338241 0.146842
0.196435 0.028671 0.635800 0.139093
0.173964 0.035645 0.731887 0.058504
0.206122 0.069353 0.694692 0.029833
0.116234 0.369237 0.421155 0.093375
0.812088 0.082914 0.037195 0.067803
0.630763 0.065478 0.246804 0.056955
0.732274 0.019760 0.212321 0.035645
0.043394 0.003487 0.940721 0.012398
0.068191 0.027896 0.829136 0.074777
0.220845 0.213871 0.417668 0.147617
0.181325 0.524990 0.171251 0.122433
0.584270 0.102673 0.148392 0.164665
0.237117 0.168152 0.425029 0.169702
0.168152 0.338628 0.261527 0.231693
0.282449 0.244866 0.273537 0.199148
0.315769 0.214645 0.268113 0.201472
0.307245 0.234018 0.268501 0.190236
0.229756 0.180938 0.405269 0.184037
0.242929 0.277024 0.208834 0.271213
MOTIF M42 O42
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2579 E= 1337.0e-6
0.229934 0.227220 0.368360 0.174486
0.210159 0.170609 0.371074 0.248158
0.221404 0.263668 0.335401 0.179527
0.162854 0.258240 0.449399 0.129508
0.113222 0.127569 0.123304 0.635905
0.256689 0.094223 0.482745 0.166344
0.197751 0.064366 0.625048 0.112834
0.094610 0.112834 0.727801 0.064754
0.086080 0.149670 0.266770 0.497480
0.086080 0.553315 0.274913 0.085692
0.615743 0.158201 0.080264 0.145793
0.103528 0.518418 0.183404 0.194649
0.196976 0.269484 0.252036 0.281504
0.169058 0.198139 0.509888 0.122916
0.067856 0.069019 0.160915 0.702210
0.073672 0.231873 0.616518 0.077937
0.514541 0.263280 0.136875 0.085304
0.054285 0.784413 0.101978 0.059325
0.094223 0.683211 0.028306 0.194261
0.126793 0.562621 0.057387 0.253199
0.543622 0.256301 0.104692 0.095386
0.137650 0.491663 0.226057 0.144630
0.274525 0.236526 0.175262 0.313687
0.245056 0.353625 0.201241 0.200078
0.172160 0.414889 0.238465 0.174486
0.219853 0.284219 0.213261 0.282668
0.250872 0.286545 0.249709 0.212873
0.252036 0.338503 0.197363 0.212098
0.361380 0.262893 0.209383 0.166344
0.321055 0.165568 0.293525 0.219853
MOTIF M43 O43
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2450 E= 1337.0e-6
0.208980 0.238776 0.233878 0.318367
0.235102 0.235102 0.260408 0.269388
0.253878 0.284082 0.221224 0.240816
0.254286 0.322857 0.202449 0.220408
0.218367 0.279592 0.228571 0.273469
0.266122 0.286939 0.222857 0.224082
0.256735 0.258776 0.300408 0.184082
0.293469 0.260000 0.209388 0.237143
0.268980 0.185306 0.337143 0.208571
0.193061 0.213878 0.341633 0.251429
0.357959 0.274694 0.251837 0.115510
0.168163 0.238367 0.108571 0.484898
0.132245 0.119592 0.499592 0.248571
0.497551 0.243673 0.144082 0.114694
0.129388 0.300816 0.556735 0.013061
0.000000 0.001224 0.000816 0.997959
0.001633 0.996735 0.001633 0.000000
0.996735 0.001224 0.000408 0.001633
0.006531 0.277551 0.173469 0.542449
0.244490 0.438367 0.099592 0.217551
0.247755 0.278367 0.285306 0.188571
0.214694 0.327347 0.194286 0.263673
0.184490 0.373469 0.185714 0.256327
0.182041 0.278776 0.220000 0.319184
0.246122 0.264898 0.226531 0.262449
0.172653 0.259592 0.336327 0.231429
0.261224 0.239184 0.256327 0.243265
0.260816 0.256735 0.228980 0.253469
0.271429 0.252245 0.234286 0.242041
0.271020 0.225714 0.189388 0.313878
MOTIF M44 O44
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2582 E= 1337.0e-6
0.290860 0.269946 0.267235 0.171960
0.307901 0.240124 0.259876 0.192099
0.279628 0.200232 0.290860 0.229280
0.315647 0.237026 0.175833 0.271495
0.204493 0.242060 0.297831 0.255616
0.273044 0.281177 0.215337 0.230442
0.208366 0.241286 0.257552 0.292796
0.305964 0.267235 0.182804 0.243997
0.211851 0.327653 0.191712 0.268784
0.216499 0.320682 0.225407 0.237413
0.259489 0.250581 0.184741 0.305190
0.204493 0.321844 0.222696 0.250968
0.271882 0.246708 0.274206 0.207204
0.288149 0.211464 0.327653 0.172734
0.250194 0.239737 0.297444 0.212626
0.269171 0.207204 0.349342 0.174284
0.295895 0.237413 0.274593 0.192099
0.300930 0.209527 0.221921 0.267622
0.216112 0.316809 0.208753 0.258327
0.160341 0.414020 0.289698 0.135941
0.213400 0.054996 0.664214 0.067390
0.879163 0.045314 0.045701 0.029822
0.944617 0.016654 0.033695 0.005035
0.013168 0.030596 0.039892 0.916344
0.101859 0.065453 0.055383 0.777304
0.114640 0.639040 0.092177 0.154144
0.240511 0.173122 0.342758 0.243610
0.285825 0.193648 0.332301 0.188226
0.211851 0.223470 0.327266 0.237413
0.237800 0.238187 0.331139 0.192874
MOTIF M45 O45
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2580 E= 1337.0e-6
0.243023 0.240698 0.297674 0.218605
0.153101 0.247674 0.347674 0.251550
0.272481 0.212016 0.332946 0.182558
0.234109 0.282558 0.286434 0.196899
0.144961 0.214341 0.272868 0.367829
0.071318 0.118992 0.075969 0.733721
0.053876 0.102326 0.048450 0.795349
0.047287 0.682171 0.019380 0.251163
0.620155 0.158527 0.049225 0.172093
0.061628 0.753101 0.084884 0.100388
0.441860 0.042248 0.460853 0.055039
0.044186 0.758140 0.140310 0.057364
0.259690 0.293798 0.078295 0.368217
0.035271 0.144574 0.053876 0.766279
0.087209 0.348837 0.378682 0.185271
0.459302 0.186434 0.203101 0.151163
0.324806 0.277132 0.223256 0.174806
0.166279 0.164341 0.136434 0.532946
0.150000 0.096512 0.405814 0.347674
0.215891 0.370155 0.194961 0.218992
0.320543 0.296512 0.182558 0.200388
0.151163 0.443411 0.168992 0.236434
0.329457 0.231008 0.168992 0.270543
0.202326 0.250388 0.298450 0.248837
0.216667 0.273643 0.268217 0.241473
0.276357 0.193411 0.248062 0.282171
0.208915 0.192636 0.268605 0.329845
0.210853 0.286822 0.214729 0.287597
0.274419 0.213953 0.248837 0.262791
0.191473 0.258915 0.234109 0.315504
MOTIF M46 O46
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2580 E= 1337.0e-6
0.258915 0.252326 0.190310 0.298450
0.237984 0.225969 0.272093 0.263953
0.229845 0.269767 0.240310 0.260078
0.243411 0.260465 0.299225 0.196899
0.243798 0.197287 0.184109 0.374806
0.218217 0.375581 0.167054 0.239147
0.248062 0.372093 0.184884 0.194961
0.243023 0.210078 0.213566 0.333333
0.317829 0.209690 0.187984 0.284496
0.259302 0.294186 0.224031 0.222481
0.207364 0.262016 0.260465 0.270155
0.230233 0.258527 0.186434 0.324806
0.248062 0.321705 0.181395 0.248837
0.268992 0.354264 0.117829 0.258915
0.153488 0.500000 0.127907 0.218605
0.453488 0.162791 0.172481 0.211240
0.044574 0.109302 0.030620 0.815504
0.001550 0.994186 0.003488 0.000775
0.534109 0.146512 0.007752 0.311628
0.712016 0.172481 0.034109 0.081395
0.159302 0.046512 0.069767 0.724419
0.064341 0.809302 0.107752 0.018605
0.571318 0.122868 0.028295 0.277519
0.303101 0.284884 0.127519 0.284496
0.237984 0.386047 0.148837 0.227132
0.241085 0.286822 0.179845 0.292248
0.317054 0.271318 0.198062 0.213566
0.262016 0.264341 0.250000 0.223643
0.300775 0.252326 0.191085 0.255814
0.262403 0.296512 0.187597 0.253488
MOTIF M47 O47
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2578 E= 1337.0e-6
0.240884 0.287044 0.264934 0.207137
0.202483 0.253685 0.282002 0.261831
0.276959 0.222265 0.247867 0.252909
0.198604 0.236230 0.301784 0.263382
0.289372 0.249806 0.248642 0.212180
0.241272 0.242436 0.260667 0.255625
0.261443 0.267261 0.307603 0.163693
0.255625 0.253297 0.283941 0.207137
0.220326 0.217998 0.291699 0.269977
0.232351 0.254849 0.264934 0.247867
0.253685 0.257176 0.249418 0.239721
0.220714 0.244375 0.262219 0.272692
0.293638 0.261055 0.214895 0.230411
0.254849 0.282777 0.195500 0.266874
0.246315 0.332428 0.178821 0.242436
0.257952 0.246703 0.250582 0.244763
0.254849 0.254073 0.264546 0.226532
0.215283 0.270753 0.202870 0.311094
0.296742 0.278510 0.221490 0.203258
0.239721 0.147401 0.363848 0.249030
0.481381 0.034135 0.341738 0.142746
0.123351 0.107836 0.714895 0.053918
0.033359 0.010085 0.940264 0.016292
0.002715 0.012801 0.061676 0.922808
0.003103 0.980993 0.003879 0.012025
0.977114 0.006594 0.008534 0.007758
0.101241 0.233902 0.444919 0.219938
0.205586 0.310706 0.305663 0.178045
0.299457 0.193561 0.287432 0.219550
0.206749 0.197828 0.307991 0.287432
MOTIF M48 O48
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2581 E= 1337.0e-6
0.194498 0.199148 0.339791 0.266563
0.278962 0.291360 0.251453 0.178225
0.296784 0.234405 0.262689 0.206122
0.315769 0.258427 0.225494 0.200310
0.334367 0.197985 0.299884 0.167764
0.249516 0.232855 0.280124 0.237505
0.269275 0.206122 0.309570 0.215033
0.249128 0.191786 0.304921 0.254165
0.189849 0.217358 0.381635 0.211158
0.232081 0.313057 0.227431 0.227431
0.253390 0.241379 0.208059 0.297172
0.223557 0.235180 0.359938 0.181325
0.185200 0.258814 0.392871 0.163115
0.252615 0.181325 0.292522 0.273537
0.321968 0.192948 0.259977 0.225107
0.265014 0.166602 0.311895 0.256490
0.586207 0.101511 0.209996 0.102286
0.328167 0.077877 0.266563 0.327392
0.132507 0.155754 0.603642 0.108098
0.030608 0.017048 0.027896 0.924448
0.367687 0.013561 0.420767 0.197985
0.017823 0.010849 0.963967 0.007361
0.056567 0.077102 0.803952 0.062379
0.041844 0.364200 0.019760 0.574196
0.122046 0.695079 0.084463 0.098411
0.590469 0.158853 0.087176 0.163503
0.271213 0.172414 0.270438 0.285936
0.226269 0.201860 0.369237 0.202635
0.233630 0.271213 0.210771 0.284386
0.203022 0.235568 0.194886 0.366525
MOTIF M49 O49
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2327 E= 1337.0e-6
0.219596 0.437473 0.190374 0.152557
0.270305 0.370434 0.146541 0.212720
0.226902 0.323593 0.225183 0.224323
0.331328 0.256983 0.194671 0.217018
0.209712 0.291362 0.213580 0.285346
0.238934 0.384615 0.205844 0.170606
0.224753 0.630425 0.067039 0.077783
0.120756 0.778685 0.035668 0.064890
0.186076 0.688010 0.031371 0.094542
0.120756 0.737000 0.108294 0.033949
0.356682 0.421573 0.049850 0.171895
0.569403 0.139665 0.170176 0.120756
0.306403 0.503653 0.127202 0.062742
0.184787 0.632574 0.036098 0.146541
0.108724 0.760206 0.047701 0.083369
0.528148 0.172325 0.119467 0.180060
0.176193 0.565535 0.140954 0.117318
0.167598 0.706919 0.059304 0.066180
0.238934 0.625269 0.052858 0.082939
0.279759 0.476150 0.110443 0.133648
0.246670 0.544908 0.129781 0.078642
0.407821 0.340782 0.136227 0.115170
0.269016 0.491620 0.125913 0.113451
0.414267 0.354963 0.096691 0.134078
0.220456 0.480447 0.158573 0.140524
0.348517 0.393210 0.078212 0.180060
0.142243 0.495917 0.149549 0.212291
0.339493 0.278040 0.193812 0.188655
0.235496 0.382467 0.149119 0.232918
0.194671 0.449076 0.126343 0.229910
MOTIF M50 O50
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2578 E= 1337.0e-6
0.376261 0.237781 0.197828 0.188130
0.204422 0.282002 0.316137 0.197440
0.125291 0.368891 0.263770 0.242048
0.136928 0.366175 0.215671 0.281226
0.187742 0.192785 0.245151 0.374321
0.166408 0.050815 0.700931 0.081846
0.129558 0.018619 0.798293 0.053530
0.079131 0.074864 0.753685 0.092320
0.138092 0.052366 0.134600 0.674942
0.098138 0.633825 0.098526 0.169511
0.476338 0.162529 0.162141 0.198991
0.210240 0.326222 0.264934 0.198604
0.191234 0.250194 0.397983 0.160590
0.171839 0.051202 0.612878 0.164081
0.322343 0.034523 0.589992 0.053142
0.093483 0.104732 0.749806 0.051978
0.121024 0.077192 0.164081 0.637704
0.130334 0.169123 0.078355 0.622188
0.122576 0.557021 0.136540 0.183863
0.350272 0.166408 0.316524 0.166796
0.314197 0.231575 0.296354 0.157874
0.277735 0.209465 0.340962 0.171839
0.216059 0.231187 0.311094 0.241660
0.154383 0.375485 0.273856 0.196276
0.200155 0.300233 0.198991 0.300621
0.221490 0.371218 0.288596 0.118697
0.179984 0.222653 0.338247 0.259116
0.323507 0.229247 0.339410 0.107836
0.208689 0.270365 0.362684 0.158262
0.255237 0.181536 0.356866 0.206362
MOTIF M51 O51
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2576 E= 1337.0e-6
0.283773 0.407609 0.095109 0.213509
0.298137 0.221273 0.235248 0.245342
0.364907 0.178960 0.239907 0.216227
0.302795 0.137422 0.299301 0.260481
0.199922 0.236025 0.310559 0.253494
0.277562 0.365295 0.204969 0.152174
0.320264 0.151398 0.096661 0.431677
0.170031 0.268634 0.493012 0.068323
0.494953 0.236413 0.072593 0.196040
0.761646 0.021739 0.100543 0.116071
0.892081 0.018245 0.081910 0.007764
0.001941 0.007376 0.005435 0.985248
0.174689 0.044643 0.013587 0.767081
0.387811 0.132764 0.180901 0.298525
0.161491 0.417702 0.155280 0.265528
0.407997 0.130047 0.128882 0.333075
0.211180 0.298525 0.199922 0.290373
0.350543 0.303183 0.221661 0.124612
0.294643 0.383929 0.168090 0.153339
0.384705 0.222050 0.244953 0.148292
0.196429 0.278339 0.248059 0.277174
0.250000 0.239130 0.269022 0.241848
0.316770 0.125388 0.161102 0.396739
0.276786 0.289208 0.279115 0.154891
0.268634 0.248447 0.156832 0.326087
0.227484 0.164208 0.344332 0.263975
0.284550 0.272516 0.263199 0.179736
0.319488 0.308230 0.200311 0.171972
0.440606 0.150233 0.214674 0.194488
0.302019 0.069099 0.493789 0.135093
MOTIF M52 O52
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 1387 E= 1337.0e-6
0.241528 0.289113 0.227109 0.242249
0.193944 0.310743 0.245133 0.250180
0.203317 0.297765 0.250901 0.248017
0.248017 0.312185 0.209084 0.230714
0.213410 0.289834 0.263158 0.233598
0.098774 0.427541 0.207642 0.266042
0.196107 0.472242 0.162221 0.169430
0.508291 0.105984 0.254506 0.131218
0.003605 0.633021 0.012978 0.350397
0.157174 0.009373 0.012978 0.820476
0.002163 0.000721 0.001442 0.995674
0.000721 0.999279 0.000000 0.000000
0.000000 0.997837 0.000000 0.002163
0.000721 0.040375 0.264600 0.694304
0.027397 0.199712 0.617880 0.155011
0.104542 0.316510 0.149243 0.429704
0.161500 0.286229 0.202596 0.349676
0.149964 0.302812 0.211247 0.335977
0.200433 0.289113 0.251622 0.258832
0.205479 0.263879 0.238645 0.291997
0.195386 0.319394 0.232156 0.253064
0.227830 0.299928 0.228551 0.243691
0.180966 0.284787 0.238645 0.295602
0.218457 0.304254 0.229993 0.247296
0.231435 0.296323 0.243691 0.228551
0.221341 0.266763 0.243691 0.268205
0.218457 0.266042 0.266042 0.249459
0.228551 0.248017 0.260995 0.262437
0.224946 0.267484 0.266763 0.240807
0.216294 0.279019 0.271089 0.233598
MOTIF M53 O53
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2582 E= 1337.0e-6
0.209527 0.306352 0.233927 0.250194
0.271882 0.290085 0.226569 0.211464
0.213013 0.248644 0.159179 0.379163
0.282339 0.262974 0.259489 0.195198
0.235476 0.218823 0.281952 0.263749
0.295120 0.186290 0.297444 0.221146
0.164601 0.348180 0.316421 0.170798
0.198683 0.400077 0.192874 0.208366
0.368319 0.265298 0.112703 0.253679
0.204105 0.322231 0.121998 0.351665
0.181642 0.282727 0.281565 0.254067
0.254841 0.374129 0.189388 0.181642
0.191712 0.202169 0.122386 0.483734
0.201782 0.156855 0.448490 0.192874
0.187452 0.103408 0.453524 0.255616
0.211077 0.367932 0.251356 0.169636
0.359411 0.255229 0.155693 0.229667
0.386135 0.144462 0.257940 0.211464
0.224632 0.564679 0.053834 0.156855
0.052672 0.466305 0.052285 0.428737
0.867932 0.009295 0.119675 0.003098
0.001936 0.006584 0.017816 0.973664
0.427963 0.015492 0.362122 0.194423
0.015879 0.025174 0.891557 0.067390
0.192874 0.213788 0.168087 0.425252
0.320682 0.237413 0.238187 0.203718
0.132843 0.263749 0.260651 0.342758
0.259876 0.326104 0.113091 0.300930
0.254067 0.226569 0.207591 0.311774
0.256778 0.207591 0.239349 0.296282
MOTIF M54 O54
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2581 E= 1337.0e-6
0.243317 0.253003 0.257265 0.246416
0.232468 0.252228 0.217745 0.297559
0.209996 0.237505 0.319644 0.232855
0.215033 0.233630 0.296009 0.255327
0.246029 0.192948 0.261527 0.299496
0.260752 0.194498 0.357613 0.187137
0.385122 0.174738 0.189461 0.250678
0.148780 0.453313 0.256877 0.141031
0.944983 0.003100 0.048818 0.003100
0.000000 0.003100 0.020535 0.976366
0.012398 0.005037 0.144905 0.837660
0.000000 0.000000 1.000000 0.000000
0.342890 0.246804 0.122821 0.287485
0.219295 0.275475 0.409144 0.096087
0.232855 0.258814 0.284773 0.223557
0.298721 0.304921 0.130182 0.266176
0.280511 0.289810 0.141418 0.288260
0.207284 0.286711 0.194886 0.311120
0.278962 0.163890 0.241767 0.315382
0.182487 0.242929 0.341341 0.233243
0.323131 0.205734 0.202635 0.268501
0.231306 0.247966 0.167764 0.352964
0.230143 0.244866 0.313832 0.211158
0.209996 0.253390 0.263851 0.272762
0.301046 0.230918 0.214645 0.253390
0.260752 0.199923 0.318481 0.220845
0.260752 0.230918 0.327005 0.181325
0.294460 0.220070 0.207671 0.277799
0.253003 0.246804 0.309570 0.190624
0.275475 0.237892 0.259589 0.227044
MOTIF M55 O55
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2205 E= 1337.0e-6
0.179138 0.387755 0.207710 0.225397
0.221769 0.292063 0.212245 0.273923
0.201361 0.396825 0.191383 0.210431
0.189569 0.303401 0.225397 0.281633
0.175057 0.323356 0.240816 0.260771
0.221769 0.314286 0.244898 0.219048
0.159637 0.314286 0.206803 0.319274
0.210884 0.269841 0.262585 0.256689
0.206349 0.338776 0.155556 0.299320
0.141497 0.393651 0.179592 0.285261
0.187755 0.370975 0.179138 0.262132
0.182313 0.353288 0.212698 0.251701
0.141950 0.400000 0.198639 0.259410
0.258957 0.244898 0.178231 0.317914
0.194558 0.257143 0.289796 0.258503
0.148753 0.243991 0.301134 0.306122
0.080272 0.580499 0.085714 0.253515
0.027664 0.632653 0.019048 0.320635
0.010884 0.960998 0.003175 0.024943
0.092971 0.839002 0.004989 0.063039
0.169615 0.039002 0.221315 0.570068
0.006803 0.963265 0.017687 0.012245
0.003628 0.974150 0.002721 0.019501
0.017234 0.715193 0.003175 0.264399
0.110658 0.553741 0.054422 0.281179
0.079819 0.657596 0.061678 0.200907
0.189569 0.532880 0.082993 0.194558
0.248073 0.326984 0.153741 0.271202
0.183220 0.381406 0.226757 0.208617
0.181859 0.355102 0.231746 0.231293
MOTIF M56 O56
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 1880 E= 1337.0e-6
0.271809 0.226596 0.271809 0.229787
0.264362 0.254255 0.263830 0.217553
0.303191 0.202128 0.236702 0.257979
0.343617 0.201596 0.244149 0.210638
0.306383 0.220745 0.258511 0.214362
0.303191 0.232447 0.211702 0.252660
0.319681 0.222872 0.231383 0.226064
0.428723 0.168085 0.205851 0.197340
0.514362 0.057979 0.370745 0.056915
0.717021 0.062766 0.198936 0.021277
0.917021 0.017553 0.041489 0.023936
0.718617 0.054787 0.131383 0.095213
0.276064 0.111170 0.538830 0.073936
0.376596 0.120745 0.313298 0.189362
0.232447 0.011702 0.722340 0.033511
0.197340 0.017021 0.767553 0.018085
0.951596 0.019681 0.010638 0.018085
0.943085 0.015426 0.031383 0.010106
0.098404 0.260106 0.604787 0.036702
0.157447 0.247872 0.125532 0.469149
0.360106 0.177660 0.247872 0.214362
0.279255 0.265957 0.287234 0.167553
0.293085 0.217553 0.238830 0.250532
0.245745 0.182447 0.322340 0.249468
0.299468 0.188830 0.267021 0.244681
0.250000 0.217021 0.284043 0.248936
0.265426 0.243085 0.263298 0.228191
0.273404 0.255851 0.256915 0.213830
0.242553 0.246809 0.277128 0.233511
0.271277 0.246809 0.236170 0.245745
MOTIF M57 O57
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 1466 E= 1337.0e-6
0.259891 0.187585 0.319918 0.232606
0.292633 0.209413 0.243520 0.254434
0.375171 0.195771 0.226467 0.202592
0.241473 0.200546 0.251023 0.306958
0.188267 0.239427 0.319918 0.252387
0.300819 0.193042 0.225102 0.281037
0.297408 0.347203 0.167804 0.187585
0.434516 0.059345 0.060709 0.445430
0.084584 0.000682 0.910641 0.004093
0.001364 0.004093 0.991132 0.003411
0.709413 0.122101 0.007503 0.160982
0.972033 0.002729 0.009550 0.015689
0.000682 0.011596 0.012278 0.975443
0.005457 0.100273 0.552524 0.341746
0.104366 0.278990 0.044338 0.572306
0.296726 0.186903 0.302183 0.214188
0.227149 0.239427 0.317190 0.216235
0.257162 0.239427 0.238745 0.264666
0.285812 0.207367 0.246248 0.260573
0.253752 0.215553 0.244884 0.285812
0.258527 0.198499 0.240791 0.302183
0.259209 0.211460 0.251705 0.277626
0.238745 0.241473 0.259891 0.259891
0.295362 0.207367 0.245566 0.251705
0.261255 0.231241 0.244202 0.263302
0.231241 0.248977 0.266030 0.253752
0.257162 0.272169 0.238745 0.231924
0.285130 0.234652 0.253070 0.227149
0.257844 0.255798 0.254434 0.231924
0.259891 0.254434 0.250341 0.235334
MOTIF M58 O58
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2582 E= 1337.0e-6
0.192874 0.276917 0.316421 0.213788
0.276530 0.180480 0.257165 0.285825
0.203718 0.179706 0.510844 0.105732
0.110380 0.203331 0.237026 0.449264
0.152982 0.190550 0.470565 0.185902
0.228505 0.309063 0.229667 0.232765
0.096824 0.749032 0.099535 0.054609
0.049187 0.862897 0.023625 0.064291
0.604957 0.147173 0.061580 0.186290
0.056933 0.129744 0.181255 0.632068
0.410147 0.308288 0.189388 0.092177
0.087529 0.194423 0.257165 0.460883
0.553060 0.211851 0.147947 0.087142
0.134779 0.050736 0.137103 0.677382
0.091402 0.017816 0.827653 0.063129
0.047250 0.082881 0.781565 0.088304
0.196359 0.226956 0.389233 0.187452
0.205267 0.479861 0.189388 0.125484
0.413633 0.267622 0.207591 0.111154
0.142138 0.455074 0.151046 0.251743
0.288923 0.284663 0.195585 0.230829
0.201007 0.304415 0.243222 0.251356
0.244771 0.235864 0.236638 0.282727
0.194423 0.292022 0.261813 0.251743
0.283114 0.252517 0.240511 0.223857
0.163439 0.390395 0.249032 0.197134
0.321456 0.336174 0.159566 0.182804
0.223857 0.281565 0.210689 0.283888
0.255229 0.278079 0.264524 0.202169
0.158404 0.297444 0.246321 0.297831
MOTIF M59 O59
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2574 E= 1337.0e-6
0.210956 0.271173 0.222222 0.295649
0.221445 0.252525 0.231546 0.294483
0.242036 0.318959 0.202409 0.236597
0.260684 0.233489 0.207848 0.297980
0.224942 0.239705 0.256799 0.278555
0.251360 0.271173 0.234654 0.242813
0.281274 0.242813 0.230381 0.245532
0.245532 0.241647 0.297591 0.215229
0.222222 0.239316 0.224165 0.314297
0.344600 0.231546 0.176379 0.247475
0.369075 0.101010 0.298757 0.231158
0.299534 0.189200 0.300699 0.210567
0.595183 0.047009 0.078866 0.278943
0.000000 0.997669 0.001943 0.000389
0.949495 0.001943 0.003108 0.045455
0.998446 0.001166 0.000000 0.000389
0.135587 0.272727 0.018260 0.573427
0.255245 0.199689 0.393162 0.151904
0.173271 0.192696 0.386169 0.247863
0.204740 0.332556 0.258353 0.204351
0.211733 0.353535 0.133256 0.301476
0.218726 0.353535 0.189200 0.238539
0.186480 0.406371 0.196193 0.210956
0.243978 0.286713 0.234266 0.235043
0.278943 0.255633 0.222999 0.242424
0.310412 0.193085 0.288656 0.207848
0.290987 0.221445 0.284771 0.202797
0.288656 0.208236 0.262238 0.240870
0.341103 0.199689 0.274281 0.184926
0.285548 0.259518 0.285936 0.168998
MOTIF M60 O60
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2330 E= 1337.0e-6
0.286695 0.244206 0.209013 0.260086
0.251073 0.236910 0.245494 0.266524
0.243777 0.253648 0.236052 0.266524
0.240343 0.255365 0.242918 0.261373
0.241631 0.273391 0.230472 0.254506
0.219313 0.273820 0.244206 0.262661
0.239914 0.268240 0.249356 0.242489
0.219313 0.283262 0.224034 0.273391
0.251073 0.250215 0.211588 0.287124
0.260944 0.242060 0.215021 0.281974
0.257940 0.248927 0.202146 0.290987
0.278970 0.236052 0.220172 0.264807
0.246352 0.216309 0.231760 0.305579
0.219313 0.254936 0.242060 0.283691
0.229185 0.267382 0.229614 0.273820
0.242489 0.247639 0.241631 0.268240
0.210730 0.220601 0.243777 0.324893
0.125751 0.235193 0.272532 0.366524
0.057511 0.453648 0.220172 0.268670
0.121888 0.420172 0.083262 0.374678
0.474249 0.030043 0.042060 0.453648
0.016738 0.009442 0.003004 0.970815
0.004721 0.006438 0.006009 0.982833
0.031760 0.054506 0.894421 0.019313
0.003004 0.002575 0.010300 0.984120
0.115021 0.194421 0.176395 0.514163
0.169528 0.227468 0.135622 0.467382
0.191416 0.206438 0.173391 0.428755
0.185408 0.250644 0.229614 0.334335
0.249356 0.248498 0.252361 0.249785
MOTIF M61 O61
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 1959 E= 1337.0e-6
0.429811 0.199592 0.134763 0.235835
0.203675 0.467586 0.152629 0.176110
0.186830 0.265442 0.135784 0.411945
0.416539 0.306279 0.145993 0.131189
0.232772 0.377233 0.183257 0.206738
0.326697 0.226136 0.241960 0.205207
0.319551 0.213374 0.169474 0.297601
0.167943 0.325166 0.147524 0.359367
0.323635 0.079632 0.087289 0.509444
0.089842 0.697805 0.104645 0.107708
0.083716 0.774885 0.027055 0.114344
0.070444 0.841246 0.026034 0.062277
0.751914 0.064829 0.081164 0.102093
0.117407 0.301685 0.362940 0.217968
0.542113 0.209290 0.151608 0.096988
0.562532 0.082185 0.264931 0.090352
0.074017 0.057172 0.202144 0.666667
0.049515 0.154671 0.673813 0.122001
0.062277 0.849923 0.058193 0.029607
0.435937 0.315978 0.023992 0.224094
0.157734 0.366514 0.147524 0.328229
0.174579 0.301174 0.140888 0.383359
0.213885 0.120980 0.516080 0.149056
0.259316 0.290454 0.251149 0.199081
0.153139 0.138336 0.450740 0.257785
0.187340 0.289433 0.280755 0.242471
0.266973 0.321593 0.215416 0.196018
0.262889 0.336396 0.204696 0.196018
0.289433 0.201633 0.255232 0.253701
0.221031 0.218479 0.361409 0.199081
MOTIF M62 O62
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2582 E= 1337.0e-6
0.260263 0.281177 0.266847 0.191712
0.268784 0.219210 0.312161 0.199845
0.183966 0.316034 0.286212 0.213788
0.257940 0.254454 0.274593 0.213013
0.167699 0.273431 0.290473 0.268397
0.231216 0.241673 0.319132 0.207978
0.243222 0.286987 0.199070 0.270720
0.252517 0.253679 0.237800 0.256003
0.313323 0.229280 0.199458 0.257940
0.232765 0.207591 0.266847 0.292796
0.192874 0.259489 0.333462 0.214175
0.269558 0.238187 0.291634 0.200620
0.439969 0.141363 0.310612 0.108056
0.130906 0.253679 0.378776 0.236638
0.002324 0.901627 0.086754 0.009295
0.994191 0.000000 0.005809 0.000000
0.003873 0.002324 0.000000 0.993803
0.000000 0.033695 0.965143 0.001162
0.451588 0.269558 0.224245 0.054609
0.144462 0.342758 0.197909 0.314872
0.093338 0.330364 0.271495 0.304802
0.254454 0.295507 0.286600 0.163439
0.315259 0.274981 0.223470 0.186290
0.284276 0.207591 0.228505 0.279628
0.289311 0.305577 0.216886 0.188226
0.259489 0.287374 0.212626 0.240511
0.267622 0.324167 0.173509 0.234702
0.226956 0.307514 0.266073 0.199458
0.203718 0.264136 0.239349 0.292796
0.195198 0.280403 0.271495 0.252905
MOTIF M63 O63
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 1416 E= 1337.0e-6
0.252119 0.266243 0.220339 0.261299
0.250706 0.253531 0.245763 0.250000
0.255650 0.247175 0.249294 0.247881
0.242938 0.252119 0.223870 0.281073
0.226695 0.228107 0.266949 0.278249
0.255650 0.258475 0.236582 0.249294
0.233051 0.255650 0.226695 0.284605
0.261299 0.234463 0.238701 0.265537
0.265537 0.250000 0.246469 0.237994
0.310734 0.239407 0.215395 0.234463
0.286017 0.237288 0.188559 0.288136
0.283192 0.242232 0.219633 0.254944
0.259887 0.247175 0.208333 0.284605
0.281780 0.230932 0.210452 0.276836
0.218927 0.288136 0.235876 0.257062
0.234463 0.299435 0.171610 0.294492
0.526836 0.069209 0.274011 0.129944
0.362994 0.507062 0.127119 0.002825
0.973870 0.004944 0.019774 0.001412
0.013418 0.004944 0.002825 0.978814
0.187147 0.010593 0.142655 0.659605
0.004944 0.994350 0.000706 0.000000
0.003531 0.992938 0.000000 0.003531
0.531073 0.054379 0.066384 0.348164
0.250706 0.148305 0.341102 0.259887
0.296610 0.231638 0.195621 0.276130
0.239407 0.298023 0.263418 0.199153
0.290254 0.244350 0.208333 0.257062
0.236582 0.235169 0.218927 0.309322
0.273305 0.232345 0.222458 0.271893
MOTIF M64 O64
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2561 E= 1337.0e-6
0.225693 0.260836 0.254979 0.258493
0.219055 0.280750 0.265131 0.235064
0.231941 0.243264 0.249512 0.275283
0.230379 0.283483 0.234674 0.251464
0.222179 0.324483 0.209293 0.244045
0.292464 0.247560 0.227645 0.232331
0.281921 0.237798 0.226865 0.253417
0.217103 0.304178 0.218274 0.260445
0.273721 0.260445 0.206950 0.258883
0.264740 0.195236 0.246779 0.293245
0.143303 0.427177 0.237407 0.192112
0.359625 0.220226 0.140961 0.279188
0.229988 0.339711 0.341663 0.088637
0.027724 0.965638 0.000781 0.005857
0.982819 0.014447 0.001562 0.001171
0.000000 0.004686 0.002343 0.992971
0.000000 1.000000 0.000000 0.000000
0.232331 0.268645 0.037485 0.461538
0.085513 0.349082 0.240922 0.324483
0.167513 0.274893 0.167903 0.389692
0.242483 0.215931 0.206950 0.334635
0.216322 0.262788 0.264740 0.256150
0.264740 0.252636 0.229988 0.252636
0.253026 0.245217 0.245217 0.256540
0.263569 0.290512 0.197579 0.248340
0.258883 0.254588 0.223741 0.262788
0.237407 0.280750 0.206950 0.274893
0.266302 0.250683 0.196798 0.286216
0.233503 0.279969 0.242874 0.243655
0.227255 0.248340 0.239750 0.284654
MOTIF M65 O65
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2363 E= 1337.0e-6
0.278036 0.252222 0.255184 0.214558
0.249683 0.236987 0.280576 0.232755
0.252645 0.249259 0.251799 0.246297
0.245874 0.241219 0.244604 0.268303
0.244181 0.263648 0.236564 0.255607
0.222598 0.273381 0.241219 0.262802
0.253068 0.276344 0.252222 0.218366
0.238680 0.264494 0.248836 0.247990
0.248836 0.269149 0.242912 0.239103
0.246297 0.245028 0.217097 0.291579
0.228523 0.238256 0.296657 0.236564
0.251375 0.232332 0.225561 0.290732
0.241219 0.240796 0.260262 0.257723
0.269996 0.214135 0.270842 0.245028
0.258993 0.225561 0.261109 0.254338
0.283115 0.175624 0.162928 0.378333
0.074058 0.478206 0.170123 0.277613
0.009733 0.305544 0.008464 0.676259
0.005925 0.016081 0.051629 0.926365
0.001270 0.002116 0.994922 0.001693
0.000846 0.000846 0.992806 0.005501
0.121033 0.857385 0.012273 0.009310
0.388066 0.219213 0.096488 0.296234
0.163352 0.373254 0.302158 0.161236
0.236987 0.317816 0.264494 0.180702
0.239103 0.248413 0.348286 0.164198
0.280999 0.181549 0.309776 0.227677
0.172662 0.263225 0.286077 0.278036
0.162505 0.469319 0.108337 0.259839
0.161236 0.529412 0.140923 0.168430
MOTIF M66 O66
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2563 E= 1337.0e-6
0.245025 0.278970 0.255950 0.220055
0.199766 0.315256 0.242294 0.242684
0.267265 0.230589 0.243855 0.258291
0.241124 0.221615 0.314085 0.223176
0.183769 0.251268 0.300429 0.264534
0.240734 0.296528 0.238783 0.223956
0.217714 0.247757 0.263363 0.271167
0.226297 0.253219 0.290285 0.230199
0.236832 0.223566 0.293406 0.246196
0.207959 0.295747 0.251658 0.244635
0.207179 0.299259 0.250098 0.243465
0.247757 0.307452 0.184940 0.259852
0.220835 0.290675 0.270386 0.218104
0.247757 0.229419 0.287944 0.234881
0.256340 0.220445 0.357394 0.165821
0.209520 0.324229 0.209910 0.256340
0.211081 0.420211 0.166602 0.202107
0.286773 0.284822 0.197425 0.230979
0.128755 0.342177 0.213812 0.315256
0.153726 0.401483 0.315646 0.129146
0.017558 0.040968 0.008974 0.932501
0.030433 0.013656 0.952400 0.003512
0.880609 0.083496 0.030043 0.005853
0.034725 0.891533 0.008584 0.065158
0.031994 0.904019 0.008974 0.055014
0.081935 0.358174 0.054233 0.505657
0.147874 0.368318 0.154116 0.329692
0.188451 0.291065 0.236832 0.283652
0.227468 0.287554 0.283652 0.201327
0.207959 0.313305 0.259462 0.219274
MOTIF M67 O67
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 1927 E= 1337.0e-6
0.261028 0.245978 0.239751 0.253243
0.269331 0.248573 0.224183 0.257914
0.211728 0.253243 0.276077 0.258952
0.270887 0.243902 0.236118 0.249092
0.226777 0.250649 0.231448 0.291126
0.228334 0.268293 0.270368 0.233005
0.262065 0.278672 0.237675 0.221588
0.252206 0.241827 0.258433 0.247535
0.263103 0.269331 0.229372 0.238194
0.225221 0.247016 0.282823 0.244940
0.261028 0.224183 0.251168 0.263622
0.289050 0.200311 0.263103 0.247535
0.270368 0.187338 0.251687 0.290607
0.223664 0.292164 0.221069 0.263103
0.258433 0.291645 0.235080 0.214842
0.612351 0.064349 0.221069 0.102231
0.574468 0.112610 0.127660 0.185262
0.371043 0.280747 0.257395 0.090815
0.987545 0.001557 0.010379 0.000519
0.009341 0.005708 0.007784 0.977167
0.004670 0.004670 0.986508 0.004152
0.015049 0.008303 0.945511 0.031136
0.233524 0.569279 0.034769 0.162429
0.206539 0.139076 0.416191 0.238194
0.160353 0.160353 0.489881 0.189414
0.280747 0.405293 0.142190 0.171770
0.245978 0.271406 0.228853 0.253762
0.264141 0.256876 0.252206 0.226777
0.233524 0.293721 0.237675 0.235080
0.226777 0.309289 0.264660 0.199273
MOTIF M68 O68
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2563 E= 1337.0e-6
0.192743 0.255170 0.293796 0.258291
0.304331 0.225127 0.239563 0.230979
0.169723 0.278970 0.310574 0.240734
0.223176 0.200546 0.326570 0.249707
0.239563 0.162310 0.318377 0.279750
0.426453 0.183769 0.264924 0.124854
0.152946 0.582911 0.187671 0.076473
0.345298 0.428404 0.150995 0.075302
0.067109 0.008584 0.893484 0.030823
0.008974 0.008584 0.978151 0.004292
0.976200 0.013656 0.006633 0.003512
0.834959 0.023020 0.055794 0.086227
0.529848 0.059696 0.357394 0.053063
0.089739 0.363636 0.180258 0.366368
0.274678 0.206399 0.310574 0.208350
0.354272 0.203668 0.281311 0.160749
0.179867 0.236832 0.356223 0.227078
0.219274 0.246196 0.307842 0.226687
0.227468 0.234491 0.277409 0.260632
0.245025 0.198205 0.312915 0.243855
0.207959 0.239173 0.249707 0.303160
0.265314 0.298869 0.205228 0.230589
0.298478 0.257511 0.221615 0.222396
0.327741 0.198205 0.282091 0.191963
0.256340 0.254780 0.267265 0.221615
0.239953 0.239563 0.248147 0.272337
0.266875 0.269606 0.255560 0.207959
0.258291 0.256340 0.232150 0.253219
0.265314 0.228248 0.241904 0.264534
0.239173 0.230979 0.335544 0.194304
MOTIF M69 O69
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 1660 E= 1337.0e-6
0.263253 0.231928 0.260241 0.244578
0.242771 0.252410 0.251205 0.253614
0.254819 0.272892 0.259036 0.213253
0.277108 0.221687 0.248795 0.252410
0.245181 0.250602 0.241566 0.262651
0.245783 0.237952 0.243373 0.272892
0.239759 0.246988 0.247590 0.265663
0.251205 0.236145 0.260241 0.252410
0.255422 0.281928 0.228313 0.234337
0.250000 0.228313 0.245181 0.276506
0.246988 0.248795 0.277108 0.227108
0.231928 0.261446 0.269880 0.236747
0.251807 0.225904 0.274096 0.248193
0.263855 0.207229 0.250000 0.278916
0.257831 0.251205 0.321084 0.169880
0.018675 0.093976 0.013253 0.874096
0.001807 0.000000 0.833735 0.164458
0.703614 0.209639 0.003012 0.083735
0.237349 0.214458 0.434940 0.113253
0.000000 0.003012 0.000602 0.996386
0.005422 0.992771 0.001205 0.000602
0.931928 0.002410 0.060843 0.004819
0.091566 0.337349 0.237952 0.333133
0.225904 0.353012 0.156024 0.265060
0.256627 0.262651 0.231928 0.248795
0.240361 0.280120 0.222289 0.257229
0.214458 0.292169 0.225904 0.267470
0.247590 0.230120 0.246386 0.275904
0.246386 0.263253 0.225904 0.264458
0.273494 0.259639 0.227711 0.239157
MOTIF M70 O70
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2581 E= 1337.0e-6
0.266176 0.228981 0.279349 0.225494
0.256877 0.206509 0.262689 0.273925
0.285161 0.232855 0.207671 0.274312
0.271988 0.236343 0.240217 0.251453
0.223169 0.185200 0.325843 0.265788
0.276637 0.275862 0.252228 0.195273
0.282836 0.233243 0.213483 0.270438
0.254940 0.306083 0.157691 0.281286
0.336304 0.283611 0.199923 0.180163
0.336304 0.218520 0.221620 0.223557
0.270050 0.239055 0.232081 0.258814
0.254165 0.204184 0.209221 0.332429
0.233243 0.240217 0.254940 0.271600
0.310732 0.171639 0.220845 0.296784
0.259977 0.203022 0.222782 0.314219
0.268113 0.187912 0.278962 0.265014
0.219682 0.280899 0.330492 0.168927
0.308020 0.292522 0.183262 0.216195
0.668346 0.127857 0.075552 0.128245
0.935296 0.000387 0.059667 0.004649
0.000000 1.000000 0.000000 0.000000
0.265788 0.018210 0.050368 0.665633
0.000000 0.000387 0.996900 0.002712
0.187912 0.498256 0.054630 0.259202
0.297559 0.411856 0.014723 0.275862
0.340178 0.267338 0.116234 0.276250
0.248353 0.161953 0.269275 0.320418
0.242154 0.335529 0.227044 0.195273
0.289810 0.208446 0.193723 0.308020
0.186749 0.249128 0.158078 0.406044
MOTIF M71 O71
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2576 E= 1337.0e-6
0.287655 0.264752 0.227484 0.220109
0.218556 0.230978 0.313276 0.237189
0.213898 0.289596 0.211180 0.285326
0.292314 0.220109 0.227873 0.259705
0.233307 0.239907 0.307842 0.218944
0.315994 0.222826 0.238742 0.222438
0.248059 0.231366 0.287267 0.233307
0.285714 0.314053 0.186724 0.213509
0.243401 0.315217 0.197205 0.244177
0.215450 0.241848 0.379658 0.163043
0.149845 0.201475 0.320264 0.328416
0.411879 0.164208 0.289596 0.134317
0.292702 0.314441 0.348214 0.044643
0.140916 0.098214 0.006211 0.754658
0.007376 0.002717 0.002329 0.987578
0.000776 0.003106 0.003882 0.992236
0.000000 0.992236 0.001553 0.006211
0.190217 0.748059 0.027950 0.033773
0.136258 0.389363 0.065606 0.408773
0.134705 0.307065 0.166925 0.391304
0.278727 0.217391 0.128494 0.375388
0.118789 0.299301 0.210016 0.371894
0.197981 0.301630 0.248447 0.251941
0.227484 0.263199 0.289984 0.219332
0.237189 0.248447 0.265528 0.248835
0.191770 0.243789 0.274845 0.289596
0.206134 0.226708 0.315994 0.251165
0.258929 0.246894 0.246506 0.247671
0.207686 0.335016 0.230202 0.227096
0.261258 0.277174 0.213121 0.248447
MOTIF M72 O72
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 1635 E= 1337.0e-6
0.297859 0.204893 0.275229 0.222018
0.284404 0.195107 0.285627 0.234862
0.248930 0.159633 0.293578 0.297859
0.457492 0.201223 0.321101 0.020183
0.001835 0.001223 0.004893 0.992049
0.002446 0.009174 0.003058 0.985321
0.100917 0.003058 0.615902 0.280122
0.101529 0.743731 0.052599 0.102141
0.436086 0.144343 0.300917 0.118654
0.283180 0.360245 0.053211 0.303364
0.529052 0.444037 0.012844 0.014067
0.985321 0.001223 0.013456 0.000000
0.102752 0.276453 0.239144 0.381651
0.273394 0.284404 0.192049 0.250153
0.221407 0.238532 0.234862 0.305199
0.239144 0.272171 0.184709 0.303976
0.286850 0.220795 0.266055 0.226300
0.240367 0.245872 0.261162 0.252599
0.228135 0.264832 0.222630 0.284404
0.250153 0.309480 0.203670 0.236697
0.294190 0.247706 0.212232 0.245872
0.269725 0.215291 0.266667 0.248318
0.249541 0.208563 0.270336 0.271560
0.251988 0.280734 0.200000 0.267278
0.235474 0.228746 0.243425 0.292355
0.226911 0.238532 0.258104 0.276453
0.248318 0.214067 0.288073 0.249541
0.264220 0.196330 0.257492 0.281957
0.228746 0.300917 0.250765 0.219572
0.256881 0.233028 0.204281 0.305810
MOTIF M73 O73
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2470 E= 1337.0e-6
0.204049 0.280162 0.257085 0.258704
0.220648 0.288664 0.246964 0.243725
0.255870 0.260324 0.195951 0.287854
0.289069 0.267206 0.243725 0.200000
0.164777 0.443725 0.118219 0.273279
0.202429 0.280972 0.136437 0.380162
0.113765 0.539676 0.047368 0.299190
0.948178 0.008097 0.017409 0.026316
0.000810 0.992713 0.000000 0.006478
0.008907 0.981781 0.002429 0.006883
0.005668 0.009312 0.012551 0.972470
0.089474 0.043725 0.692308 0.174494
0.128745 0.246964 0.300810 0.323482
0.282186 0.287449 0.229150 0.201215
0.248583 0.244130 0.246964 0.260324
0.231579 0.211741 0.250202 0.306478
0.259109 0.265182 0.230769 0.244939
0.218623 0.294737 0.228745 0.257895
0.233198 0.262753 0.252632 0.251417
0.263563 0.221457 0.246964 0.268016
0.236032 0.238462 0.269636 0.255870
0.212955 0.252227 0.252632 0.282186
0.268826 0.225101 0.211336 0.294737
0.231984 0.259109 0.226721 0.282186
0.218219 0.263563 0.229555 0.288664
0.250202 0.250607 0.231174 0.268016
0.216599 0.277328 0.227935 0.278138
0.240486 0.259514 0.261538 0.238462
0.212146 0.281781 0.255870 0.250202
0.231579 0.247368 0.261943 0.259109
MOTIF M74 O74
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2579 E= 1337.0e-6
0.213649 0.274525 0.231097 0.280729
0.177976 0.322606 0.207832 0.291586
0.179139 0.305157 0.282668 0.233036
0.235363 0.304769 0.261729 0.198139
0.277239 0.289647 0.208608 0.224506
0.303606 0.197751 0.284219 0.214424
0.374952 0.126793 0.343156 0.155099
0.088794 0.762699 0.128344 0.020163
0.010857 0.980225 0.003490 0.005428
0.827840 0.014734 0.037611 0.119814
0.004653 0.690190 0.227608 0.077549
0.333075 0.260178 0.373401 0.033346
0.168282 0.045366 0.032183 0.754168
0.013571 0.008530 0.960450 0.017449
0.091508 0.164017 0.584723 0.159752
0.218689 0.244668 0.293912 0.242730
0.219077 0.191547 0.383870 0.205506
0.212485 0.229159 0.316014 0.242342
0.274137 0.286933 0.214036 0.224893
0.219077 0.268709 0.306320 0.205894
0.226444 0.280729 0.271811 0.221016
0.246219 0.231485 0.286157 0.236138
0.231485 0.223342 0.314851 0.230322
0.245444 0.206669 0.278790 0.269097
0.212098 0.238852 0.280729 0.268321
0.186119 0.252036 0.290423 0.271423
0.204731 0.290810 0.267933 0.236526
0.209383 0.251260 0.314463 0.224893
0.196200 0.324544 0.265607 0.213649
0.293137 0.243893 0.249709 0.213261
MOTIF M75 O75
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2417 E= 1337.0e-6
0.253620 0.267687 0.290856 0.187836
0.252379 0.266032 0.232520 0.249069
0.214315 0.242863 0.274721 0.268101
0.200662 0.270583 0.258171 0.270583
0.216798 0.251138 0.275548 0.256516
0.211833 0.222590 0.276789 0.288788
0.233761 0.268101 0.314853 0.183285
0.221763 0.227555 0.347538 0.203144
0.241208 0.273066 0.248242 0.237484
0.276789 0.261895 0.245759 0.215556
0.269342 0.236657 0.321887 0.172114
0.256516 0.289201 0.265205 0.189077
0.164667 0.338850 0.320232 0.176252
0.300786 0.298304 0.175424 0.225486
0.323128 0.216798 0.200662 0.259412
0.122880 0.094332 0.647911 0.134878
0.082747 0.027720 0.846918 0.042615
0.108399 0.017377 0.799338 0.074886
0.364088 0.042201 0.539926 0.053786
0.599917 0.168391 0.126603 0.105089
0.384361 0.106330 0.148118 0.361192
0.118329 0.147704 0.187422 0.546545
0.052958 0.616467 0.035168 0.295408
0.064129 0.869259 0.019859 0.046752
0.041374 0.870087 0.024824 0.063715
0.140670 0.681837 0.076541 0.100952
0.282995 0.183285 0.218866 0.314853
0.239967 0.190732 0.282582 0.286719
0.162185 0.357468 0.324783 0.155565
0.169218 0.270583 0.281754 0.278444
MOTIF M76 O76
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 1422 E= 1337.0e-6
0.261603 0.251758 0.283404 0.203235
0.211674 0.262307 0.286217 0.239803
0.241913 0.187764 0.371308 0.199015
0.231364 0.199015 0.369902 0.199719
0.317862 0.161041 0.302391 0.218706
0.054852 0.649789 0.109001 0.186357
0.336850 0.246835 0.203938 0.212377
0.177215 0.088608 0.185654 0.548523
0.014065 0.011955 0.964135 0.009845
0.063291 0.466948 0.045710 0.424051
0.179325 0.457806 0.100563 0.262307
0.116737 0.416315 0.200422 0.266526
0.277778 0.251758 0.319972 0.150492
0.297468 0.109705 0.441632 0.151195
0.453586 0.049226 0.404360 0.092827
0.004923 0.972574 0.008439 0.014065
0.395218 0.200422 0.063994 0.340366
0.094233 0.120956 0.131505 0.653305
0.034459 0.015471 0.939522 0.010549
0.104079 0.457806 0.037975 0.400141
0.182841 0.466948 0.109001 0.241210
0.138537 0.336146 0.195499 0.329817
0.242616 0.239100 0.308720 0.209564
0.213783 0.252461 0.275668 0.258087
0.282700 0.253868 0.282700 0.180731
0.261603 0.232068 0.277075 0.229255
0.252461 0.240506 0.255977 0.251055
0.260900 0.252461 0.247539 0.239100
0.202532 0.285513 0.242616 0.269339
0.227848 0.280591 0.260197 0.231364
MOTIF M77 O77
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 1229 E= 1337.0e-6
0.212368 0.227828 0.363710 0.196094
0.227014 0.261188 0.243287 0.268511
0.273393 0.219691 0.306753 0.200163
0.277461 0.192840 0.320586 0.209113
0.296176 0.255492 0.253051 0.195281
0.183076 0.310822 0.323027 0.183076
0.360456 0.280716 0.165175 0.193653
0.362897 0.187144 0.192840 0.257120
0.013832 0.017087 0.900732 0.068348
0.002441 0.010578 0.983727 0.003255
0.003255 0.005696 0.797396 0.193653
0.341741 0.009764 0.591538 0.056957
0.379170 0.329536 0.126119 0.165175
0.287225 0.033360 0.037429 0.641985
0.121237 0.117168 0.152970 0.608625
0.041497 0.301058 0.046379 0.611066
0.086249 0.829943 0.009764 0.074044
0.028478 0.829943 0.021155 0.120423
0.326282 0.325468 0.172498 0.175753
0.298617 0.168430 0.382425 0.150529
0.192840 0.201790 0.362897 0.242474
0.196908 0.274207 0.349878 0.179007
0.183889 0.248983 0.218877 0.348251
0.181448 0.281530 0.285598 0.251424
0.217250 0.265256 0.274207 0.243287
0.262002 0.227828 0.286412 0.223759
0.213995 0.323841 0.236778 0.225386
0.195281 0.311635 0.259561 0.233523
0.335232 0.237592 0.198535 0.228641
0.247356 0.257933 0.292107 0.202604
MOTIF M78 O78
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2582 E= 1337.0e-6
0.270720 0.237413 0.209140 0.282727
0.241286 0.204880 0.219210 0.334624
0.312161 0.198683 0.213788 0.275368
0.338110 0.202556 0.284663 0.174671
0.329589 0.194810 0.273431 0.202169
0.305577 0.277304 0.182417 0.234702
0.056545 0.020914 0.139040 0.783501
0.760651 0.039117 0.049574 0.150658
0.030209 0.084818 0.049574 0.835399
0.929512 0.055771 0.001936 0.012781
0.721921 0.041828 0.074748 0.161503
0.785438 0.038730 0.087142 0.088691
0.357475 0.053834 0.394268 0.194423
0.179318 0.182417 0.429899 0.208366
0.214175 0.341596 0.309450 0.134779
0.225794 0.441131 0.190163 0.142912
0.198296 0.362122 0.215724 0.223857
0.182417 0.282727 0.292022 0.242835
0.204880 0.197134 0.331526 0.266460
0.176995 0.188613 0.384198 0.250194
0.269946 0.248257 0.208753 0.273044
0.337723 0.204493 0.180480 0.277304
0.269171 0.229667 0.259489 0.241673
0.258327 0.211851 0.216499 0.313323
0.305577 0.194423 0.262974 0.237026
0.260651 0.207978 0.317196 0.214175
0.256778 0.175445 0.325329 0.242448
0.266460 0.238187 0.222696 0.272657
0.252517 0.280790 0.240124 0.226569
0.280403 0.209140 0.223857 0.286600
MOTIF M79 O79
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2580 E= 1337.0e-6
0.259302 0.246512 0.222093 0.272093
0.256202 0.248062 0.229457 0.266279
0.271318 0.217442 0.217054 0.294186
0.183721 0.331008 0.251163 0.234109
0.294961 0.316667 0.225969 0.162403
0.317829 0.220155 0.227519 0.234496
0.294961 0.273643 0.264341 0.167054
0.194574 0.355039 0.083721 0.366667
0.246124 0.041085 0.308140 0.404651
0.102713 0.438372 0.005039 0.453876
0.000000 0.999612 0.000000 0.000388
0.000000 0.000000 0.000000 1.000000
0.000000 0.000388 0.000388 0.999225
0.431395 0.034884 0.533333 0.000388
0.271318 0.193411 0.307364 0.227907
0.329070 0.209690 0.361628 0.099612
0.218217 0.228295 0.344961 0.208527
0.183721 0.357364 0.206202 0.252713
0.230620 0.246899 0.236434 0.286047
0.238760 0.271705 0.246512 0.243023
0.223643 0.250000 0.223256 0.303101
0.208527 0.313953 0.213178 0.264341
0.276357 0.210853 0.229845 0.282946
0.279457 0.204264 0.260465 0.255814
0.253488 0.205039 0.302326 0.239147
0.248062 0.245736 0.258527 0.247674
0.270543 0.203488 0.310853 0.215116
0.276357 0.203101 0.279070 0.241473
0.247287 0.202326 0.316667 0.233721
0.268992 0.236434 0.232946 0.261628
MOTIF M80 O80
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2581 E= 1337.0e-6
0.272375 0.198373 0.287485 0.241767
0.194111 0.304146 0.311895 0.189849
0.238667 0.220070 0.242929 0.298334
0.300271 0.184812 0.345990 0.168927
0.325068 0.206897 0.304921 0.163115
0.281286 0.212321 0.320806 0.185587
0.245641 0.184425 0.335916 0.234018
0.290585 0.334367 0.208059 0.166990
0.222394 0.215033 0.285548 0.277024
0.340953 0.048818 0.415343 0.194886
0.115072 0.088725 0.676869 0.119334
0.079427 0.001937 0.915149 0.003487
0.001937 0.006587 0.988377 0.003100
0.001937 0.028671 0.022084 0.947307
0.087176 0.128632 0.118946 0.665246
0.179388 0.086401 0.239442 0.494769
0.091825 0.750484 0.104223 0.053468
0.563348 0.081751 0.192948 0.161953
0.180163 0.259589 0.409144 0.151104
0.176676 0.349477 0.206122 0.267726
0.263464 0.188687 0.310732 0.237117
0.236343 0.230918 0.236343 0.296397
0.213871 0.227819 0.331267 0.227044
0.197598 0.265014 0.258040 0.279349
0.218520 0.304921 0.197598 0.278962
0.234793 0.246416 0.284386 0.234405
0.260364 0.286711 0.248741 0.204184
0.205347 0.344053 0.271213 0.179388
0.259202 0.290585 0.231693 0.218520
0.270438 0.230918 0.242154 0.256490
MOTIF M81 O81
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2561 E= 1337.0e-6
0.208903 0.294416 0.260836 0.235845
0.208122 0.306130 0.281140 0.204608
0.225303 0.197970 0.284264 0.292464
0.256540 0.288559 0.280359 0.174541
0.256150 0.291292 0.260445 0.192112
0.210855 0.222960 0.258883 0.307302
0.159313 0.356111 0.183913 0.300664
0.190941 0.327997 0.263959 0.217103
0.334635 0.247560 0.248731 0.169075
0.381101 0.103866 0.365873 0.149160
0.103085 0.060133 0.691527 0.145256
0.091371 0.144865 0.672784 0.090980
0.115580 0.183913 0.139008 0.561499
0.054276 0.662632 0.170246 0.112847
0.404139 0.261226 0.185084 0.149551
0.152675 0.562671 0.121437 0.163217
0.198360 0.370949 0.245998 0.184693
0.250293 0.147599 0.400625 0.201484
0.096837 0.126904 0.100351 0.675908
0.081609 0.087075 0.791488 0.039828
0.704803 0.090590 0.132761 0.071847
0.058961 0.802421 0.083952 0.054666
0.074971 0.839906 0.017962 0.067161
0.076142 0.262788 0.062866 0.598204
0.119875 0.210074 0.324483 0.345568
0.148770 0.295588 0.322140 0.233503
0.225693 0.256931 0.342054 0.175322
0.267864 0.326435 0.182351 0.223350
0.148380 0.354549 0.253417 0.243655
0.174932 0.281140 0.228817 0.315111
MOTIF M82 O82
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 2582 E= 1337.0e-6
0.313323 0.244384 0.188226 0.254067
0.303641 0.212239 0.150658 0.333462
0.194810 0.332688 0.315259 0.157242
0.273819 0.207978 0.275755 0.242448
0.398916 0.058095 0.243610 0.299380
0.061580 0.100697 0.798606 0.039117
0.337723 0.158404 0.230829 0.273044
0.623160 0.105732 0.163439 0.107668
0.018590 0.806352 0.124322 0.050736
0.656468 0.152595 0.048025 0.142912
0.139427 0.331526 0.212626 0.316421
0.181642 0.376840 0.288536 0.152982
0.300542 0.183966 0.356700 0.158792
0.108443 0.036406 0.088691 0.766460
0.048412 0.114253 0.805577 0.031758
0.137103 0.148335 0.104957 0.609605
0.299768 0.247483 0.166538 0.286212
0.046088 0.765686 0.125484 0.062742
0.328815 0.291247 0.070488 0.309450
0.355538 0.218823 0.227343 0.198296
0.161115 0.298218 0.359411 0.181255
0.280015 0.128195 0.234702 0.357088
0.297831 0.197521 0.231991 0.272657
0.216499 0.341596 0.260263 0.181642
0.260263 0.274981 0.280015 0.184741
0.280790 0.180868 0.149884 0.388459
0.151820 0.332688 0.348180 0.167312
0.279241 0.158017 0.284276 0.278466
0.332301 0.205655 0.209915 0.252130
0.156081 0.358637 0.345469 0.139814
MOTIF M83 O83
letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 1142 E= 1337.0e-6
0.245184 0.257443 0.232049 0.265324
0.258319 0.230298 0.2311
gitextract_w7jltlhp/
├── DanQ-JASPAR_test.py
├── DanQ-JASPAR_train.py
├── DanQ_test.py
├── DanQ_train.py
├── JASPAR_CORE_2016_vertebrates.npy
├── LICENSE
├── README.md
├── aucs.txt
├── data/
│ ├── README.md
│ └── example.h5
├── motifs/
│ ├── DanQ-JASPAR.meme
│ ├── DanQ-JASPAR_TOMTOM/
│ │ ├── tomtom.html
│ │ ├── tomtom.txt
│ │ └── tomtom.xml
│ ├── DanQ.meme
│ ├── DanQ_TOMTOM/
│ │ ├── tomtom.html
│ │ ├── tomtom.txt
│ │ └── tomtom.xml
│ ├── DeepSEA.meme
│ └── DeepSEA_TOMTOM/
│ ├── tomtom.html
│ ├── tomtom.txt
│ └── tomtom.xml
├── variant_resources/
│ ├── GRASP/
│ │ ├── model.0
│ │ ├── model.1
│ │ ├── model.2
│ │ ├── model.3
│ │ ├── model.4
│ │ ├── model.5
│ │ ├── model.6
│ │ ├── model.7
│ │ ├── model.8
│ │ ├── model.9
│ │ └── scaler.pkl
│ └── GWAS/
│ ├── model.0
│ ├── model.1
│ ├── model.2
│ ├── model.3
│ ├── model.4
│ ├── model.5
│ ├── model.6
│ ├── model.7
│ ├── model.8
│ ├── model.9
│ └── scaler.pkl
└── weights/
└── README.md
Copy disabled (too large)
Download .json
Condensed preview — 45 files, each showing path, character count, and a content snippet. Download the .json file for the full structured content (33,226K chars).
[
{
"path": "DanQ-JASPAR_test.py",
"chars": 1891,
"preview": "import sys\nimport numpy as np\nimport h5py\nimport scipy.io\nnp.random.seed(1337) # for reproducibility\n\nfrom keras.preproc"
},
{
"path": "DanQ-JASPAR_train.py",
"chars": 3201,
"preview": "import numpy as np\nimport h5py\nimport scipy.io\nnp.random.seed(1337) # for reproducibility\n\nfrom keras.preprocessing impo"
},
{
"path": "DanQ_test.py",
"chars": 1902,
"preview": "import sys\nimport numpy as np\nimport h5py\nimport scipy.io\nnp.random.seed(1337) # for reproducibility\n\nfrom keras.preproc"
},
{
"path": "DanQ_train.py",
"chars": 2450,
"preview": "import numpy as np\nimport h5py\nimport scipy.io\nnp.random.seed(1337) # for reproducibility\n\nfrom keras.preprocessing impo"
},
{
"path": "LICENSE",
"chars": 172,
"preview": "DanQ is freely available for all non-commercial applications. If you are planning on using DanQ in a commercial applicat"
},
{
"path": "README.md",
"chars": 4549,
"preview": "README for DanQ\n===============\nDanQ is a hybrid convolutional and recurrent neural network model for predicting the fun"
},
{
"path": "aucs.txt",
"chars": 87652,
"preview": "Cell Type\tTF/DNase/HistoneMark\tTreatment\tDeepSEA ROC AUC\tDanQ ROC AUC\tDanQ-JASPAR ROC AUC\tDeepSEA PR AUC\tDanQ PR AUC\tDan"
},
{
"path": "data/README.md",
"chars": 134,
"preview": "Put .mat files here. You can download them from [DeepSEA] (http://deepsea.princeton.edu/media/code/deepsea_train_bundle."
},
{
"path": "motifs/DanQ-JASPAR.meme",
"chars": 1194881,
"preview": "MEME version 4.9.0\n\nALPHABET= ACGT\n\nstrands: + -\n\nBackground letter frequencies (from uniform background):\nA 0.25000 C 0"
},
{
"path": "motifs/DanQ-JASPAR_TOMTOM/tomtom.html",
"chars": 3556167,
"preview": "<!DOCTYPE HTML>\n<html>\n <head>\n <meta charset=\"UTF-8\">\n <title>TOMTOM</title>\n <script>\n // @JSON_VAR dat"
},
{
"path": "motifs/DanQ-JASPAR_TOMTOM/tomtom.txt",
"chars": 244090,
"preview": "#Query ID\tTarget ID\tOptimal offset\tp-value\tE-value\tq-value\tOverlap\tQuery consensus\tTarget consensus\tOrientation\nM0\tMA000"
},
{
"path": "motifs/DanQ-JASPAR_TOMTOM/tomtom.xml",
"chars": 3209934,
"preview": "<?xml version='1.0' encoding='UTF-8' standalone='yes'?>\n<tomtom version=\"4.11.0\" release=\"Thu Nov 26 17:48:49 2015 +1000"
},
{
"path": "motifs/DanQ.meme",
"chars": 327225,
"preview": "MEME version 4.9.0\n\nALPHABET= ACGT\n\nstrands: + -\n\nBackground letter frequencies (from uniform background):\nA 0.25000 C 0"
},
{
"path": "motifs/DanQ_TOMTOM/tomtom.html",
"chars": 1207916,
"preview": "<!DOCTYPE HTML>\n<html>\n <head>\n <meta charset=\"UTF-8\">\n <title>TOMTOM</title>\n <script>\n // @JSON_VAR dat"
},
{
"path": "motifs/DanQ_TOMTOM/tomtom.txt",
"chars": 71202,
"preview": "#Query ID\tTarget ID\tOptimal offset\tp-value\tE-value\tq-value\tOverlap\tQuery consensus\tTarget consensus\tOrientation\nM1\tMA013"
},
{
"path": "motifs/DanQ_TOMTOM/tomtom.xml",
"chars": 962148,
"preview": "<?xml version='1.0' encoding='UTF-8' standalone='yes'?>\n<tomtom version=\"4.11.0\" release=\"Thu Nov 26 17:48:49 2015 +1000"
},
{
"path": "motifs/DeepSEA.meme",
"chars": 119608,
"preview": "MEME version 4.9.0\n\nALPHABET= ACGT\n\nstrands: + -\n\nBackground letter frequencies (from uniform background):\nA 0.25000 C 0"
},
{
"path": "motifs/DeepSEA_TOMTOM/tomtom.html",
"chars": 727110,
"preview": "<!DOCTYPE html PUBLIC \"-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN\" \"http://www.w3.org/TR/html4/loose.dtd\">\n<html>\n<head>\n<me"
},
{
"path": "motifs/DeepSEA_TOMTOM/tomtom.txt",
"chars": 9034,
"preview": "#Query ID\tTarget ID\tOptimal offset\tp-value\tE-value\tq-value\tOverlap\tQuery consensus\tTarget consensus\tOrientation\nM24\tElf5"
},
{
"path": "motifs/DeepSEA_TOMTOM/tomtom.xml",
"chars": 290451,
"preview": "<?xml version='1.0' encoding='UTF-8' standalone='yes'?>\n<!DOCTYPE tomtom[\n<!ELEMENT tomtom (model, targets, queries, run"
},
{
"path": "variant_resources/GRASP/model.0",
"chars": 1320313,
"preview": "booster[0]:\n0:[f1840<-0.808398] yes=1,no=2,missing=1\n\t1:[f934<-0.188076] yes=3,no=4,missing=3\n\t\t3:[f945<-0.168299] yes=7"
},
{
"path": "variant_resources/GRASP/model.1",
"chars": 1302893,
"preview": "booster[0]:\n0:[f1840<-0.779371] yes=1,no=2,missing=1\n\t1:[f934<-0.181909] yes=3,no=4,missing=3\n\t\t3:[f945<-0.168299] yes=7"
},
{
"path": "variant_resources/GRASP/model.2",
"chars": 1310640,
"preview": "booster[0]:\n0:[f1840<-0.780661] yes=1,no=2,missing=1\n\t1:[f934<-0.179496] yes=3,no=4,missing=3\n\t\t3:[f946<-0.222536] yes=7"
},
{
"path": "variant_resources/GRASP/model.3",
"chars": 1307978,
"preview": "booster[0]:\n0:[f1840<-0.813559] yes=1,no=2,missing=1\n\t1:[f934<-0.197479] yes=3,no=4,missing=3\n\t\t3:[f945<-0.167952] yes=7"
},
{
"path": "variant_resources/GRASP/model.4",
"chars": 1312833,
"preview": "booster[0]:\n0:[f1840<-0.813559] yes=1,no=2,missing=1\n\t1:[f945<-0.161486] yes=3,no=4,missing=3\n\t\t3:[f934<-0.157959] yes=7"
},
{
"path": "variant_resources/GRASP/model.5",
"chars": 1311000,
"preview": "booster[0]:\n0:[f1840<-0.778726] yes=1,no=2,missing=1\n\t1:[f934<-0.190811] yes=3,no=4,missing=3\n\t\t3:[f945<-0.168065] yes=7"
},
{
"path": "variant_resources/GRASP/model.6",
"chars": 1309109,
"preview": "booster[0]:\n0:[f1840<-0.779371] yes=1,no=2,missing=1\n\t1:[f934<-0.185161] yes=3,no=4,missing=3\n\t\t3:[f945<-0.167947] yes=7"
},
{
"path": "variant_resources/GRASP/model.7",
"chars": 1316175,
"preview": "booster[0]:\n0:[f1840<-0.780661] yes=1,no=2,missing=1\n\t1:[f934<-0.197475] yes=3,no=4,missing=3\n\t\t3:[f945<-0.158198] yes=7"
},
{
"path": "variant_resources/GRASP/model.8",
"chars": 1310790,
"preview": "booster[0]:\n0:[f1840<-0.779371] yes=1,no=2,missing=1\n\t1:[f934<-0.183896] yes=3,no=4,missing=3\n\t\t3:[f945<-0.157858] yes=7"
},
{
"path": "variant_resources/GRASP/model.9",
"chars": 1323823,
"preview": "booster[0]:\n0:[f1840<-0.779371] yes=1,no=2,missing=1\n\t1:[f934<-0.197484] yes=3,no=4,missing=3\n\t\t3:[f945<-0.158129] yes=7"
},
{
"path": "variant_resources/GRASP/scaler.pkl",
"chars": 118483,
"preview": "ccopy_reg\n_reconstructor\np0\n(csklearn.preprocessing.data\nStandardScaler\np1\nc__builtin__\nobject\np2\nNtp3\nRp4\n(dp5\nS'scale_"
},
{
"path": "variant_resources/GWAS/model.0",
"chars": 392895,
"preview": "booster[0]:\n0:[f1840<-0.633802] yes=1,no=2,missing=1\n\t1:[f946<-0.205518] yes=3,no=4,missing=3\n\t\t3:[f992<-0.198476] yes=7"
},
{
"path": "variant_resources/GWAS/model.1",
"chars": 402429,
"preview": "booster[0]:\n0:[f1840<-0.57101] yes=1,no=2,missing=1\n\t1:[f934<-0.192903] yes=3,no=4,missing=3\n\t\t3:[f992<-0.181971] yes=7,"
},
{
"path": "variant_resources/GWAS/model.2",
"chars": 401278,
"preview": "booster[0]:\n0:[f1840<-0.628035] yes=1,no=2,missing=1\n\t1:[f945<-0.126815] yes=3,no=4,missing=3\n\t\t3:[f992<-0.109293] yes=7"
},
{
"path": "variant_resources/GWAS/model.3",
"chars": 398096,
"preview": "booster[0]:\n0:[f1840<-0.57101] yes=1,no=2,missing=1\n\t1:[f1763<-0.157382] yes=3,no=4,missing=3\n\t\t3:[f945<-0.0233977] yes="
},
{
"path": "variant_resources/GWAS/model.4",
"chars": 395281,
"preview": "booster[0]:\n0:[f1840<-0.726068] yes=1,no=2,missing=1\n\t1:[f948<-0.148655] yes=3,no=4,missing=3\n\t\t3:[f945<-0.1233] yes=7,n"
},
{
"path": "variant_resources/GWAS/model.5",
"chars": 404278,
"preview": "booster[0]:\n0:[f1840<-0.571651] yes=1,no=2,missing=1\n\t1:[f946<-0.208634] yes=3,no=4,missing=3\n\t\t3:[f1305<-0.23993] yes=7"
},
{
"path": "variant_resources/GWAS/model.6",
"chars": 401592,
"preview": "booster[0]:\n0:[f1840<-0.628035] yes=1,no=2,missing=1\n\t1:[f946<-0.196131] yes=3,no=4,missing=3\n\t\t3:[f934<-0.187873] yes=7"
},
{
"path": "variant_resources/GWAS/model.7",
"chars": 391511,
"preview": "booster[0]:\n0:[f1840<-0.628035] yes=1,no=2,missing=1\n\t1:[f923<-0.0781963] yes=3,no=4,missing=3\n\t\t3:[f1840<-0.800393] yes"
},
{
"path": "variant_resources/GWAS/model.8",
"chars": 404237,
"preview": "booster[0]:\n0:[f1840<-0.727349] yes=1,no=2,missing=1\n\t1:[f955<-0.166895] yes=3,no=4,missing=3\n\t\t3:[f535<2.61452] yes=7,n"
},
{
"path": "variant_resources/GWAS/model.9",
"chars": 404534,
"preview": "booster[0]:\n0:[f1840<-0.727349] yes=1,no=2,missing=1\n\t1:[f923<-0.183092] yes=3,no=4,missing=3\n\t\t3:[f945<-0.0234361] yes="
},
{
"path": "variant_resources/GWAS/scaler.pkl",
"chars": 118312,
"preview": "ccopy_reg\n_reconstructor\np0\n(csklearn.preprocessing.data\nStandardScaler\np1\nc__builtin__\nobject\np2\nNtp3\nRp4\n(dp5\nS'scale_"
},
{
"path": "weights/README.md",
"chars": 230,
"preview": "Put .hdf5 weight files here. You can download weights for the [DanQ] (https://cbcl.ics.uci.edu/public_data/DanQ/DanQ_bes"
}
]
// ... and 2 more files (download for full content)
About this extraction
This page contains the full source code of the uci-cbcl/DanQ GitHub repository, extracted and formatted as plain text for AI agents and large language models (LLMs). The extraction includes 45 files (28.0 MB), approximately 7.3M tokens. Use this with OpenClaw, Claude, ChatGPT, Cursor, Windsurf, or any other AI tool that accepts text input. You can copy the full output to your clipboard or download it as a .txt file.
Extracted by GitExtract — free GitHub repo to text converter for AI. Built by Nikandr Surkov.