gitextract_658abc0k/

├── .appveyor.yml
├── .github/
│   ├── linters/
│   │   └── .python-lint
│   └── workflows/
│       ├── pylint.yml
│       ├── pytest.yml
│       └── python-publish.yml
├── .gitignore
├── .pre-commit-config.yaml
├── .travis.yml
├── CLAUDE.md
├── CONTRIBUTING.md
├── LICENSE
├── MANIFEST.in
├── README.md
├── development/
│   ├── README.md
│   ├── docker-compose.yml
│   ├── eg_sshd/
│   │   ├── .ssh/
│   │   │   ├── id_rsa
│   │   │   ├── id_rsa.pub
│   │   │   └── known_hosts
│   │   └── Dockerfile
│   ├── install_sos_notebook.sh
│   └── sos_notebook_test/
│       ├── .ssh/
│       │   ├── id_rsa
│       │   ├── id_rsa.pub
│       │   └── known_hosts
│       └── Dockerfile
├── pyproject.toml
├── setup.py.old
├── src/
│   └── sos_notebook/
│       ├── __init__.py
│       ├── _version.py
│       ├── comm_manager.py
│       ├── completer.py
│       ├── converter.py
│       ├── inspector.py
│       ├── install.py
│       ├── install_sos_notebook.sh
│       ├── kernel.py
│       ├── magics.py
│       ├── step_executor.py
│       ├── subkernel.py
│       ├── templates/
│       │   ├── README.md
│       │   ├── sos-cm/
│       │   │   ├── conf.json
│       │   │   ├── index.html.j2
│       │   │   ├── parts/
│       │   │   │   ├── cm.tpl
│       │   │   │   └── sos-mode.js
│       │   │   └── sos-cm.html.j2
│       │   ├── sos-cm-toc/
│       │   │   ├── conf.json
│       │   │   ├── index.html.j2
│       │   │   ├── parts/
│       │   │   │   └── toc.tpl
│       │   │   └── sos-cm-toc.html.j2
│       │   ├── sos-full/
│       │   │   ├── conf.json
│       │   │   ├── index.html.j2
│       │   │   ├── parts/
│       │   │   │   ├── preview.tpl
│       │   │   │   └── sos_style.tpl
│       │   │   └── sos-full.html.j2
│       │   ├── sos-full-toc/
│       │   │   ├── conf.json
│       │   │   ├── index.html.j2
│       │   │   ├── parts/
│       │   │   │   └── toc.tpl
│       │   │   └── sos-full-toc.html.j2
│       │   ├── sos-lab-cm/
│       │   │   ├── conf.json
│       │   │   ├── index.html.j2
│       │   │   ├── parts/
│       │   │   │   ├── cm.tpl
│       │   │   │   └── sos-mode.js
│       │   │   └── sos-lab-cm.html.j2
│       │   ├── sos-lab-full/
│       │   │   ├── conf.json
│       │   │   ├── index.html.j2
│       │   │   ├── parts/
│       │   │   │   ├── preview.tpl
│       │   │   │   └── sos_style.tpl
│       │   │   ├── sos-lab-full.html.j2
│       │   │   └── static/
│       │   │       ├── index.css
│       │   │       ├── theme-dark.css
│       │   │       └── theme-light.css
│       │   ├── sos-lab-report-only/
│       │   │   ├── conf.json
│       │   │   ├── index.html.j2
│       │   │   └── sos-lab-report-only.html.j2
│       │   ├── sos-markdown/
│       │   │   ├── conf.json
│       │   │   ├── index.md.j2
│       │   │   └── sos-markdown.md.j2
│       │   ├── sos-report/
│       │   │   ├── conf.json
│       │   │   ├── index.html.j2
│       │   │   ├── parts/
│       │   │   │   └── control_panel.tpl
│       │   │   └── sos-report.html.j2
│       │   ├── sos-report-only/
│       │   │   ├── conf.json
│       │   │   ├── index.html.j2
│       │   │   └── sos-report-only.html.j2
│       │   ├── sos-report-only-toc/
│       │   │   ├── conf.json
│       │   │   ├── index.html.j2
│       │   │   ├── parts/
│       │   │   │   └── toc.tpl
│       │   │   └── sos-report-only-toc.html.j2
│       │   ├── sos-report-toc/
│       │   │   ├── conf.json
│       │   │   ├── index.html.j2
│       │   │   ├── parts/
│       │   │   │   └── toc.tpl
│       │   │   └── sos-report-toc.html.j2
│       │   ├── sos-report-toc-v2/
│       │   │   ├── conf.json
│       │   │   ├── index.html.j2
│       │   │   ├── parts/
│       │   │   │   └── toc.tpl
│       │   │   └── sos-report-toc-v2.html.j2
│       │   ├── sos-report-v1/
│       │   │   ├── conf.json
│       │   │   ├── index.html.j2
│       │   │   ├── parts/
│       │   │   │   └── control_panel_v1.tpl
│       │   │   └── sos-report-v1.html.j2
│       │   └── sos-report-v2/
│       │       ├── conf.json
│       │       ├── index.html.j2
│       │       ├── parts/
│       │       │   └── control_panel.tpl
│       │       └── sos-report-v2.html.j2
│       ├── test_utils.py
│       └── workflow_executor.py
├── tasks.py
└── test/
    ├── __init__.py
    ├── build_test_docker.sh
    ├── conftest.py
    ├── sample_notebook.ipynb
    ├── sample_papermill_notebook.ipynb
    ├── sample_workflow.ipynb
    ├── test_convert.py
    ├── test_magics.py
    └── test_workflow.py