gitextract_89rlsmzs/

├── .gitignore
├── CHANGELOG.md
├── LICENSE
├── README.md
├── docs/
│   ├── Makefile
│   ├── make.bat
│   ├── notebooks/
│   │   └── metatime_annotator.ipynb
│   ├── requirements.txt
│   └── source/
│       ├── conf.py
│       ├── index.rst
│       ├── metatime.rst
│       ├── modules.rst
│       └── read.rst
├── environment.yaml
├── metatime/
│   ├── __init__.py
│   ├── annotator.py
│   ├── config.py
│   ├── dmec.py
│   ├── loaddata.py
│   ├── mecmapper.py
│   ├── mecs.py
│   ├── plmapper.py
│   └── pretrained/
│       └── mec/
│           ├── MeC_allgene_average-weights.tsv
│           ├── MeC_anno.tsv
│           ├── MeC_anno_name.tsv
│           ├── MeC_topgene.tsv
│           └── comp_cluster_labels.tsv
└── setup.py